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        【求助】怎么样知道NF-kB调控了哪些基因?

        丁香园论坛

        4163
        最近按照老板的要求在琢磨开题
        最近老板提出,
        经过刺激的巨噬细胞,引起了NF-kB的活化(活化我做过了)。
        能不能看一下,活化的NF-kB究竟引起的哪些基因的激活或者抑制。
        求教各位大虾,不知道这个想法能不能做?如果能做,谁知道怎么做不?能不能给提供些相关的文献。
        我自己也在积极寻找此类的文献。
        你的想法可以去做,但这方面已经有了较多的研究,你一定要有所创新。
        通常应该将NF-kB、巨噬细胞和某一疾病或病理特征(比如免疫系统疾病、肿瘤、过敏反应等)相关联。实验的方法较多,先去学习文献,你的思维会更开阔!
        不知你的专业如何,点击下面的网址:相关的文献目前有3276篇,可以找一些与自己专业相关的综述先读读:
        http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?db=pubmed&cmd=search&term=macrophages+and+NF-kB
        希望对你有帮助。
        应该说的具体些
        我就是研究疾病(老板不喜欢别人知道他研究什么,实在不好意思啊),巨噬细胞和NF-kB的之间的相关的连接。
        由于去年一直找工作,没心思看文献,现在终于静下心来学习。我学习的外文文献确实不多。
        谢谢帮助,我先看看你给的文献。看看有用的东西
        研究动脉粥样硬化?呵呵
        00501101 wrote:
        应该说的具体些
        我就是研究疾病(老板不喜欢别人知道他研究什么,实在不好意思啊),巨噬细胞和NF-kB的之间的相关的连接。
        由于去年一直找工作,没心思看文献,现在终于静下心来学习。我学习的外文文献确实不多。
        谢谢帮助,我先看看你给的文献。看看有用的东西
        哈哈
        我们研究的东西
        估计没几个人搞
        大家也没兴趣搞,哈哈哈
        感谢大家的帮助
        我强调下,我现在想知道
        怎么样去检测“活化的NF-kB究竟引起的哪些基因的激活或者抑制”
        如果我这样做可不可以说成,NF-kB特异性的调节了哪些基因呢?
        首先做了未刺激细胞和刺激细胞的基因芯片表达,显示出某些基因的表达发生变化;然后再把刺激后的细胞干扰掉P65,做干扰和未干扰的的基因表达差异。这两个情况表达共有差异的基因,是否可以说明这些差异的基因就是在我的这种刺激下,NF-kB所调控的特异的基因
        大虾给鉴定下,看看可以这样说吗?看到别人文献只做了一个NF-kB的特异的分子表达,而想到我这样可以不可以?
        还有,据我师兄好像说他看过,导入一个特定的空结构域什么的,可以测定基因表达差异,不太懂,不知道大家了解不了解。
        不知道你是做功能相关基因的变化情况还是做整个基因组的变化情况,如果相关基因比较多的话建议做基因芯片,可以快速检测目的基因的表达情况!
        基因芯片筛,比较贵
        建议楼主多看文献,这样你就会大概知道要做哪些基因了
        做全基因组表达谱芯片.看看到底哪些基因上调,哪些基因下调,这应该是最合适的方法了
        做全基因组表达谱芯片.看看到底哪些基因上调,哪些基因下调,这应该是最合适的方法了
        其实很简单,用NF-KB的抑制剂处理细胞,然后检测NF-KB下游的信号蛋白的变化,并可以分两种路可选,一是NF-KB的下游信号因子并不是很多,可以查查相关文献,选取关键而在你的研究方向中目前还没有touched,简单但没有太多新意。二是寻找新的下游信号信号了,也许你就可以发现新的通路了,这是创新。
        不错!能有所创新就好了!
        全基因组芯片是不行的,因为刺激巨噬细胞,活化的肯定不仅仅是NF-kappaB,一定还有很多其他信号通路参与,全基因组检测的是所有基因表达变化的最终结果,不一定是NF-kappaB激活的结果。
        要研究NF-kappaB对哪些基因起调控可以用ChIP-on-chip,这是用芯片直接检测NF-kappaB与哪些靶基因的结合的方法

        本文由丁香园论坛提供,想了解更多有用的、有意思的前沿资讯以及酷炫的实验方法的你,都可以成为师兄的好伙伴

        师兄微信号:shixiongcoming

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