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        微生物学发文章系统发育树请问用原图还是consensus图!急求

        相关实验:微生物鉴定中常用的生化反应

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        小兔和小卫

        本人跨专业,现在再做系统发育树。我PCR以后然后测序出来的序列去blast后下载分值高的序列和文献中别人用到的参考序列,放到MEGA11里面跑树。现在就是原图和consensus图,只有consensus图符合我的预期。然后我在咸鱼上请人做了,她用到MEGA7.0 做出来的原图符合我的预期。

        问题是,发文章微生物学方向 用原图还是consensus图?

        还有就是为什么会出现不一致的现象。我的问题到底出在了哪里?求各位大佬帮帮忙,帮忙回答一下

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        3 个回答

        user-title

        Dr_劉医生

        有帮助

        1、投稿用consensus图就可以了;

        2、二者不一致的情况是软件的问题,但趋势都是一样的,不影响结果。

        user-title

        土井挞克树

        有帮助

        你可以发consensus图,这样说明的全面一些

        user-title

        loveliufudan

        有帮助

        在发表文章时,应该选择更符合科学方法和预期的系统发育树图。如果您在进行的研究中使用了比较完整的数据,原图可能更符合您的预期;如果您对数据存在一定的不确定性,那么Consensus图可能更合适。如果您不能确定哪一个图更符合您的预期,建议您进行更详细的分析,再做出选择。

        不一致现象的原因可能有很多,例如不同的软件版本、不同的构建系统发育树的方法、不同的参考序列以及不同的分析参数等。在选择软件前,您可以先考虑软件的特性、分析参数和方法,以确保软件能够满足您的研究需求。

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