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(交流)原位杂交操作技术步骤

丁香园论坛

3090
原位杂交操作技术

一、准备实验所需的实验器材和试剂:
器材:染色缸(立式或卧式) 一个 量筒(配SSC和PBS用) 两只
处理好的盖玻片 小镊子 一个
(置瓷盘内150℃烤3小时备用)
另准备五个500ml试剂瓶(用来装DEPC水,1×PBS,2×SSC,含0.1%SDS的2×SSC,含0.1%SDS的0.1×SSC)
试剂:二甲苯 无水乙醇 90%乙醇
(0.1%DEPC处理的)双蒸水(灭菌1小时备用)
蛋白酶K(1mg/ml in PH8.0 TE)------ 分装后置-20℃保存
20×SSC 10×PBS
(DEPC处理的)含50%甲酰胺的杂交液(HS)--- 1ml分装后置-20℃保存
10×阻断液(10×BS)
Buffer I Buffer II Buffer III
探针(P) 抗Dig-Ap NBT/BCIP

二、操作流程:
1)  脱蜡至水:
二甲苯5min×2 → 90%乙醇5min → DEPC水洗涤5min×2
2)  杂交前处理:
1×PBS洗涤5min → 蛋白酶K(终浓度20ug/ml in PBS)37℃ 30min → 1×PBS洗涤5min×2 → 2×SSC洗涤5min
3)  预杂交:
滴加HS于室温预杂交30min
4)  杂交:(探针于HS中保存,可反复使用,每次杂交前变性)
探针(终浓度1ug/ml in HS)煮沸变性10min后冰浴 → 吸去HS后,每片滴加变性探针20ul左右 → 150℃烤过的盖玻片封片(注意不能产生气泡) → 置湿盒中80℃ 15min后转入42℃过夜
5)  杂交后洗涤:
2×SSC(含0.1%SDS)洗涤三次共30min → 0.1×SSC(含0.1%SDS)洗涤三次共30min
6)  加酶标抗体:
Buffer I 平衡5min → 加1×BS(in Buffer I) 室温 30min → 加抗Dig-Ap(1:500/1000 in Buffer II)室温3小时
7)  显色:
Buffer I(含0.3%Tween-20)洗5min×3 → 加Buffer III平衡4min → 吸去Buffer III后加NBT/BCIP(1:50 in Buffer III)置湿盒内避光室温过夜
8)  复染封片:
水洗终止显色 → 核固红复染2min → 常规脱水透明中性树胶封片(与免疫组化相同)

三、注意事项
1)  RNA杂交时,杂交前所用试剂均需用DEPC处理,所用器皿需150℃烤以去除RNA酶。
2)  DEPC处理双蒸水或其他试剂:蒸馏水或配好的试剂中加入0.1%DEPC → 充分振摇使油性的DEPC溶解 → 高压灭菌30min×2次 → 4℃保存
3)  所需试剂储备:
1M 马来酸(Maleic acid) PH7.5
0.5M Tris-Cl PH9.5
5M NaCl 1M MgCl 10% SDS
4)  试剂配制:
20×SSC : Nacl 175.3g(3M) 加水至1L,1N HCl调PH至7.0,
柠檬酸钠 88.2g(0.3M) (0.2%DEPC)高压灭菌,4℃保存。
10×PBS: NaH2PO4 4.2g 加蒸馏水至1L,调PH至7.0。
Na2HPO4 4.2g 高压灭菌,4℃保存
NaCl 87.5g
Buffer I: 1M 马来酸 PH7.5(0.1M) 100ml 加水至1L(高压灭菌)
5M NaCl(0.15M) 30ml
Buffer II: 0.1×BS in Buffer I
Buffer III: 0.5M Tris-Cl PH9.5(0.1M) 200ml 加水至1000ml
5M NaCl(0.1M) 20ml (高压灭菌)
1M MgCl2(50mM) 50ml
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