Nature Cancer一作面对面 | 整合单细胞转录组分析解析结直肠癌肿瘤微环境分型

楚晓菁博士毕业于荷兰格罗宁根大学，2022年起在昌平实验室跟随张泽民院士、程斯进研究员进行博士后工作，主要研究方向为通过整合单细胞转录组数据解析结直肠癌肿瘤微环境异质性。楚晓菁博士与团队于2024年8月在Nature Cancer发表了题为Integrative single-cell analysis of human colorectal cancer reveals patient stratification with distinct immune evasion mechanisms的研究论文。该研究通过整合已公开的来自192个体（包括124个结直肠癌病人）的结直肠组织的67万个单细胞转录组数据，建立了包括健康、肠炎、肠道息肉、癌旁和肿瘤组织的单细胞图谱。描绘了肿瘤特异性的细胞亚型和转录组变化。基于肿瘤微环境的细胞组成，研究团队将结直肠癌病人分成6组，并解析了每组病人不同的肿瘤微环境特征及其对应的不同主导免疫逃逸机制。