萧莣苼
90% 都是下面 4 类原因,按顺序排查通常 5 分钟就能解决:
1. R 路径写错
打开 FlowJo → Preferences → Diagnostics → R Path,必须指向 R.exe 本身,而不是文件夹。
例:
C:\Program Files\R\R-4.x.x\bin\x64\R.exe
注意末尾一定是 R.exe;如果路径里带 “\x64” 后仍报错,把 \x64 删掉再试一次 。
2. R 默认库目录没写权限
单独打开 R 控制台,执行:
r
复制
install.packages("png")
如果提示 “library is not writable”,选 Yes 让它给你新建一个用户级库,然后重新进 FlowJo 再跑 flowAI 。
3. FCS 文件缺少或 TIME 参数名字异常
flowAI 强制要求有 Time 参数。
贝克曼 XDP 等平台会导出 TIME 和 TIME2 两个参数,把不需要的参数在 FlowJo 里删掉,只保留一个 TIME;
如果 Time 列叫 “TIME::TIME LSW” 之类,把列名改回纯 “TIME” 再跑插件 。
4. 路径/文件名里出现中文或特殊符号
把 .fcs 文件和 FlowJo workspace 都挪到纯英文路径(如 D:\FlowJo\WS\),再重新加载运行;云盘或网络盘权限不足时,也先拷到本地硬盘 。

