基因编辑是对基因组进行定点修饰,它是研究基因功能的重要手段。目前,常用的基因编辑器为 CRISPR-Cas9 系统。CRISPR-Cas9 系统经过近十年的发展,已经在 g RNA、PAM、单碱基编辑或者是多碱基编辑都有突破性的进展,但是想要真正做到特定碱基的任意变换,还是比较困难。
2019 年哈佛大学的 David Liu 教授团队在 CRISPR 基础上开发了对活的生物体做精确基因编辑的方法——Prime editing。从理论上讲,Prime editing 编辑能够实现现今所有编辑器的编辑效果。
Prime editing
Prime editing 是在传统的 CRISPR/Cas9 基础上优化的技术,Prime editing 由两部分组成,一是 nCas9 和改造的逆转录酶融合构成的效应蛋白——Cas9-逆转录酶,其二是 pegRNA。与普通的 gRNA 不同,这种 pegRNA 不但能够结合想要进行编辑的特定DNA 区域,还自带“逆转录模板”。Cas9-逆转录酶会在 pegRNA 的引导下,精准地切开靶标 DNA 单链,然后根据“逆转录模板”,合成含有正确序列的 DNA。细胞内的 DNA 修复机制会自动把这段新合成的序列整合进基因组。

图源网络丨Prime Editing原理
Prime Editing 技术非常精确,它能够执行高度指定的删除、插入和碱基交换功能。与 CRISPR 技术下的其他技术最大的不同之处在于:不产生 DNA 双链断裂(DBS),也不需要 DNA 模板,就可以非常容易实现定向编辑。
Prime Editing 的优势:
(1)效率较高:比HDR效率高,理想情况下,可以达到30-40%的编辑效率。
(2)可以做较多种类的编辑:基因点突变、基因插入、基因敲除。
(3)极大减少了脱靶率
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