【求助】sigma non-target shRNA对细胞影响
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使用了sigma的mission系列的慢病毒做干扰，用non-target作为对照，但是发现除了目的基因，对照与空白细胞变化不大以外，其他检测的几个基因对照和空白相比，变化都很大，这是为什么呢？除了off target效应以外，还有什么可能性？那我处理数据的时候，实验组到底是以空白作为对照好呢，还是以non-target作为对照好呢？
以non-target作为对照好
因为target及non-target都是往细胞转了外源物质，引起细胞生理/病理，或多或少的影响，只不过target设计上作用于你的目的基因，non-target不针对你的目的基因或其他基因（广义上），但都外源核酸，
而且还有转染时候用的转染试剂及无血清的影响
而空白细胞则没有任何外源的影响，
因为target及non-target都是往细胞转了外源物质，引起细胞生理/病理，或多或少的影响，只不过target设计上作用于你的目的基因，non-target不针对你的目的基因或其他基因（广义上），但都外源核酸，
而且还有转染时候用的转染试剂及无血清的影响
而空白细胞则没有任何外源的影响，
吴佰霖 wrote:
以non-target作为对照好
因为target及non-target都是往细胞转了外源物质，引起细胞生理/病理，或多或少的影响，只不过target设计上作用于你的目的基因，non-target不针对你的目的基因或其他基因（广义上），但都外源核酸，
而且还有转染时候用的转染试剂及无血清的影响
而空白细胞则没有任何外源的影响，
关键是non-target对细胞的影响太大了，比如MMP3的表达都上升了好几倍了。
再者，我的是筛选出来的稳定表达的克隆株。
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