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        【求助】如何研究新的调控转录因子基因表达的基因

        丁香园论坛

        4963
        我在课题中对一个转录因子的研究主要是研究转录因子及受到其调控的下游基因的功能研究,那用什么方法能发现调控这个转录因子基因表达的上游基因?
        是否能用酵母双杂交方法(了解不是很清楚)
        哪位高手能否帮忙回答一下,谢谢。
        有谁能否帮忙回答一下?
        首先声明,不是高手,仅发表个人拙见

        一般来说,可以找到与此转录因子同源的转录因子,看看是否在类似的信号通路上,以
        此来推断调控这个转录因子的上游蛋白,包括可能的调控这个转录因子的转录因子。
        当然,如果你能自己发现一个新的信号通路,也是相当不错的工作,nature science级别的文章就有了,但是基本上比较难
        一点拙见,找出这个转录因子的上游转录调控区序列,分析都有哪些转录调控结合序列Box,据此推测可能受哪些因子调控,然后可用EMSA等DNA-蛋白质结合检测方法确定真实的结合,然后构建报告基因,过表达预测的上游因子,检测该转录因子的转录表达。

        酵母双杂是蛋白-蛋白相互作用,除非你想寻找这个转录因子的相互作用蛋白。
        谢谢楼上两位,给我启发,谢谢啦!

        本文由丁香园论坛提供,想了解更多有用的、有意思的前沿资讯以及酷炫的实验方法的你,都可以成为师兄的好伙伴

        师兄微信号:shixiongcoming

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