大量的研究证据表明,肠道微生物群与各种疾病存在密切的联系,如代谢疾病、心血管疾病、胃肠道疾病、神经系统疾病、自身免疫性疾病和皮肤病等。 然而,肠道微生物群本身并不直接影响有机体,而是通过其分泌小分子代谢物,调控靶器官中的分子途径,从而调节表型。目前,代谢组+微生物组(16S/宏基因组)已经成为了肠道菌群研究中主流的研究方法之一。 肠道菌群研究思路 根据不同的研究阶段,肠道菌群研究思路可分为以下5点: 1 研究菌群与疾病的关联性 寻找疾病与健康组的差异菌群,设立健康对照组和疾病组,临床检测结合组学分析,确定与疾病显著相关的特定微生物。亦或是在此基础上增加疾病背景下影响肠道菌群的因素分析,如生活方式、饮食习惯、运动、生活环境等。 2 研究菌群与疾病因果关系 确定是疾病导致菌群失调,还是菌群失调促进疾病发生。通过比较疾病不同进展期肠道菌群的构成变化,确定与疾病进展高度一致或相反的一种或几种目标菌,推测其促进或抑制了疾病的发生。 3 验证菌群与疾病因果关系 验证是否由菌群促进了疾病的发生发展。将患者和健康人群的粪菌移植到无菌小鼠中,临床理化指标结合组学分析,观察患者菌群是否能促进小鼠疾病的发生和发展,研究小鼠菌群的改变以及菌群对其疾病的作用。 4 验证致病菌或有益菌的功能及疾病机理研究 研究菌群对疾病发生的促进作用是多个菌共同作用的结果,还是有关键菌在起主导作用。首先确定一种或几种目标菌,利用动物实验对该菌进行验证。临床指标结合组学结果,综合分析该菌影响肠道菌群致病或改善疾病的机制。 5 疾病干预、诊断、分型研究 研究干预手段(如饮食、药物、益生菌、粪菌移植等)对疾病的治疗效果。通过比较健康对照组、疾病组及疾病干预组菌群和代谢物组成的差异,验证干预手段是否是通过改变菌群来提高治疗效果。 通过生信和统计分析方法建立疾病预测模型,研究预测模型和传统疾病诊断方法对疾病的诊断效果,确定最佳诊断疾病的菌群/代谢物标志物。 样本选择 宏基因组/16S选择粪便或肠道内容物,代谢组则根据不同的研究目来选择样本类型。 研究方法 华大科技提供代谢组+16S rDNA/宏基因组联合分析⽅案。 欲知更多详情,请联系华大科技当地销售代表 热线电话:400-706-6615 邮箱:info@genomics.cn |
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