【交流】超高通量PCR仪－一次可做上万个qPCR

大家好，

Fluidigm BioMark 系统通过集成流体通路（Integrated Fluidic Circuit, IFC），将上万个微小管道、控制阀门集成到微板上，形成纳升（nL）量级的反应仓，不需特别移液器，就可以同时进行多达近万个常规qPCR (传统Taqman 或其他) 实验。操作简单，既有传统qPCR可定量之好处，又有基因芯片高通量耗材少之优点，能大幅提高实验效率及准确度。
· 单个细胞基因表达( Single Cell Gene Expression):
能同一时间最多对单细胞96个基因同时进行常规 qPCR 反应， 每个反应所用总试剂为6.75nl, 能有效解决单细胞基因表达分析样本量不够的问题，成为研究流通癌细胞 (circulating tumor cells, CTCs) 及干细胞的最佳手段。
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/19194462 (Nature 2009 Feb 14)
http://www.fluidigm.com/pr/publications.html
· 高通量基因分型（High Throughput Genotyping）
NCI 利用 96.96 Dynamic Array，使用更少试剂，在更短时间内进行 SNP 关联研究（一天可处理达70,000个基因型, call rate 为99%以上, 最高达99.7%）
http://cgf.nci.nih.gov/development/laboratory.html
· 突变检测 / 拷贝数变异（Copy Number Variation, CNV)
IFC把样品分到765 个6nL小反应仓，大幅提高样品浓度，进行 PCR 反应，能检测到极为微少之核酸, 并能分辨12个与13个之拷贝数变异，准确简单。史丹福大学研究员利用Digital PCR技术, 在无创产前检验方面, 取得重大突破并引起分子检验行业里的热烈兴趣 (在临床检查研究方面)
http://www.fluidigm.com/pdf/biomark/FLDM_BMK_MRKT00078b.pdf
http://www3.interscience.wiley.com/journal/121558049/abstract?CRETRY=1&SRETRY=0

厂家的专家下周会在北京天津做几个关于这个超高通量PCR仪的讲座，希望有兴趣的朋友去听听

2009/3/23  10：30-11：30 am  遗传与发育生物学研究所2号楼102会议室
集成流体管道（IFC）：一个集合基因芯片及实时PCR优点的新型突破性基因分析平台

2009/3/23  4-5pm  北京大学英杰交流中心306室  田小利
数码PCR （Digital PCR） 芯片： 检测基因突变、拷贝数变化（CNV），及基因分型之突破性平台

3月24日  10:00am-11:30 am  军科院实验技术楼417  岳文
数码PCR （Digital PCR） 芯片： 检测基因突变、拷贝数变化（CNV），及基因分型之突破性平台