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【兴趣小组】《Guide to Protein Purification, 2nd Edition》读书笔记（二）http://www.dxy.cn/bbs/post/view?bid=65&id=16631165&sty=1&tpg=1&age=0下载千本书不如好好读一本书，承蒙FreeCell版主提供的资源，《Guide to Protein Purification, 2nd Edition》Methods in Enzymology, Volume 463http://www. ...

2008的ASMS已经闭幕了，这个鸟会规模越来越大了，很欣喜地看到越来越多的报告是蛋白质相关的应用，每一个报告都听一遍是不太可能了，大家可以选一些感兴趣的，我上传来大家一块学习学习。下面是所有报告的一些大主题，每一个主题下面都有五六个报告（这个题目太多了，就不一一列举了，可以到下面去查询 http://www.asms.org/Default.aspx?tabid=47 ），另外还想问一下行家，上传空间应该怎么搞定Monday, ...

文章标题：蛋白质技术：一篇关于衣原体对我影响很深的文章。作者：Klein M, Kotz A, Bernardo K, Kronke M.文题：Detection of Chlamydia pneumoniae-specific antibodies binding to the VD2 and VD3 regions of the major outer membrane protein.杂志全名（或缩写）：J Clin Microbiol.年份，卷(期)：2003 May;41(5)起止页码：1957-62摘要及翻译：Ab ...

Promoter Searching - Lecture LinksLecture 1: From mRNA to Genomic Sequence - Defining the Genomic Region• RefSeq: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/RefSeq/• NEDO: http://www.kazusa.or.jp/NEDO/• NEDO home: http://www.nedo.go.jp/bio-e/index.html• Kasuza home: http://www.kazusa. ...

(转自toda)：蛋白质结构功能区查询与分析：Pfam数据库Pfam is a large collection of multiple sequence alignments and hidden Markov models covering many common protein domains and families. For each family in Pfam you can:1. Look at multiple alignments2. View protein domain architectures3. Examine sp ...

蛋白质质功能预测 发信人: palomino (~快马加鞭~), 信区: Bioinformatics标 题: 蛋白质质功能预测发信站: 北大未名站 (2003年06月12日02:41:51 星期四), 转信───────────────────────────────────────作者 kingsyl (智者不惑,勇者不惧), 信区: Bioinformatics标题 蛋白质质功能预测时间 北大未名站 (2003年06月06日10:09:54 星期五), 站内信件─────────────────────────────────────── Global protein func ...

Allen He/何小姐，颂安！我是武汉的一位生物学科研人员，上次在水生所参加过一次您主讲的pet系统讲座，及其相关的内容，并且获得了会上派送的资料，非常感谢，novagen的这本册子对我帮助很大，感谢merck生化组，还有您何小姐给中国生物学工作者所作的努力！那天我在会上问到一个关于kan抗性机理的问题，我说的是kan基因编码一种磷酸转移酶，此酶将磷酸基团转移给卡那霉素，而使之灭活。我的问题是，这种磷酸转移酶是否像 ...

Sphingosines鞘氨醇Synthetic Sphingosines with C18 Sphingoid Base（合成鞘氨醇与十八类鞘氨醇碱）Synthetic Sphingosines with Sphingoid Bases other than C18合成鞘氨醇与类鞘氨醇碱比其他Synthetic Dihydrosphingosines（二氢鞘氨醇）3-Keto-Dihydrosphingosines （3酮-二氢鞘氨醇）Phytosphing ...

在不含动物成分的环境下生产的优质产品√ 使用不含动物成分的专门设备生产√ 现有产品包括细胞因子、生长因子及其他√ 在我们专门的不含动物成分的工厂中制造√ 在生产过程中未暴露于动物来源的成分√ 生物活性与标准实验室条件下生产的蛋白相当√ 内毒素水平低√ 科研或生物生产的绝佳选择√ 可提供更多证明文件R&D Systems的Animal-Free制造工序自2002年以来，我们一直在引进制造工艺，以便在无动物成分或副产物的环境下生产高品质的重组蛋白。在 ...

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蛋白质工程与新药开发 1978年，美国Hutchison使用了Lederberg于1960年推荐使用寡脱氧核糖核苷酸作为体外诱变剂，成功地实现了定位突变(site-directedmutagenesis)试验，培育出了多种具有生物学特性的突变株。1981年，美国Genen公司厄尔默(Ulmer)则将此定位突变试验冠以“蛋白质工程”。蛋白质工程的定义是：通过蛋白质化学、蛋白质晶体学和动力学的 ...

纳米粒靶向药物的传输和释放一、靶向传输 表面改性纳米粒另一个激动人心的应用是针对肿瘤和器官的靶向药物传输。如上所述，纳米粒在体内有长循环、隐性和立体稳定等特点。这些特点均有利于药物的靶向，是抗肿瘤药物、抗寄生虫药物的良好载体。 Kreuter等人利用聚山梨醇酯―80改性后的聚氰基丙烯酸丁酯纳米粒负载多种药物，使其成功地穿过血脑屏障。他们认为，改性后的纳米粒注入血液后，载脂蛋白 ...

蛋白质的分子结构 蛋白质分子的结构有4个严格的层次，即蛋白质的一级至四级结构。 蛋白质的一级结构(primary structure)是指多肽链的氨基酸残基的排列顺序。胰岛素的一级结构 线性的多肽链在空间中折叠成特定的三维空间结构，称为蛋白质的空间结构或构象。蛋白质的空间结构包括二级结构、超二级结构、结构域、三级结构和四级结构。 蛋白质二级结构(secondarystru ...

反向折叠法预测蛋白质的结构 蛋白质三维结构很大程度上决定了蛋白质的功能，因此如何获得蛋白质的结构并对基序分析研究是现代分子生物学的重要课题。目前应用X线晶体衍射图谱法和NMR法已测定出1万多种蛋白质及其复合物的结构。但与已测得的30多万种蛋白质序列相比，还有很大的差距，大大地影响了人们对蛋白质结构和功能关系的研究。因此，发展一种不依赖实验而又有一定准确性的理论蛋白质结构预测方法显得格外重要 ...

蛋白质的创造与改造 蛋白质的分子设计是蛋白质工程的一个重要方面。设计分成3类：①小范围改造，是对已知结构的蛋白质进行少数几个残基的替换，来研究和改善蛋白质的性质和功能。②较大程度的改造，就是对来源于不同蛋白质的结构域进行拼接组装，期望转移相应的功能。③蛋白质从头设计(denovo or ab initio protein design)，所谓蛋白质从头设计就是给定一个目标三维结构，要求找出 ...

蛋白质结构的测定(一)蛋白质一级结构的测定 蛋白质一级结构的测定又称蛋白质序列分析。其基本方法是：①应用化学裂解法和蛋白酶水解法将多肽链专一性裂解；②逐一测定每个纯化小肽段序列；③根据肽段氨基酸序列中的重叠区确定小肽段的排列次序；④完成整条多肽链的序列分析。 尽管蛋白质序列分析已经自动化，但仍然耗时、复杂并且昂贵。重组DNA技术出现后，人们可以从cDNA或基因序列直接推导出蛋白质的氨基 ...

比较建模法预测蛋白质的结构 比较建模法(comparative modeling method)是基于知识的蛋白质结构预测方法，又称为同源结构预测，是根据大量已知的蛋白质三维结构来预测序列已知而结构未知的蛋白质结构。 按照目前的定义，若待模型构建蛋白质的序列与模板序列经比对(alignment)后的序列同源性(sequence identity)在40%(也有人认为在35%)以上， ...

组织因子途径抑制物(TFPI)的结构和功能 组织因子途径抑制物(tissue factor pathway inhibitor，TFPI)是外源性凝血途径的天然抑制物，，它能与FXa直接结合并抑制其活性，形成的FXa/TFPI复合物，既可以与启动外源性凝血途径的FVIIa/TF复合物结合，同时可抑制其活性，从根本上阻止外源性凝血途径的活化。同时TFPI还具有抗炎、抑制血管平滑肌增生等生物活 ...

嵌台抗体和人源化抗体 免疫球蛋白的空间结构呈Y型，由二条重链和二条轻链通过二硫键相互连接而构成。每条链可分为可变区(N端)和恒定区(C端)，抗原的吸附位点在可变区，细胞毒素或其他功能因子的吸附位点在恒定区。每个可变区中有3个部分在氨基酸序列上高度变化，在三维结构上是处在臼折叠端头的松散结构(CDR)，是抗原的结合位点，其余部分为CDR的支持结构(FR)。不同种属的CDR结构是保守的，这样就 ...

蛋白质从头设计实例 长期以来，设计目标都是一些结构简单、规律明显的分子。最著名的是四螺旋捆结构，这个结构可以作为一个独立的折叠单位，易于独立研究。Degrado等应用“设计循环”的策略，在1986年完成了一个四聚体螺旋捆，每个单体为16个残基，这个序列仅使用Leu作为疏水残基，放在螺旋的内侧，用Lys或Glu作为极性残基，置于螺旋的外侧，每个螺旋用Gly(螺旋终结者)结束，而Gly又为将来 ...