【讨论】与靶基因不完全互补的microRNA还能影响mRNA水平的表达吗？
丁香园论坛
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最近在找一个micrRNA的靶基因，种子序列并不完全互补，但是mRNA水平是有变化的，百思不得其解，偶然发现一篇综述写道“ 最近的一些发现表明，miRNAs 与它们的靶基因只有部分互补的情形也会导致mRNA 的降解，但是目前还不清楚，翻译抑制是否发生在mRNA 的降解之前”，大家有碰到这样的情况吗？有相关的文献可否分享一下
互补导致翻译受阻也会造成翻译水平下降
互补导致降解也会下降
不完全配对也会可能互补反应
所以你的问题我无法明白，因为翻译抑制包括了MRNA降解这种可能。
互补导致降解也会下降
不完全配对也会可能互补反应
所以你的问题我无法明白，因为翻译抑制包括了MRNA降解这种可能。
miRNA 和siRNA 区别之一，就是，miRNA 在不完全互补的情况下，也能起到mRNA表达水平的影响的，提供一篇参考文献，希望起到抛砖引玉的作用。
不知道你做预测了没，mirna的靶基因预测是有评分的，不同的预测评分结果不同但总的原则基本相同。即使miRNA与靶基因序列不完全互补也有可能造成转录后抑制，这种情况下需要做后续的实验加以验证，比如从靶基因mRNA表达水平的检测以及蛋白水平的检测
另外评分不一定是准的。
不一定要microRNA序列与3‘UTR完全互补的，只要seed region互补就可以了。
所以microRNA研究中一定要有靶点鉴定，因为靶点预测分高的未必就是活性最强的那个，而且正如楼上说得评分也会有错误或者不准的地方，毕竟每一套体系都有自己的缺陷。靶点鉴定能做出来才好往下做功能研究
其实早在06年就有文献报道全新MicroRNA分析方法，但是这种方法一直没有得到重视，包括在后来09年他们又以此算法在nature发表了干细胞相关转录因子的调控miRNA，但是鉴于你的这种情况，我认为可能他们之间存在一个中间的调控分子。这样能更好的解释你观测到的现象。
个人观点，仅供参考！
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