每天解决新问题
各位老师好,想问一下T细胞提蛋白相关问题:我用流式分选出的T细胞(1.5x10^6个)提蛋白跑Wb,分出来后直接离心收集沉淀,只加了100ul含有蛋白酶抑制剂的RIPA裂解液,冰上裂解三分钟,离心取上清进行BCA定量。定量结果是蛋白浓度只有零点几,请问这是什么原因呢?按理说这个细胞数可以加200ul裂解液。
(应该不是蛋白降解。我一般提蛋白都是这个流程,每次时间差不多,总不会离心和裂解的过程中都降解完了。)
我猜测可能跟T细胞沉淀太少有关?T细胞比较小,同样细胞数沉淀会比其他细胞少很多,不知道是不是这个原因。
大家提T细胞蛋白的时候一般按照什么标准加裂解液呢?
Marvin777
您好,请问您解决这个问题了吗,我遇到一模一样的问题了
sswei
一般做western blotting时,都需要对样品进行定量,至少对蛋白的浓度大致有一个估计值(比如只需要定性分析的时候)。之后不同处理组采用相同的上样量,一般20 ug左右即可,一些丰度的确比较低的蛋白可能需要40~80 ug左右上样量。
土井挞克树
考虑是裂解程度不够,建议延长裂解时间
loveliufudan
下面是可能导致这种情况的几个原因:
1. 细胞数太少:你提到使用了1.5x10^6个T细胞进行蛋白提取。如果这个数量相对较少,可能会导致提取的蛋白量较低,从而导致浓度低。你可以尝试使用更多的细胞来提取蛋白,以增加蛋白的浓度。
2. 细胞裂解液体积不足:你提到使用了100 μl含有蛋白酶抑制剂的RIPA裂解液来裂解细胞。如果细胞数较多,可能需要增加裂解液的体积,以确保细胞得到充分的裂解和蛋白的释放。
3. 蛋白酶抑制剂效果不佳:尽管你使用了蛋白酶抑制剂,但有时仍可能发生蛋白降解。可能需要确认所使用的蛋白酶抑制剂的浓度和效力是否足够,或者尝试其他更强效的蛋白酶抑制剂。
4. 其他实验条件的优化:除了上述因素外,还有其他可能影响蛋白提取的因素,如裂解液的pH、离心速度和时间、裂解温度等。适当地优化这些实验条件可能有助于提高蛋白提取的效果。
一般来说,细胞数量和裂解液体积是蛋白提取中重要的考虑因素。具体的标准可能因实验目的、细胞类型和细胞状态而有所不同。
最后,定量蛋白浓度的方法也可能会影响结果。除了BCA定量,还可以考虑使用其他常见的方法,如Bradford法或Lowry法等,以验证蛋白浓度的结果。