原位杂交操作规程
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一、仪器设备
医用微波炉; 水浴锅。
二、试剂
0.2 mol/L HCl:HCl 8.2 ml,H2O 定容0.5 L。
0.1 mol/L 三乙醇胺(pH8.0):三乙醇胺 5.33 ml,H2O 定容0.4 L。
0.5 ml/L 醋酸-2.5 ml/L 醋酸酐:三乙醇胺 13.2 ml,NaCl 5 g,浓HCl 4 ml,H2O 定容0.98 L,醋酸酐 (用前加)2.5 ml。
20×SSC(pH7.0):NaCl 175.3 g,枸橼酸钠 88.2 g,H2O定容1 L。
100×Denhardt's:Ficoll 1g,PVP 1 g,BSA 1 g,H2O 定容50 ml。
杂交液:Formamide 5 ml,20×SSC 2.5 ml,Dextran sulfate 1 g,100×Denhardt's 0.5 ml,10%SDS 0.5 ml,10 g/L sperm DNA 0.1 ml,H2O 1.4 L。
BufferⅠ(pH7.5):0.1 mol/L ris·Cl,0.15 mol/L NaCl。
BufferⅢ(pH9.5):0.1 mol/L Tris·Cl,0.1 mol/L NaCl,0.05 mol/L MgCl2。
BufferⅣ(pH8.0):10 mmol/L Tris·Cl,1 mmol/L EDTA。
三、操作流程
1. 使用地高辛标记的核酸探针进行石蜡切片的RNA原位杂交第一天。
(1) 二甲苯于37℃脱蜡2次,每次15分钟;
(2) 无水乙醇浸泡2次,每次3分钟;
(3) 95%乙醇浸泡2次,每次3分钟;
(4) PBS清洗3分钟;
(5) 2%焦碳酸二乙酯室温下浸泡10分钟;
(6) PBS清洗10分钟;
(7) 加入胃蛋白酶25ul/ml,37℃孵育15分钟;
(8) PBS清洗2次,每次3分钟;
(9) 0.2N的HCl孵育30分钟;
(10)PBS清洗2次,每次3分钟;
(11)0.25%无水乙酸和0.1M三乙醇胺孵育10分钟;
(12)PBS清洗2次,每次5分钟;
(13)预杂交缓冲液孵育30分钟;
(14)准备核酸探针混合物:使用预杂交缓冲液稀释探针,85℃加热5分钟,置于冰块中10分钟;
(15)杂交;第二天
(16)将玻片置于SSC中2次,每次5分钟以去除封片;
(17)PBS清洗3分钟;
(18)RNA酶A溶液中(或0.1-1 ng/ml PBS中),37℃孵育30分钟;
(19)PBS清洗5分钟;
(20)室温,2×SSC清洗10分钟;
(21)37℃,1×SSC清洗10分钟;
(22)37℃,0.5×SSC清洗10分钟;
(23)缓冲液A孵育10分钟;
(24)缓冲液A(1%正常绵羊血清和0.03%三重氢核X-100)孵育30分钟;
(25)加入抗地高辛抗体(1/200的上述缓冲液,来自Boehringer Mannheim),37℃孵育3 小时;
(26)缓冲液A清洗2次,每次10分钟;
(27)缓冲液B清洗2次,每次5分钟;
(28)制成NBT/BCIP暗处保存30~60分钟,显微镜下进行观察,如果背景尚佳,显色时间可延长到16小时;
(29)停止缓冲液B的反应,用水进行简单的清洗;
(30)固红,脱水以及封片进行核的复染。
2. 使用地高辛标记的寡核苷酸探针进行石蜡切片的原位DNA杂交第一天。
(1) 二甲苯于37℃脱蜡2次,每次15分钟;
(2) 无水乙醇浸泡2次,每次5分钟;
(3) 95%乙醇浸泡2次,每次5分钟;
(4) PBS清洗5分钟;
(5) 2%焦碳酸二乙酯室温下浸泡10分钟;
(6) PBS清洗5分钟;
(7) 加入胃蛋白酶25 μl/ml,37℃孵育10分钟;
(8) PBS清洗2次,每次5分钟;
(9) 0.2N的HCl孵育30分钟;
(10)PBS清洗2次,每次5分钟;
(11)0.25%无水乙酸和0.1 M 三乙醇胺孵育10分钟;
(12)PBS清洗5分钟;
(13)预杂交缓冲液孵育30分钟;
(14)准备寡核苷酸探针混合物:使用预杂交缓冲液稀释探针;
(15)杂交;第二天
(16)将玻片置于SSC中以去除封片;
(17)室温,2×SSC清洗10分钟;
(18)37℃,1×SSC清洗10分钟;
(19)37℃,0.5×SSC清洗10分钟;
(20)缓冲液A孵育10分钟;
(21)缓冲液A孵育30分钟;
(22)加入抗地高辛抗体37℃孵育3小时;
(23)缓冲液A清洗2次,每次5分钟;
(24)缓冲液B清洗2次,每次5分钟;
(25)制成NBT/BCIP暗处保存30~60分钟,显微镜下进行观察,如果背景尚佳,显色时间可长到16小时;
(26)停止缓冲液B的反应,用水进行简单的清洗;
(27)固红,脱水以及封片进行核的复染。