抗原设计

基因多态性检测芯片 由于遗传多样性，特别是SNP的多态性，使得不同个体对不同药物的反应不完全相同。通过研究遗传多样性与个体药物敏感性和耐受的相关性，不仅可以解释引起这些差异的根本原因，还能够在一定程度上指导特异性药物的开发。 如瑞士Roche公司目前和基因芯片生产商Affymetrix公司合作，推出了AmpliChip CYP450基因芯片。这款芯片能够检测p450家族中的CYP2 ...

结核耐药性检测芯片 结核病是一种高发病，如今世界上有1／3的人曾感染结核分枝杆菌，每年有800万新患者出现，300万人死于结核病，同时结核分枝杆菌耐药菌株持续增加。 为了指导化疗药物的选择、观察社会中耐药结核分枝杆菌的流行，有必要进行耐药性的药敏试验。目前结核分枝杆菌的药敏试验仍采用传统的绝对浓度法、比例法等。但由于结核分枝杆菌生长缓慢，而耐药菌株的生长更为缓慢，使耐药性测定需要6 ...

蛋白质组学研究生物质谱技术 对分离的蛋白质进行鉴定是蛋白质组研究的重要内容，蛋白质微量测序、氨基酸组成分析等传统的蛋白质鉴定技术不能满足高通量和高效率的要求，生物质谱技术是蛋白质组学的另一支撑技术。 生物质谱技术在离子化方法上主要有两种软电离技术，即基质辅助激光解吸电离(matrix―assisted laser desorption／ionization，MALDl)和电喷雾电离( ...

蛋白质组学研究色谱分析技术 由液相色谱、气相色谱、超临界流体色谱和毛细管电泳等所组成的色谱技术是现代分离、分析的主要组成部分。近年来色谱分析技术也取得了新的进展，大量新的高选择性、高分辨率色谱技术在蛋白质组学研究中发挥着不可替代的作用。其中，毛细管电泳(capillary electrophoresis，CE)、多维液相色谱1iquid chromatography，LC)等因具有多种分离 ...

蛋白质组学研究双相凝胶电泳分离技术 蛋白质组学研究主要依赖于大规模高通量分离和分析技术的进步，目前最成熟、最有效的技术仍然是双相凝胶电泳分离―生物质谱鉴定技术，即首先用双相凝胶电泳分离纯化蛋白质，结合计算机软件分析得到电泳图谱，再进一步用生物质谱技术对分离出的蛋白质进行鉴定，并运用现代生物信息学的技术对所得到的数据进行处理，对蛋白质及其执行的生命活动做出尽可能精细、准确及本质的阐述。下面简 ...

蛋白质组学研究蛋白质芯片 蛋白质芯片的研发是由基因芯片延伸而来，基因芯片技术早已商品化并应用于科学研究，蛋白质芯片的应用还比较局限。由于蛋白质分子自身的复杂性，以及针对不同用途和需要的蛋白质检测和鉴定，使蛋白质芯片的开发成为一项巨大的挑战。目前大多数蛋白质芯片每次只能分析少量的蛋白质。由于蛋白质是生命活动的直接承担者，因此蛋白芯片比基因芯片有更广阔的应用前景。 蛋白质芯片可检测蛋白 ...

蛋白质组学研究串联亲和纯化技术 酵母双杂交技术用于研究蛋白质―蛋白质间的相互作用，但由于其筛选步骤复杂、假阳性结果较多、难于量化，以及不易研究高级复合物间的相互关系，故远远不能满足大规模蛋白质组研究的需要，因此，与质谱联用的蛋白质纯化技术已成为当前蛋白质组学研究的重要工具。Rigaut等于1999年首先提出了串联亲和纯化(TAP)技术，它是利用一种经过特殊设计的蛋白标签，经过两步连续的亲和 ...

蛋白质组学研究酵母双杂交技术 酵母双杂交系统是在真核生物酵母中研究活细胞内蛋白质相互作用的技术，具有很高灵敏度，对蛋白质之间微弱和瞬间的作用也能够通过报告基因的表达产物敏感地检测到。酵母双杂交系统的建立基于对真核生物调控转录起始过程的认识。细胞起始基因转录需要有反式转录激活因子的参与，例如酵母转录因子GAL4含两个结构域：DNA结合功能域和转录激活结构域，前者可识别DNA上的特异序列，并使 ...

蛋白质组学研究策略 与基因组学相比，蛋白质组学的技术平台尚不完善，需不断优化和完善现有的平台，并建立与发展新的平台。目前尚没有合适的方法能一步实现对复杂蛋白质混合物的定性和定量分析，还必须把分离、鉴定、定量以及数据处理手段进行整合。文献报道的蛋白质组学研究策略多种多样，但是主要有两种路线：第一种是传统的二维凝胶电泳分离、胶内酶解与质谱技术鉴定相结合的方法，这也是目前最常用的一种路线；第二种 ...

蛋白质组学技术在医学研究中的应用 运用蛋白质组学研究手段，通过比较正常和病理情况下细胞或组织中蛋白质在表达数量、表达位置和修饰状态上的差异，可以发现与病理改变有关的蛋白质和疾病特异性蛋白质。这些蛋白质既可为研究疾病发病机制提供线索，也可作为疾病诊断的分子标记，还可作为疾病治疗和药物开发的靶标。 目前疾病蛋白质组学研究所依赖的技术平台仍然以二维凝胶电泳质谱技术为主，即首先用二维凝胶电 ...

十二烷基硫酸钠―聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS―PAGE) 第二相聚丙烯酰胺凝胶的选择主要取决于需要分离蛋白质的相对分子质量的范围，这与单相的聚丙烯酰胺凝胶电泳的选择是相同的。当蛋白质相对分子质量在15 000～200 000时，电泳迁移率与相对分子质量的对数呈线性关系。SDS―PAGE不仅可分离蛋白质，且可在一定范围内粗略测定蛋白质的相对分子质量。其主要步骤如下。 (1)凝胶配制及灌 ...

二维凝胶电泳质谱技术等电聚焦电泳 1. IPG的pH值范围 等电聚焦电泳(isoelectrofocusing，IEF)目前广泛使用商品化的IPG胶条。其pH值范围的选择一般遵循以下原则：①pH 3一10线性梯度胶适于了解样本中所有蛋白质的分布情况；②pH 3―10非线性梯度胶能提高pH 5―7之间的样本蛋白质解析度；③联合使用pH 4～7和pH 6～11梯度胶可获得相关pH范围的更 ...

二维凝胶电泳质谱技术蛋白质样品的制备 选择正确的样品制备方法是双相电泳实验成功的关键，根据实验设计和研究目的而选择不同的蛋白质样品制备方法。 1．蛋白质样品制备过程中须遵循的基本原则 蛋白质样品制备过程中须遵循的基本原则：①可以重复溶解包括疏水性蛋白质在内的所有蛋白质；②在等电聚焦电泳过程中，避免溶解性低的蛋白质聚积和析出；③减少蛋白质的化学修饰或蛋白质降解；④去除核酸、多糖和 ...

蛋白质点的鉴定 以质谱技术为基础的蛋白质鉴定技术，由于其灵敏度高(可以达到皮摩尔)、速度快、易实现自动化已经成为蛋白质组研究中主要的蛋白质鉴定技术。将胶上蛋白质点进行蛋白酶切、回收酶切肽段后，采用MALDI―TOF―MS测定肽质量指纹谱(peptide mapping fingerprint，PMF)，或采用电喷雾串联质谱(ESI―MS―MS)测定肽序列，分别进行数据库检索，实现蛋白质的鉴 ...

二维凝胶电泳质谱技术图像分析 目前主要的二维凝胶电泳专业图像分析软件有BIO―RAD公司的PDQuest 6．0、Amersham Pharmacia Biotech的Image Master 2D Elite和Genomic Solutions开发的Biolmage 2D Investigator等。Image Master 2DElite的操作界面较好，简便易学，且可处理各种来源的ti ...

条件性基因敲除与敲入 在生理学研究中，为了明确某一组织或器官的功能，常将实验动物体内所要研究的组织或器官切除，进而根据实验动物的生理指标或功能的变化来推测切除部分的功能。生命科学发展到今天，人们对于生命现象的认识已经逐步深入到了分子水平，而上述的“部分切除―观察整体―推测功能”的研究思想仍然有效。具体地说，就是在分子水平破坏想要研究的基因，然后观察生物体的生理指标、功能、整体形态、组织结构 ...

条件性基因敲除的基本原理Cre／loxP重组系统 条件性基因敲除主要是通过Cre／10xP或者Ftp／FRT重组系统来实现的。这两个系统都是位点特异性重组酶系统，已发展成为在体内、外进行遗传操作的有力工具。这两个系统的应用，可以使靶基因的表达或缺失发生在试验动物发育的某一阶段或某一特定的组织器官。此外，若与控制Cre或Flp表达的其他诱导系统相结合，还可以对某一基因同时实现时空两方面的调控 ...

条件性基因敲除的基本原理Flp／FRT系统 该系统与Cre／loxP系统相同，也是由一个重组酶和一段特殊的DNA序列组成。从进化的角度上考虑，Flp／FRT系统是Cre／loxP系统在真核细胞内的同源系统。其中．重组酶Flp是酵母细胞内的一个由423个氨基酸组成的单体蛋白。与Cre相似，Flp发挥作用也不需要任何辅助因子，同时在不同的条件下具有良好的稳定性。该系统的另一个成分Flp识别位点 ...

胚胎干细胞的囊胚注射法构建Cre转基因动物 先将Cre时空特异表达载体线性化，之后用电穿孔等方法将其导人胚胎干细胞中，并以同源重组的方式整合进胚胎干细胞的基因组。这种经过遗传改造的胚胎干细胞再被注入囊胚，最后将胚胎植入假孕母鼠的子宫，使其发育成为一个个体。囊胚注射法的具体步骤如下。胚胎干细胞囊胚注射法构建Cre转基因小鼠示意图 (1)选择合适的载体，将Cre重组酶的编码基因与其重 ...

受精卵雄性原核显微注射法构建Cre转基因动物 Cre转基因动物即时空特异性表达重组酶Cre的转基因动物。构建此动物的目的在于为loxP转基因动物提供重组酶Cre。由于在该转基因动物中Cre的表达被置于特异性启动子的调控之下，因此它会以组织细胞特异性和发育阶段特异性的方式向loxP转基因动物提供Cre重组酶，以便在特定的发育阶段、特定的组织细胞中使两个loxP之间的区域缺失。当然，实现此目标 ...