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        【求助】miR的转录方向?

        丁香园论坛

        1725
        miR在宿主基因中表达方向有正有反,那么,构建表达载体(miR前体)的时候,方向的正反有关系吗?
        miR在"宿主基因"中表达方向 相同的话,这个miRNA与宿主基因一起转录,很可能共用同一个promoter

        miR在"宿主基因"中表达方向 相反的话,个人认为这个宿主基因不是该miRNA的宿主基因,是重叠基因,这个miRNA也就成为一个反义RNA
        看过文献,miR在"宿主基因"中表达方向 相同的话,这个miRNA与宿主基因一起转录,很可能共用同一个promoter,这个miR成为内含子miR。
        至于反方向的,没查文献,好像大家都避开了这个问题。
        至于构建载体,我认为方向无所谓吧,载体有启动子啊。个人观点,下一步我打算实验一下下。
        应该有关系,反了的话,可能表达出来另一个“东西”了(以编码链为模版,转录出的链与模板连“一致”了)。
        本人过表达载体的构建是将含有前体序列及上下游各100-150bp的侧翼序列共同构建入载体的。
        我确实看过反着连进去的文献。
        注意终止子(不是终止密码子!)的位置。虽然正相反相都可以形成发夹,但如果载体上没有终止子的话,那么就要注意目的片段的终止子一定要在发夹序列的下游。
        "目的片段的终止子"是指连进去的序列最后几个碱基吗?
        myskite wrote:
        "目的片段的终止子"是指连进去的序列最后几个碱基吗?

        是的,如果载体上没有转录终止子的话,就要在目的片段中包含转录终止子。
        pre-miR的终止子是什么呀?

        本文由丁香园论坛提供,想了解更多有用的、有意思的前沿资讯以及酷炫的实验方法的你,都可以成为师兄的好伙伴

        师兄微信号:shixiongcoming

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