说起看文献,我发现一开始是看不懂,后来逼着自己看,慢慢地能看懂了有点沾沾自喜。再后来看得多了,发现又看不懂了。原本我以为是不是我特别笨,是不是就是我是这样的,还不敢问别人。最近,《科学》杂志采访了一些学者,主要是针对如何认真阅读文献的。从中我发现学术大牛对许多文献理解也有困难,也是感觉自己越来越愚蠢。原来这是科学家的流行病。为此我特地编译出来,分享给大家。1、读文献难得很Adam Ruben 分享亲身体会我记得我第一次看这些 ...
随着高通量检测技术的飞速发展,GEO、TCGA 等数据库中积累了大量基因数据,单看 GCBI 的统计结果,目前有 2 400 多万篇文献,120 多万份基因大数据,8 万多份肿瘤样本数据。在这些公共数据中,包含了高通量数据、文献资源、实验背景信息、病理信息和预后信息,在这些信息中蕴含大量的宝贵信息。今天就和大家分享一下如何利用公共数据帮助课题设计及申请,发现更多研究思路。这就涉及到了两个核心问题:怎样找到有价值的数据?怎么用这些数据?先说如何找数 ...
某天,Boss 说:某某,把这份文件打成 Word。然后,有的同学可能会拿起纸质稿打开 Word 开始「啪啪」打字......那么,是否有更快捷的方法呢?答案是有的。这时候,我们需要利用 OCR(光学字符识别),具体的方法有很多,此处介绍三种。假设我们需要将以下图片转成文字:然后,我们逐一介绍这三种方法:1、Office 工具对于安装了 Office 2003 的同学们,可以使用其中的 Microsoft Office Document Imaging 功能。第一步,我们使用 Mic ...
今天在网上看到一个问题,有人问:都说有些动物因为人类的口腹之欲而灭绝了,但思来想去也想不出来到底是什么动物,真的有动物是被人吃灭绝的吗?看到这个题目,心里真堵。多少动物都被吃的满门抄斩,结果大家心里还没什么印象。其实绝大多数人都对我们给自然界带来的破坏没有清晰地认识,更无从谈悔改之心。这是教育的失败,是环保宣传工作的失败。现在也有野生救援还有 WWF 这些组织在各种媒体投放动物保护类的广告,比如「没有买卖就没有杀害」、「犀 ...
各位科研汪们是不是都遇到过这种情况——在 pubmed 上检索出结果后,想看看这些文章的影响因子,却发现 pubmed 上直接看不到。这时候我们或许会利用 med-sci 影响因子查询系统查该期刊的影响因子,还可以在 NoteExpress 的题录里查看某文章所在期刊的影响因子。但是能不能直接在 Pubmed 检索的时候就直接看到影响因子呢?那样是不是会方便很多,今天我就给大家介绍一种可以直接在 pubmed 里查看影响因子的方法。Step 1打开 lantern ...
博士论文是憋出来的,说这句话的人是我十几年前的一个朋友。当时我还在读硕士,有一段时间我在他们学校做实验,和我这朋友住一个宿舍。我这哥们跟我年龄相仿,硕博连读。他的研究方向偏理论,需要推导很多公式。我白天泡在实验室,他一天到晚不出宿舍,推导公式,编程序。晚上睡觉的时候,我们也经常聊一聊,交流一下学习心得。我问他研究进展如何,他说还可以,但推导公式经常卡壳,很郁闷。我问他遇到这种情况,怎么解决?这么天天憋在宿舍里,也不是个 ...
好多年不写经验分享了,今天大师兄邀请自己的好友——Summer 同学,让他跟大家分享下自己的制图经验吧(Professional 的学术交流)。OK,现在开始。很多兔子们虾米们可能都是直接用 Excel 来制作论文图表,就像下面这样:实际上这样的做法并不正确。一般黑白图片的出版要求是 1000 dpi,这样的方式得到的图片是远远不符合要求的。因为,印刷出来后会灰常模糊。正确的做法是需要先安装 Adobe Acrobat 后,选中图表后使用「打印」功能, ...
今天给大家介绍一种简单快速的基因芯片数据分析网站。GCBI 基因云平台(www.gcbi.com.cn),可以让科研人员及医生低门槛并且快速的使用生物信息学进行基因相关的研究。分析思路先以表达谱数据为例介绍基本的分析思路:1. 差异基因筛选:对实验组和对照组进行差异基因筛选,筛选出与实验因素(可以是疾病、干扰或过表达等)相关的差异表达基因。2. 差异基因功能与通路分析:对差异基因基于 GeneOntology 和 KEGG 数据库进行显著性功 ...
接上期,本周让我们一同看看,国际上学术又出现了哪些好玩的新技术。当被插管的小丁丁发炎了怎么办?在临床上,被插管的小丁丁发炎是常有的事,因此导尿管表面生物膜感染是医院感染中最常见的感染类型。虽然以前有一些关于导尿管发炎的动物模型,但是随着时代的发展,以前的经验方法在现在好些已经不灵了。因此,我们法国巴斯德研究所的 Ashwini Chauhan 同学提出了一种具有的高度可重复性的新方法,具体是啥,赶紧去师兄的小伙伴生物菌同 ...
一般而言,我们拟合ELISA标准曲线选用比较经典的Curve Expert 1.3或者Curve Expert 1.4软件。现在我们以Curve Expert 1.4为例,对ELISA标准曲线绘制方法进行详述。1. 点击Curve Expert 1.4,打开应用程序,截图界面如下:2.在X轴输入标准品的OD值,Y轴输入相应的标准品的浓度,截图界面如下:3. 单击上图界面中的 图标,出现如下界面4. 单击上图界面中的ALL OFF 按钮,出现如下界面5. 我们选择Sigmoid ...
今天将和大家介绍绘制 G 蛋白受体介导的信号转导通路,使得最终的效果如下图所示:Figure 1. G 蛋白偶联受体介导的信号转导通路(示意图)绘图思路绘制示意图,常用的软件有 PowerPoint 和 Illustrator,现在我们先将 Figure 1 的示意图拆解成单个元素,来比较一下两款软件的优缺点。此外,在绘制示意图方面,Illustrator 的主要优点是功能齐全,而 PowerPoint 的主要优点则是上手容易。本讲,我们使用 Illustrator 来绘制 ...
ELISA实验因灵敏度高,特异性强在生物科研上得到了广泛的认可,但对初学者而言,如不注意实验操作过程中的各个环节,可能会对最终的实验结果产生比较大的影响,比如实验出现白板,显色弱灵敏度低,花板无梯度背景高等现象。下面对以上实验现象进行一一解析。1.白板现象在完成所有实验步骤进行底物TMB溶液显色后,酶标板中所有孔的颜色均为无色,即无信号呈现。出现该现象的可能原因:试剂已过保质期,不同批次稀释液交叉使用。错加漏加检 ...
ELISA,即酶联免疫吸附实验,其基本原理是将一定浓度的抗原或者抗体通过物理吸附的方法固定于聚苯乙烯微孔板表面,加入待检标本,通过酶标物显色的深浅间接反映被检抗原或者抗体的存在与否或者量的多少。ELISA技术作为免疫标记技术(包含免疫荧光技术,免疫放射技术,免疫酶技术和免疫胶体金技术)中的一种,已广泛应用于科研和临床实验中,具有快速,定性或者定量甚至定位的特点。在ELISA实验方法中,比较常见的方法有双抗体夹心 ...
制备出效价高,特异性强,稳定性好的抗体是免疫学实验取得成功的基础,抗体质量的好坏直接影响着研究者研究的成败,不同的免疫学实验方法(如ELISA,IHC,IP,ICC,SDS-PAGE, WB等)对抗体的效价,浓度和纯度有不同的要求。我们知道,一般免疫血清中含有特异性抗体和非特异性抗体,血清蛋白以及其他各种杂蛋白等,在制备特异性抗体过程中当抗体的效价达到实验预期之后,我们所制备的抗体的纯度关键取决于所选择的纯化方法。下面 ...
抗原刺激机体,产生免疫学反应,由机体的浆细胞合成并分泌的与抗原有特异性结合能力的一组免疫球蛋白,这种与抗原有特异性结合能力的免疫球蛋白就是抗体。一般而言,抗体按靶位点不同主要分为单克隆抗体和多克隆抗体 ,由多个B淋巴细胞克隆产生的,受到多种抗原决定簇刺激并可以与多种抗原表位结合的抗体就是多克隆抗体, 本篇主要讲述兔源性多克隆抗体制备的相关流程。抗原有两个基本特性,即抗原性和免疫原性。有抗原性的物质不一定有免疫原性, ...
染色质免疫共沉淀(Chromatin immunoprecipitation,ChIP)是一种用于研究目的蛋白在染色质上定位的技术。ChIP 的原理是通过甲醛处理细胞固定 DNA 和蛋白,然后提取染色质,使用超声或酶解将染色质剪切成小片段。之后使用结合在染色质的目的蛋白或组蛋白修饰特异性抗体富集 DNA 片段。富集的 DNA 片段可以通过 PCR,DNA 芯片或测序进行分析。虽然原理看起来很简单,但 ChIP 是一项非常具有挑战的技术,很多因素都可能导致实 ...
经季老师推荐,看到了下面这样的通知。作为一个从事这么多年正宗科研的人来说,其实对如何做好科研已经有自己的判断。但是这个王博士,是搞临床的,并且发了我们也梦寐以求的文章。我的心为之一动,那就去听听吧。听了一下这个王博士的简介,算起来应该和我差不多年龄,真要算,我的同学,年龄相仿的师兄师姐如今也是遍布国内外名校,几乎也都发过牛文。并且很多也回到国内重点院校担任教师。所以从我的角度看,他所讲的似乎和我已知的并无差异,也可 ...
文献综述是在对某研究领域近期公开发表的文献进行广泛阅读和理解的基础上,对该领域研究成果的提炼、综合和思考,阐明其研究进展,揭示其发展趋势。文献综述首先是对学术观点和理论方法的整理,其次是对现有的文献进行评价和分析,再次是对该研究的未来提出建议或展望。所以综述的写作是总结该方向前人已经做了的科研状况,了解目前的研究动态,分析存在问题及其原因,指出今后的研究问题和发展方向,列出该方向代表性的参考文献,为进行该领域 ...
一、亚硫酸氢钠修饰过程中可能出现的问题及应对措施亚硫酸氢钠修饰DNA的目的是将DNA序列中未甲基化的胞嘧啶完全转化为尿嘧啶,而甲基化的5一甲基胞嘧啶保持不变。影响此过程的主要因素有修饰试剂的浓度、反应温度、反应环境的pH值及反应时间。其中任何一个环节出现问题都将导致MSP扩增失败,体会如下:(1)亚硫酸氢钠的浓度最好控制在3.0~3.9 mol/L为好,其pH值必须用NaOH精确调整至5.0;(2)修饰时间应掌握在10~ ...
开始细胞传代前,仔细检查细胞传代所需的仪器和试剂是否齐全。细胞与试剂方面:1、细胞(单层细胞,镜检适合)2、培养液(MEM-0.2%LH 培养液或MEM 培养液或199 等适合细胞有要求的培养液)3、灭活小牛血清、庆大霉素溶液(1 万单位)4、7.5%NaHC03 溶液5、0.25%胰蛋白酶6、PBS 洗液。实验小用具方面:1、小方瓶(100m1)2、克氏瓶3、胶塞4、吸管(10ml、1m1)5、细胞吹打管(20 ml)(以上用具需经121℃至少15 分钟高压灭菌)6、 ...