一文读懂RNA酶抑制剂

2023-08-25 16:40点击次数:3170

关键词:
RNA酶(RNase)是水解RNA的核酸内切酶,主要切断核苷酸之间的磷酸二酯键。RNA酶分子非常稳定,结构中存在二硫键,其活性不需要二价阳离子存在,因此RNA酶不容易变性,即使高温或使用变性剂后也容易发生复性。RNA酶分为内源性和外源性,其中内源性RNA酶在细胞破裂时可同时释放出来,因此消除内源性RNA酶的作用是RNA提取过程中非常关键的一个步骤。外源性RNA酶分布则非常广泛,空气、人的皮肤、头发和唾液等都存在RNA酶,是造成RNA容易降解的重要原因。

目前呼吸道病原核酸检测主要的样本类型是咽拭子,常用的样本保存液多种多样,都需要冷藏或冷冻运输储存;因RNA样本的理化性质及RNA酶等的存在,样本RNA容易降解,采集转运过程中全程低温控制较难,样本检测前质量控制较难保证。CANS-CL02-A009《医学实验室质量和能力认可准则在分子诊断领域的应用说明》在技术要求里,提出应根据用途,制定适宜的水质标准;检验前过程使用无 DNase和/或无RNase的一次性密闭容器。

RNA酶抑制剂 
RNA酶抑制剂具有广谱的RNA酶抑制作用,包括中性的真核生物的RNA的抑制作用。RNA酶抑制剂与RNA酶结合的有效浓度时10-14M。而且,RNA酶抑制剂的动力学结合是非常迅速的,确保与RNA酶的迅速络合,并对其产生迅速的抑制作用。

分类与作用


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作用原理 
异硫氰酸胍:目前认为是最有效的RNA酶抑制剂,它在裂解组织的同时也使RNA酶失活,它既可破坏细胞结构使核酸从核蛋白中解离出来,又对RNA酶有强烈的变性作用。
Trizol是一种新型总RNA抽提试剂,可以直接从细胞或组织中提取总RNA。其含有异硫氰酸胍等物质,能迅速破碎细胞并抑制细胞释放出的核酸酶。

RNA酶的蛋白质抑制剂(RNasin):从大鼠肝或人胚盘中提取得来的酸性糖蛋白.Rnasin是RNA酶的一种非竞争性抑制剂,可以和多种RNA酶结合,使其失活。

高温:高温也是蛋白变性的常用手段。

DEPC:是一种强烈但不彻底的RNA酶抑制剂,他通过和RNA酶的活性基因团组氨酸的咪唑环结合使蛋白质变性,从而抑制酶的活性。

氧钒核糖核苷复合物:由氧化钒离子和核苷形成的复合物,它和RNA酶结合形式过渡类物质,几乎能完全抑制RNA酶的活性。

PCR应用方面特异性RNA酶抑制剂
RNase Inhibitor/RNasin适用于有潜在RNase污染的地方, 在cDNA合成、体外转录系统、翻译系统保护mRNA。RNase Inhibitor是以可溶形式在大肠杆菌中表达纯化的重组RNase抑制剂,与存在于人胎盘中的特异性核糖核酸酶抑制剂具有相同的应用效果,其本质是分子量为50kDa的蛋白质。

RNasin可与多种RNA酶1:1 非共价结合,与RNA 酶快速形成复合物,使RNA酶失活。该蛋白质应置于一定浓度的二硫苏糖醇(DTT)和50%的甘油中,贮存于-20℃。其最大活性的发挥要求巯基试剂,而且它并不干扰反转录或mRNA在无细胞体系中的翻译。

武汉华美生物生产的RNase Inhibitor在广谱pH范围内,可与RNase A、B、C以 1:1 的比例高效非共价结合从而抑制这些酶的活性,对RNase 1、RNase T1、S1核酸酶、RNase H或来源于曲霉属的RNase无抑制作用。无核酸外切和内切 酶活性以及RNase污染。其与下列聚合酶共同使用时,RNase Inhibitor, Mammalian不会抑制聚合酶活性,如:Taq DNA聚合酶, AMV 或M-MuLV逆转录酶,噬菌体RNA聚合酶(SP6、T7或T3)等。

技术特点:
本项目研发了一种重组RNA酶抑制剂的高效可溶性表达与纯化的方法,并在此基础上建立了重组RNA酶抑制剂的生产工艺。与国内外竞品相比,蛋白产率和酶活更高。

单位定义:
抑制5ng RNase A活性的50%所需酶量为一单位。

产品特点:
广谱的RNase抑制活性:能够广泛抑制各种RNase A, RNase B, RNase C;
广泛的兼容性:与RT-PCR、qPCR系统兼容;抗氧化能力强;
超强热稳定性:适用于热稳定性逆转录酶,更高效的配合RNA逆转录
热灭活:65℃ ~10min;

RNase Inhibitor应用:
cDNA合成、逆转录PCR(RT-PCR)、微型RNA(miRNA)扩增
体外转录和翻译、RNA测序的目标mRNA保护、原位杂交、抗体制备、mRNA定位等

检测RNase Inhibitor产品性能:
荧光PCR法实验材料
测试组和对照RNase Inhibitor(40 U/μL)
RNase A
RNA样本
引物探针
反应缓冲液
MMLV逆转录酶、UDG酶
2×Taqman qPCR KIT
荧光PCR仪

实验方法与结果
1.gDNA去除反应
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注:为避免RNA与RNase A接触提前发生降解,预先将RNase Inhibitor与RNase A按比例混合后再加入体系。

2.反转录反应体系
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3.42℃,孵育15 min后,95℃,孵育3 min之后放于冰上。用2×Taqman qPCR KIT、扩增引物配置反应液,取5 μl cDNA进行荧光PCR检测。
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检测结果:与同类产品效果对比,其效果明显优于同类产品

产品即到即用,无核酶污染,性能稳定,抑制明显。

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