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干货分享:小鼠内脏组织样品研磨提取核酸、微生物

发布时间:2018-08-30 14:43 点击次数:

近期的组织研磨和样品处理分享、讨论,我们邀请到了实验动物监测所袁老师给大家分享,内容是——小鼠内脏组织样品研磨提取核酸、微生物,研磨使用的仪器是鼎昊源 TL2020 组织研磨仪。

那接下来,就让我们先睹为快,看看这个案例的情况。
 
实例 1:加裂解液直接匀浆(使用 Trizol 提取组织 RNA)

1、取适量组织装入离心管,组织尽量剪碎成小块;
2、在离心管中加入氧化锆珠数颗(一次性使用);
3、先加入 Trizol(不建议加入太多 Trizol,液体体积过大影响匀浆效果),盖好管盖,装入鼎昊源 TL2020 组织研磨仪适配器中,安装上机。
4、组织研磨仪研磨参数设置为一定转速,研磨时间为 2~5 min(不同组织研磨时间不同,脑 1 min,肝脏、脾脏和肾脏 2 min、肺脏比较难研磨需 3~5 min,可能更长,中间应停顿 1~2 次防止温度过高,研磨前最好先用液氮或放置在-80 度冰箱预冷);
5、再加入适量 Trizol 至总体积;
6、后面步骤按 Trizol 说明进行。
 
实例 2:先匀浆,再取一定量液体加裂解液进行核酸抽提,本 protocol 适用提取小鼠组织中的病毒的核酸

1、取适量组织装入离心管,组织尽量剪碎成小块,样品量较多时使用大离心管;
2、在离心管中加入氧化锆珠数颗,使用大离心管时,可以将氧化锆珠数量增加;
3、加入适量的灭菌 PBS 或生理盐水,总体积为离心管单管体积的 1/3~1/2 为好,盖好管盖,装入鼎昊源 TL2020 组织研磨仪适配器中,安装上机(研磨前最好先用液氮或放置在-80 度冰箱预冷)。
4、TL2020 组织研磨仪研磨参数设置为一定转速,研磨时间为 1~5 min(不同组织研磨时间不同,脑 1 min,肝脏、脾脏和肾脏 2 min、肺脏比较难研磨需 3~5 min,可能更长,中间应停顿 1~2 次防止温度过高),若研磨不充分,可以继续研磨到充分为止;
5、一定温度、转速,离心数分钟;
6、取上清液按照试剂盒说明书进行后续提取步骤。

实验 1 中,我们之前试过一齐加 1 ml 的 Trizol,可能是体积过大,反而匀浆效果不好,所以就改成先加一部分裂解先匀浆,然后再补齐 1 ml 体积。
 
嘉宾:实验 1 中,我们之前试过一齐加 1 ml 的 Trizol,可能是体积过大,反而匀浆效果不好,所以就改成先加一部分裂解先匀浆,然后再补齐 1 ml 体积。

昊诺斯嘉宾:如果前面匀浆充分了,后面补齐裂解后不需要再研磨的,只需稍微混匀就可以。
 
用户:可以选择干磨吗?就组织直接扔进去弄成匀浆或者粉末,我再根据需要加 trizol 或者蛋白裂解液
 
嘉宾:跟大家分享下,我们最近用组织研磨仪用于抗原加佐剂的乳化,效果还不错。一机两用。
 
嘉宾:组织干磨效果不好,需要加入适量的液体,没有液体很多组织挂在壁上。
 
用户:提取下的核酸用途是什么?这个是我最关心的。
 
嘉宾:我们用于病原微生物检测。
 
用户:怎么个检测法您能给我简单介绍一下吗?
 
嘉宾:所以我们用的最多的是实验 2,先匀浆,破碎组织,释放组织细胞中的病毒,。
 
嘉宾:主要采用 PCR 为基础的分子生物学检测。
 
用户:嗯,PCR,我知道了,谢谢。
 
嘉宾:不客气。一般的组织核酸抽提试剂盒中,都会有一部匀浆的步骤。
 
嘉宾:以前没有研磨仪的时候都是用研钵手工匀浆,一天几十上百个样品,累成狗。
 
用户:研磨如果用液氮处理,里面的液体不会冻住吗?
 
用户:我也有这个疑问,看来这个仪器是核酸分析必须的。
 
嘉宾:开始会冻住,等研磨到一定时间就自然解冻了,我们处理时只是让它预冷一下,最好不要冻住。所以一般是放在-80 度冰箱稍预冷一下就可以了
 
用户:嗯!
 
用户:谢谢
 
嘉宾:是的,核酸检测必备。
 
用户:早些天我看一个打沙棘的视频,冻掉以后,直接就打下来了,所以冷冻还是有效果的,原理是一样的。
 
嘉宾:还要讲一下,选质量好的 EP 管,现在一些国产的 EP 管质量太差,盖不严,导致液体漏出。如果预冷的话,一些 EP 管就可能被打碎了,我们有过这样的例子。
 
用户:我们也因为质量不好的 EP 管影响过实验,所以试剂耗材也很重要。
 
嘉宾:同意。
 
用户:一定要选择质量有保证的产品。
 
嘉宾:是啊。关于振动频率说明一下,我们选的频率比较高,我看到有的资料上讲一般动物样品如大脑、心脏、肺、胃、肝脏等无骨骼组织的研磨推荐频率是 1000-1100r/min 研磨时间是 1-2 min,具体的频率可根据样品材料及数量的不同,做适当的调整。过大的频率或者时间都可能会导致部分 DNA 的断裂,建议每次研磨时间在 1 mm 左右,中间停顿一会,重复 2-3 次。
 
用户:谢谢袁老师。