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        SDS-PAGE失败实例及分析第三期 前端指示剂缺失

        丁香园

        3967
        接上一期 SDS-PAGE失败实例及分析 之 条带过浅,本期就来讲讲由于前端指示剂缺失,而在产生的问题

        部分前端指示剂——例1

        为了装置凝胶花了不少功夫,如果停止电泳太晚就太可惜了。因为如果部分前端的指示剂已经跑出凝胶的话就不能确定各个条带相对应的迁移率了。

        这块胶有一个内部的刻度——也就是跑胶时带上了分子量标准(Marker)。由于条带较平直,任意条带都可以作为参考来确定跑胶的迁移率。

         


        前端指示剂缺失——例2

        这块胶跑胶时间过长以至于全部的指示剂都跑出凝胶。由于泳道有些扭曲,这就对相对迁移率的分析造成了困难。如果凝胶前端的指示剂完整,泳道之间的相对迁移率都可以做比较,哪怕是凝胶扭曲或者同一电泳槽两块凝胶的分离胶高度不一致。无论分离胶的绝对高度是否一致,相对迁移率对于组成均一的凝胶来说都是一致的。

         


        前端指示剂缺失——例3

        从这块胶曲率来看应该是属于由于两侧薄板之间结合稍微松弛形成的边缘效应(“皱眉”效应)。由于前端指示剂也是缺失的,因此很难准确分析其相对迁移率。但是如果有完整的前端指示剂作为参考线,即使存在“皱眉效应”也可以进行比较。

         

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