请问如何能从二级质谱为蛋白定性？

可以利用液相色谱串联质谱，不同的质谱碎裂模式会使肽段在不同的位置断裂，从二级质谱的结果中选一个离子打断，采集碎片离子的信息，从而定性。

利用液相色谱串联质谱（LC-MS-MS）的方式检测。先通过液相进行有效分离，将各蛋白质组分分开，再通过二级质谱进行片段化检测定性，真正的将蛋白定性做到速度快且数据精准。

从一级质谱的结果---肽段检测结果中挑选一个离子，将其打断，采集这些碎片离子的信息，肽段在质谱仪中碎裂有规律，不同的质谱碎裂模式会使肽段在不同的位置断裂。