“富矿”的开发:从miRNA到lncRNA

miRNA研究相关数据库信息

   2013-10-05
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1). miRbase: microRNA基因注释数据库。

网址:http://mirbase.org/index.shtml

2). Tarbase:一个收集已被实验验证的microRNA靶标数据库。

网址:http://microrna.gr/tarbase/

3). miRecords:一个整合的microRNA靶标数据库。整合多个靶标预测软件的调控关系。

网址:http://mirecords.biolead.org/

4). starBase:一个高通量实验数据CLIP-Seq(或称为HITS-CLIP)和mRNA降解组测序数据支持的microRNA靶标数据库,整合和构建多个流行的靶标预测软件的交集和调控关系。

网址:http://starbase.sysu.edu.cn/

5). miRanda和microRNA.org: Memorial Sloan-Kettering 癌症研究中心的研究人员开发的软件和数据库。

网址:http://www.microrna.org/microrna/home.do

6). MicroCosm: microRNA靶标数据库。

网址:http://www.ebi.ac.uk/enright-srv/microcosm/htdocs/targets/v5/

7). miRTarBase:整合实验证实的microRNA靶标的数据库。

网址:http://mirtarbase.mbc.nctu.edu.tw/index.html

8). miRGator v2.0:整合microRNA表达、靶标和疾病相关信息的数据库。

网址:http://mirgator.kobic.re.kr:8080/MEXWebApp/

9). MiRNAMap: 动物的microRNA基因及其靶标的数据库。

网址:http://mirnamap.mbc.nctu.edu.tw/

10). miRDB: 动物microRNA靶标预测和功能注释数据库。

网址:http://mirdb.org/miRDB/

11). miRGen:microRNA基因和microRNA靶标数据库。

网址:http://www.diana.pcbi.upenn.edu/miRGen.html

编辑: hejianxin    来源:丁香园

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