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        蛋白组学入门相关问题请教

        相关实验:蛋白质免疫印迹(Western Blot,WB)

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        蓝莓小布丁

        后面实验安排涉及蛋白组学相关,小白需要学习什么方便入门呢?

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        4 个回答

        user-title

        loveliufudan

        有帮助

        蛋白组学入门可以关注以下几方面:


        1. 了解蛋白组学的基本概念和研究内容


        首先需要理解什么是蛋白组学,它的研究内容包括蛋白质的表达、结构、功能、互作用网络等。


        2. 了解常用的蛋白质分离技术


        如双向电泳、高效液相色谱、质谱技术,这些都是分离和鉴定蛋白质的重要技术。


        3. 了解蛋白质组学数据库


        如Swiss-Prot、Trembl等数据库,这些数据库收集了大量已知蛋白质的序列和功能信息。


        4. 了解蛋白质组学研究的一般流程


        从样本处理、蛋白提取、分离、鉴定、到生物信息分析,了解整个蛋白质组学研究的流程。


        5. 学习一些基本的生物信息学分析工具


        如蛋白质序列数据库搜索,多肽质谱匹配,这些都是蛋白鉴定的基础。


        6. 阅读一些蛋白组学的入门书籍或综述文章


        帮助掌握该领域的整体框架和研究热点。


        总体来说,对基础技术原理和研究流程有一定了解,并学习使用基本工具,是蛋白组学入门的主要途径。后续可以通过实际操作来加深理解和提高技能。

        user-title

        sswei

        有帮助

        蛋白质组(Proteome)的概念最先由Marc Wilkins提出,指由一个基因组(Genome),或一个细胞、组织表达的所有蛋白质(Protein)。蛋白质组的概念结合了基因组的概念,同时引入了蛋白质的概念,意指“一种基因组所表达的全套蛋白质”,即包括一种细胞乃至一种生物所表达的全部蛋白质。蛋白质组学本质上指的是在大规模水平上研究蛋白质的特征,包括蛋白质的表达水平,翻译后的修饰,蛋白与蛋白相互作用等,由此获得蛋白质水平上的关于疾病发生,细胞代谢等过程的整体而全面的认识。

        user-title

        土井挞克树

        有帮助

        建议学习一下蛋白质组学相应的入门知识:

        蛋白质组学的研究技术


        1、蛋白质分离技术

        双向凝胶电泳(2DE),双向荧光差异电泳(2D-DIGE),等电聚焦电泳(IEF),液相色谱。

        多维色谱(MDC),多维液相色谱(MDLC)。


        2、蛋白质鉴定技术

        一级质谱:根据离子源的不同,分为基质辅助激光解吸电离-飞行时间质谱(MALDI-TOF-MS)和电喷雾质谱(ESI- MS)。

        二级质谱:肽质量指纹图谱(PMF)。

        新技术:稳定同位素特征标签生物质谱(SIAMS)

        user-title

        huarenqiang5

        有帮助

        主要从以下几方面准备:

        一、了解蛋白组学的相关概念

        二、蛋白质组学的研究内容

        在平时的研究工作中,弄清楚某些样品中的蛋白质组成或者蛋白质上的翻译后修饰(PTM)位点,可以通过蛋白质组学技术对样品进行鉴定分析。如果我们想比较两组样品中蛋白质的表达差异,可以选取合适的蛋白质组学技术对样品进行相对定量分析,也就是所谓的定量蛋白质组学

        (Quantitative Proteomics)定量蛋白质组

        是蛋白质组学研究的重点,通过定量蛋白质组

        学技术可以研究蛋白质相互作用、不同样品间差异蛋白的筛选和机制探讨(比如正常组vs基因敲除组细胞等)、药物作用靶点的筛选和验证,以及疾病生物标志物的筛选等。

        三、蛋白质组学研究的基本流程


        要开展一项蛋白质组学研究,通常需要经过如

        下几个基本的实验流程。首先根据实验设计准

        备好样品,对样品进行处理,提取样品中的蛋白质,并将蛋白质通过胰蛋白酶酶切为肽段。

        将处理后的多肽样品进行质谱检测得到质谱数

        据,再通过数据库检索把质谱数据转变为蛋白

        质的鉴定和定量信息。最后筛选得到差异蛋白,并进行生物信息学分析,对蛋白质组学数据进行多角度的分析和挖掘。

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