建立条件性敲除小鼠模型
评估 CD11b+ 细胞中 Piezo1 缺失对肿瘤免疫的影响
将 Piezo1fl/fl 小鼠与 CD11b-Cre 小鼠杂交,生成 CD11b-conditional Piezo1 敲除(cKO)小鼠,并通过 PCR 基因分型。
Piezo1 deletion enhances cross-priming of CD8+ T cells by tumor-infiltrating CD11b+ dendritic cells
包含基因敲除小鼠模型、正交肿瘤模型、T细胞耗竭、单细胞转录组学及体外DC-T细胞共培养等多层级功能与机制验证。
CD11b-conditional Piezo1 knockout (CD11b cKO) 小鼠 RMS 76–9 小鼠胚胎性横纹肌肉瘤原位移植模型 OT-I 转基因T细胞受体小鼠 OT-II 转基因T细胞受体小鼠
CD11b-conditional Piezo1 敲除鼠(CD11b-Cre 与 Piezo1fl/fl 杂交) RMS 76–9 细胞原位接种剂量 (1×10^4 或 1×10^5 细胞) 及终点评估 CD8+ T 细胞耗竭实验 (抗CD8 克隆 2.43,100 µg 腹腔注射) 体外 DC 与 OT-I/OT-II T 细胞共培养,使用 300 ng/mL OVA 包被乳胶珠或 0.01 µM 肽段 单细胞 RNA 测序分析肿瘤浸润免疫细胞
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估 CD11b+ 细胞中 Piezo1 缺失对肿瘤免疫的影响
将 Piezo1fl/fl 小鼠与 CD11b-Cre 小鼠杂交,生成 CD11b-conditional Piezo1 敲除(cKO)小鼠,并通过 PCR 基因分型。
检测 Piezo1 缺失对肿瘤生长和转移的影响
将 RMS 76–9 细胞原位注射至小鼠右侧腓肠肌,定期测量肿瘤大小,终点时称重并分析肺转移。
评估肿瘤引流淋巴结、脾脏和肿瘤内免疫细胞组成
通过流式细胞术分析肿瘤、淋巴结、脾脏中的 DC 亚群和 T 细胞亚群,包括 CD11b+ DC、CD8+ T 细胞等。
验证 CD8+ T 细胞在抗肿瘤反应中的关键作用
在肿瘤接种前和接种后给予 CD11b cKO 小鼠 αCD4 或 αCD8 单克隆抗体,比较肿瘤生长。
揭示 Piezo1 缺失对肿瘤浸润免疫细胞转录组的影响
对肿瘤组织进行单细胞 RNA 测序,分析 DC 和 CD8+ T 细胞的基因表达差异和通路富集。
直接验证 Piezo1 缺失的 CD11b+ DC 的抗原摄取和交叉呈递能力
分离脾脏 cDC2A 细胞,用荧光珠或 OVA 包被乳胶珠脉冲,与 OT-I 或 OT-II T 细胞共培养,检测 T 细胞活化和细胞因子产生。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | Corning | 10-040-CV |
| 胎牛血清 | GeminiBio | 100-700 | |
| 青霉素-链霉素 | Corning | 30-002 | |
| L-谷氨酰胺 | Corning | 25-005 | |
| 非必需氨基酸 | Corning | 25-025 | |
| 支原体去除试剂 | Invivogen | ant-mpt | |
| 动物实验 | Hank's平衡盐溶液 | VWR | 02-0121-0500 |
| 30G胰岛素注射器 | BD | 328280 | |
| 组织消化 | 胶原酶D | Worthington Biochemical | LS004182 |
| DNase I | Roche | 04716728001 | |
| ACK裂解缓冲液 | Gibco | A1049201 | |
| 胶原酶II | Fisher Scientific | 17-101-015 | |
| 分散酶II | Fisher Scientific | 17-105-041 | |
| 流式细胞术 | 抗小鼠CD16/32抗体 | BioLegend | 101301 |
| Zombie NIR 可固定活力染料 | BioLegend | 423105 | |
| Zombie Green 可固定活力染料 | BioLegend | 423111 | |
| eBioscience FOXP3/转录因子染色缓冲液套装 | Invitrogen | 00-5523-00 | |
| 抗CD3e抗体(克隆145-2C11) | BD Pharmingen | 553058 | |
| 莫能菌素 | BioLegend | 420701 | |
| Cyto-Fast 固定/破膜缓冲液套装 | BioLegend | 426803 | |
| CytoFLEX流式细胞仪 | Beckman Coulter | -- | |
| FlowJo软件 | BD | -- | |
| RNA提取与qPCR | TRIzol试剂 | Invitrogen | 15596026 |
| High-Capacity cDNA逆转录试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 4368814 | |
| qPCR | TaqMan通用PCR预混液试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 4304437 |
| Bio-Rad CFX96实时荧光定量PCR仪 | Bio-Rad | -- | |
| 蛋白阵列 | Proteome Profiler 小鼠XL细胞因子阵列 | R&D Systems | ARY028 |
| T细胞共培养 | CD4+ DC分选试剂盒 | Miltenyi Biotec | 130-091-262 |
| 初始CD8a+ T细胞分选试剂盒 | Miltenyi Biotec | 130-096-543 | |
| CD4+ T细胞分选试剂盒 | Miltenyi Biotec | 130-104-453 | |
| CFSE(羧基荧光素二醋酸盐琥珀酰亚胺酯) | BioLegend | 423801 | |
| OVA包被乳胶珠 | Polysciences | 19814-15 | |
| 卵清蛋白 | Worthington Biochemical | LS003054 | |
| OVA257-264肽 | InvivoGen | vac-sin | |
| OVA323-339肽 | InvivoGen | vac-sin | |
| 组织染色 | 伊红 | Epredia | 71204 |
| Tris-EDTA缓冲液pH 7.6 | Thermo Scientific | BP2475-500 | |
| DAB底物 | Vector Laboratory | SK-4100 | |
| Permount封片剂 | Fisher Scientific | SP15-500 | |
| PhenoImager | Akoya Biosciences | -- | |
| Hamamatsu NanoZoomer S60 | Hamamatsu | -- | |
| 单细胞RNA测序 | Chromium Next GEM单细胞固定RNA样本制备试剂盒 | 10x Genomics | 1000414 |
| 用于多重样本的Chromium固定RNA分析试剂盒 | 10x Genomics | PN | |
| LabChip GXII HT | PerkinElmer | -- | |
| Qubit荧光定量仪 | Thermo Fisher | -- | |
| Illumina NovaSeq 6000 | Illumina | -- | |
| CellRanger分析流程 | 10x Genomics | -- | |
| 荧光珠摄取实验 | Fluoresbrite羧基荧光微球 | Polysciences | 17797-1 |
| 数据分析 | GraphPad Prism | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 小鼠模型 | CD11b-Cre 和 Piezo1fl/fl 品系;杂交方式;性别(雄性);年龄(8-14周) 阅读提示:Methods: Mice |
| 肿瘤注射 | 细胞接种量(1×10^4或1×10^5);注射体积(50μL);注射部位(右侧腓肠肌);终点标准(肿瘤体积约2000mm³) 阅读提示:Methods: In vivo tumor models; Figure 1 legend |
| T细胞耗竭 | 抗体(αCD4克隆GK1.5或αCD8克隆2.43);剂量(100μg);给药时间(接种前-3、-1天,接种后1、7、14天) 阅读提示:Methods: In vivo tumor models; Figure 3 legend |
| 流式细胞术 | 抗体克隆及稀释度;染色时间温度;死活染料使用;固定方案 阅读提示:Methods: Flow cytometry; 补充表S2 |
| DC-T细胞共培养 | DC和T细胞比例(5×10^4 DC: 2×10^5 T细胞);抗原浓度(300 ng/mL OVA珠或0.01 μM肽);共培养时间(72小时);阅读条件 阅读提示:Methods: T-cell co-culture experiments; Figure 6 图注 |
| 单细胞RNA测序 | 组织固定和保存;10x Genomics 建库方案;测序深度;数据过滤参数(min_genes=200,min_counts=1000,pct_mito<25%) 阅读提示:Methods: Single-cell RNA sequencing; scRNA-Seq analysis |