计算IC50常用的2种方法
2020-05-21 11:15点击次数:52149
关键词:IC50的计算方法使用Excel计算IC50使用graphpadprism计算IC50IC50(half maximal inhibitory concentration),即半抑制浓度,指某一种物质对某些生物程序抑制达到50%抑制效果时的浓度。对细胞增殖方面,可以理解为对细胞增殖的抑制效果达到细胞正常增殖水平50%时的药物浓度。通常用IC50来衡量药物对细胞的毒性或者细胞对药物的耐受能力,在药物实验中,常用IC50来评估实验中使用的药物浓度。IC50的计算方法很多,常用的有Excel、graphpad prism、SPSS等。
一、使用Excel计算IC50
首先将数据输入Excel中
| 抑制率 | 浓度 | Lg(浓度) |
| 21% | 5 | 0.69897 |
| 32% | 10 | 1 |
| 47% | 20 | 1.30103 |
| 56% | 30 | 1.47712125 |
| 67% | 50 | 1.69897 |
因为药物浓度与抑制率的线性关系并不理想,因此需要用药物浓度的对数与抑制率作图。

药物浓度与抑制率作图,线性关系不好;

药物浓度的对数与抑制率作图,线性关系理想
根据线性公式计算抑制率为50%时的Y值,计算10为底,计算值为指数的冥,结果即为IC50。
二、使用graphpad prism计算IC50
打开软件后选择XY选项,Y值选择第一项: enter and plot a single y value for each poin,
点击create。

在X和Y栏中分别输入药物浓度和抑制率:

点击Analyze,在选项中选择:Transform concentration(X)

点击OK,在弹出的界面中选择Transform to logarithms。

再进入Analyze界面,点击OK,在弹出的界面中选择:Dose-response-Inhibition选项下的Log(inhibitor)vs.response—Variable slope(four parameters)。
结果如下,这一组数据的IC50为23.02

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