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嵌合抗原受体（CAR）T 细胞在肿瘤微环境中的功能障碍，是其治疗实体瘤效果不佳的主要障碍。

同步放化疗仍是不可切除局部晚期食管鳞状细胞癌的标准治疗方案，但患者的生存预后仍较差。

调节性 T 细胞（Treg）可在恶劣的肿瘤微环境（TME）中存活增殖，从而抑制抗肿瘤免疫应答。肿瘤微环境中的慢性应激会抑制经典的帽依赖型翻译（CDT），该过程会损伤效应 T 细胞的功能，却不会影响调节性 T 细胞的存活。死亡相关蛋白 5（DAP5 / 真核翻译起始因子 4G2）作为一种非经典的翻译支架蛋白，已有研究表明其可在体外促进人调节性 T 细胞的分化，但其在胸腺来源调节性 T 细胞的发育、外周调节性 T 细胞的稳态维持，以及肿瘤浸润性调节性 T 细胞（ti-Treg）存活能力调控中的作用仍不明确。

非酒精性脂肪肝（NAFLD）影响着全球四分之一的普通人群，在重度肥胖患者中尤为高发。该病以肝细胞内脂质堆积为主要特征，是一个动态进展的过程。随着脂质沉积的增多，会加重肝细胞的血液学损伤，引发氧化应激、线粒体损伤，并促使炎症因子释放。 很多研究强调了非酒精性脂肪肝（NAFLD）与肝脂质滴自噬失调及线粒体功能异常之间的密切关联。然而，缺氧条件下脂质滴自噬与线粒体功能之间复杂的相互作用在很大程度上仍是未知领域。

近三十年来，β淀粉样蛋白（Aβ）沉积作为阿尔茨海默病（AD）核心病理特征，始终是疾病干预的关键靶点，基于 Aβ 免疫的治疗策略（含主动免疫与被动免疫）在多项临床试验中展现出降低脑内 Aβ 负荷、延缓认知功能衰退的潜力。利用β淀粉样蛋白（Aβ）免疫的阿尔茨海默病（AD）疗法在临床试验中已显示出潜力。然而，免疫后AD大脑中驱动Aβ清除的机制仍不明确。这些问题严重制约了免疫疗法的优化与疗效提升。

经过雄激素受体（AR）通路抑制剂的广泛治疗后，晚期前列腺癌（PCa）常出现治疗抵抗。在这些去势抵抗性前列腺癌（CRPC）中，约 20% 会发生转分化，至少部分呈现神经内分泌（NE）相关的组织学和分子特征，因此被称为神经内分泌前列腺癌（NEPC）。其临床预后极差，且目前除铂类化疗外缺乏有效治疗手段，亟需明确其转化机制并开发靶向疗法。

表观遗传机制失调在大脑发育和疾病中起着关键作用。大量新兴证据表明，表观遗传读取蛋白 —— 活化 C 激酶受体 7（RACK7）可能参与大脑发育和神经发育疾病的调控，但相关体内研究仍较为缺乏。

腱鞘巨细胞瘤（TGCT）又称色素绒毛结节性滑膜炎，是罕见的增生性间叶性肿瘤，累及骨骼、滑膜等关节相关组织，分为局限型（L-TGCT）和弥漫型（D-TGCT）两个亚型。但前者性质更具侵袭性，复发率更高，导致患者预后更差。TGCT 发病机制与分子特征不明，两亚型肿瘤微环境等关键问题未厘清，缺乏相关细胞系和动物模型，制约研究与靶点验证。

糖尿病肾病（DN）是 1 型和 2 型糖尿病（T1DM 和 T2DM）常见的并发症，也是全球终末期肾病的首要病因。糖尿病肾病（DN） 的特征是肾小球基底膜（GBM）增厚，这主要是由于足细胞胞外基质（ECM）中 IV 型胶原蛋白（COL4）异常蓄积所致。足细胞的内吞作用对维持 COL4 平衡和 GBM 完整性至关重要。目前的治疗策略强调严格控制RAAS以及使用SGLT2抑制剂，但糖尿病肾病的发病机制仍不明确，尚未开发出根治性疗法 。

脑转移（BrM）长期以来被认为是癌症相关死亡的主要原因，约30%的晚期实体恶性肿瘤患者会发生脑转移。然而，随着癌症患者生存期的延长和整体预后的改善，脑转移发生率呈现上升趋势。尽管临床采用手术切除、放射治疗、化学治疗、免疫治疗及靶向治疗等综合治疗手段，脑转移患者的生存预后仍然不容乐观。

人类皮肤利什曼病（CL）以慢性皮肤病变为特征。免疫检查点（ICs）在疾病结局中起着至关重要的作用，细胞介导的免疫是主要保护机制，但过度或持续的效应 T 细胞反应会导致组织损伤。目前对免疫检查点在慢性感染或癌症相关复杂空间微环境中的调节机制了解较少，虽已知多种细胞因子等可诱导 IDO1 和 PD-L1 表达，但在慢性感染的复杂空间微环境中其调控机制尚不明确。

新辅助化疗（NAC）在口腔鳞状细胞癌（OSCC）的治疗中愈发重要，但其对口腔鳞状细胞癌免疫表型的影响尚不明确。本研究旨在评估新辅助化疗对口腔鳞状细胞癌患者的作用，并明确新辅助化疗前后肿瘤标本中免疫检查点及肿瘤相关免疫细胞的特征。

透明细胞肾细胞癌（ccRCC）具有免疫原性，免疫检查点抑制剂（ICIs）的获批革新了晚期ccRCC的治疗，但内在或适应性耐药及非免疫原性肿瘤微环境（TME）导致多数患者难以获得持久响应，且ccRCC肿瘤突变负荷（TMB）偏低。ccRCC常伴随VHL基因异常，还存在PBRM1等次级突变，这些突变在免疫调控中的作用尚未明确。PBRM1作为SWI/SNF复合体成员，其缺陷对ccRCC免疫治疗响应的影响存在争议，相关结论跨癌种适用性有限。

在神经科学研究的前沿领域，精准解析大脑神经通路的结构与功能，是破解精神疾病、药物成瘾等难题的关键。社会地位对心理健康和药物成瘾倾向有着深远影响。然而，社会等级影响药物寻求行为的神经机制仍不明确。

对于惰性甲状腺乳头状癌（PTC）的治疗，主动监测（AS）是手术干预之外的一种可行替代方案，有助于减少不必要治疗的发生。然而，由于缺乏更可靠的诊断标志物，主动监测的广泛应用受到了限制。本研究旨在明确惰性与进展性甲状腺乳头状癌之间的差异，为生物标志物研发及治疗策略制定寻找新的靶点。

解析癌相关成纤维细胞（CAF）的空间异质性，对于理解肿瘤生物学机制及治疗方案设计至关重要。本研究结合病理图像分析与空间蛋白质组学技术，在肝细胞癌（HCC）中鉴定出两种具有不同生物学功能和细胞外基质组成的基质原型。

确定可预测免疫治疗疗效的生物标志物，并发现联合治疗的新靶点，是改善膀胱癌（BLCA）患者预后的关键要素。 本实验利用多个公共数据库的数据，探究了 TBX3 在正常组织和泛癌组织中的表达模式，以及 TBX3 与免疫微环境之间的相关性。随后，我们结合多种技术证实了 TBX3 在膀胱癌（BLCA）中可构建免疫抑制性肿瘤微环境（TME）。

已有研究表明 T 细胞（尤其是细胞毒性 T 细胞）参与肿瘤免疫，但 B 细胞和抗体在肿瘤免疫中的作用仍不明确。以往研究主要聚焦于血液中的循环 B 细胞，对人头颈部鳞状细胞癌（HNSCC）组织中的肿瘤浸润 B 细胞（TIL-Bs）及其分泌的抗体研究有限。

人类免疫缺陷病毒（HIV）感染的一个显著特征是肠道屏障完整性受损，即便人类免疫缺陷病毒感染者（PWH）接受了抗逆转录病毒治疗（ART），这种损伤仍会持续存在。该损伤对 HIV 疾病进展至关重要，但目前其病因尚未完全明确。

三阴性乳腺癌（TNBC）是乳腺癌（BC）中侵袭性最强的亚型。TNBC 具有高转移率、高远处复发率、缺乏特异性治疗靶点且易产生耐药性的特点，这与其不同于其他乳腺癌亚型的独特肿瘤微环境（TME）密切相关。