求各位大神，用这样的不同平台数据合并分析可以吗。
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用了4个数据集合并分析，两个GPL96，一个GPL570，一个GPL91。一个验证的数据集是GPL96的。
本来是想用三个GPL96的数据集合并，再用GPL570做验证的。但其中一个GPL96和另一个GPL96数据没处理批次效应前PCA图就基本重叠。而且怎么调参数结果都不好看在GPL570验证集得出的结果都不好看。
3 个回答
bamboopiggy
有帮助
可以合并分析，现在基本都是几个平台的数据弄到一起分析的
灵枢天问
有帮助
可以的，只要是同类型数据就可以
土井挞克树
有帮助
其实是可以的，保证数据均一性。
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