作者：Cara Sutcliffe M.S. • Jill Pulley M.B.A. • Janey Wang M.S. • Brandon Martin • Dan Masys M.D. • Dan Roden M.D. Vanderbilt University School of Medicine, Nashville, TN 37232
摘要
实验目的：个性化医疗的愿景是通过定制预防方案、进行个性化诊断和个性化治疗等方法，改变医疗护理的现有方式。
大规模的、可分类的生物样品库可提供大量研究所必须的临床和遗传信息，是实现个性化医疗的先决条件。Vanderbilt DNA数据库项目建议通过整理废弃样本的DNA信息和关联相关的临床数据，同时生成临床的和遗传的这两类信息
实验方法：储存系统的设计是这个过程的关键组成部分，要求有稳健的后台、样品追踪方法和综合的质量控制步骤。我们的储存系统的主要用途是：验证样本适用于数据库，识别、提取、储存和控制DNA的分布。
实验结果：储存系统在每一个关键功能模块中都进行自动化整合和批量处理，这大大减少了实验误操作的风险和大大提高了实验通量。储存系统的初步功能都已经通过测试并在正常条件下运行。
结论：需要进一步进行样本存活条件下的测试。
一、获取样本
• 利用日常临床护理时收集的血液样本。相关样本处理流程：
1. 储存在Central Receiving Lab的架子上（-4°C）
2. EDTA管子上的条码关联Central Receiving Lab的一个ID
3. 丢弃样本（72+小时后）
• 样本收集量非常大（~1000/工作日，500/周末和假期）
1. 每个工作日早上由DNA Resources Core收集
2. 用手推车运送到DNA Resources Core
3. 质量控制-检测样本管的以下现象：
• 结块
• 破损的样本
• 交叉污染
• 丢失标签或无法读取条码
• 体积不足（现有protocol下<1ml)
出现这些现象的管子将被丢弃（~10%）
二、样本可用性检测和分类
1. 每一个管子上的Central Receiving Sample ID条码都被扫描，无需人工读取这些标签。
2. 样本可用性检测程序以条码ID与Central Receiving Database相关联，可在Medical Record Number中检索。
3. 利用 Medical Record Number，样本可用性检测程序可确定样本是否适合进入数据库。程序会确认样本的以下条件：
a. 一份已签署同意处理自身样本的协议
b. 并非从一个已退出项目的病人身上获得的
c. 从成年人身上获得的
d. 有医疗记录
4. 样本以SHA512方式加密，并与一个6位数字的位置代码相关联。
~undefined不可能从加密代码中确获得Medical Record Number，可确保病人隐私~K~Hdiv~M~Kp~M~K~Hp~M~Kdiv~M5._程序可检测样本是否重复或者该随机丢弃（Randomly Excluded）。
6. 预提取加工过程中，6位数字的位置代码标签会自动打印。
三、DNA的提取和储存
1. 利用Autopure LS from [Gentra Systems] 可进行DNA批量提取，记录所有信息，可与LIMS结合。
2. 每个样本可用fluorometric Hoescht assay进行定量，数据会自动地上传到LIMS。
3. 人类大分子量的DNA可利用凝胶成像确认。
4. 样本储存在一个自动化的可检索的系统中。
5. 所有血液样本在这个过程中被消耗。
四、样本检索和分配
1. 提交符合一定标准的样本的提取请求。
2. 请求到达自动化储存系统和检索系统。
3. 样本被检索。
4. 机械的液体处理设备将stock plate中的部分DNA转移到384孔板，96孔板或者管子中，用于终点分析和下游检测。
5. 提交请求的用户信息，DNA的消耗量，检索日期都会被自动记录。
6. 储存系统中剩余的DNA量和可被提取的DNA量等信息会被更新。
7. 大小合适的遗传信息会与可识别的医疗记录相关联，用于研究基因组与表型的相关性。另外这些数据会发送给具有已被批准的protocol和已签署协议的研究者。
五、数据的重新整合
• 研究者的研究结果，包括但不限于样本的基因型数据，会依次重新整合到数据库中。
腾泉生命科学（中国）有限公司系英资外商独资企业(总部位于上海)，专注于服务蓬勃发展的中国生命科技研发(Drug Discovery)事业，企业股东为欧洲最大的独立技术开发与创新集团TTPGroup。
腾泉(前身为TTP Labtech 中国代表处)作为全球知名的TTP Labtech 在中国的唯一代表机构，营销和支持Labtech 的全线产品；腾泉同时代理其它优秀的国外厂商的仪器产品如Apricot Designs(多道液体工作站)、Nexcelom Bioscience(高级细胞计数仪)、KBiosystems(封膜机、条码打印机、自动克隆挑取系统)、TAP Biosystems(全自动细胞培养系统、3D细胞培养)和JAN Scientific(UV蛋白晶体观察显微镜)。
2010年9月，腾泉通过收购上海丰泉生物科技公司，建立了从试剂到耗材的SPM一站式采购供应服务。此外腾泉还是众多国外知名试剂和耗材品牌的独家或一级经销商，如Hampton Research、Molecular Dimensions、Emerald BioSystems、Expression Systems、Microlytic、Anatrace和法国cisbio的HTRF试剂盒。我们的服务宗旨是：一点一滴、持之以恒，成为您身边最用心的供应商。
![十二烷基二甲基(3-磺丙基)氢氧化铵内盐 [用于生化研究]，14933-08-5，≥98%，阿拉丁](https://img1.dxycdn.com/p/s14/2024/0619/475/6370229598169633081.jpg!wh200)
