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细胞功能测定

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N-端规则(N-end rule)

每一种蛋白质都有寿命特征 称为半衰期(half-life)。蛋白质的半衰期与多肽链N-端特异的氨基酸有关它们对蛋白质的寿命有控制作用。如末端是精氨酸或赖氨酸的多肽寿命就很短而末端是缬氨酸或甲硫氨酸的多肽寿命就很长。蛋白质N-末端与半衰期的关系称为N端规则。 ...

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蛋白酶体(proteasomes)

蛋白酶体既存在于细胞核中又存在于胞质溶胶中 是溶酶体外的蛋白水解体系 由10~20个不同的亚基组成中空的圆桶形的结构显示多种肽酶的活性,能够从碱性、酸性和中性氨基酸的羧基侧水解多种与遍在蛋白连接的蛋白质底物。蛋白酶体对蛋白质的降解是与环境隔离的。主要降解两种类型的蛋白质:一类是错误折叠的蛋白质另一类就是需要进行数量调控的蛋白质。蛋白酶体对蛋白质的降解通过泛素(ubiquitin)介导所以又称为泛素 ...

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核酶(ribozyme)

核酶一词用于描述具有催化活性的RNA 即化学本质是核糖核酸(RNA) 却具有酶的催化功能。核酶的作用底物可以是不同的分子 有些作用底物就是同一RNA分子中的某些部位。核酶的功能很多有的能够切割RNA 有的能够切割DNA 有些还具有RNA 连接酶、磷酸酶等活性。与蛋白质酶相比,核酶的催化效率较低,是一种较为原始的催化酶。 ...

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小分子RNA(small RNA)

存在于真核生物细胞核和细胞质中,它们的长度为100到300个碱基(酵母中最长的约1000个碱基)。多的每个细胞中可含有105 ~106 个这种RNA分子,少的则不可直接检测到 它们由RNA聚合酶Ⅱ或RNA聚合酶Ⅲ所合成 其中某些象mRNA一样可被加帽。主要有两种类型的小分子RNA:一类是snRNA(small nuclear RNA)存在于细胞核中;另一类是scRNA(small cytoplas ...

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反义RNA(antisense RNA)

反义RNA是指与mRNA互补的RNA分子 也包括与其它RNA互补的RNA分子。由于核糖体不能翻译双链的RNA,所以反义RNA与mRNA特异性的互补结合 即抑制了该mRNA的翻译。通过反义RNA控制mRNA的翻译是原核生物基因表达调控的一种方式,最早是在E.coli 的产肠杆菌素的Col E1质粒中发现的许多实验证明在真核生物中也存在反义RNA。近几年来通过人工合成反义RNA的基因 并将其导入细胞内 ...

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内含子(intron)

内含子是基因内的间隔序列不出现在成熟的RNA分子中在转录后通过加工被切除。大多数真核生物的基因都有内含子。 ...

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自我剪接(self-splicing)

具有自我催化能力将自身的某些部位切除的现象称为自我剪接。在酵母和真菌的线粒体mRNA和tRNA前体加工、叶绿体的tRNA 和rRNA前体加工、某些细菌病毒的mRNA前体加工中都发现了自我剪接现象。 ...

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肽酰转移酶(peptidyl transferase)

肽酰转移酶是催化肽键形成的酶。在蛋白质合成过程中,它催化核糖体A位tRNA上末端氨基酸的氨基与P位肽酰-tRNA上氨基酸的羧基间形成肽键。其结果使A位的氨酰-tRNA上的多肽延长了一个氨基酸而P位的氨酰-tRNA形成脱氨酰-tRNA。 ...

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核糖核酸酶P (ribonuclease P)

核糖核酸酶 P 是一种核糖核蛋白 含有一个单链RNA分子 长度为375个碱基 结合一个相对分子质量为20kDa的多肽(119个氨基酸残基)。RNA具有催化切割tRNA的能力 蛋白质则起间接的作用可能是维持RNA结构的稳定。该酶广泛存在于原核生物和真核生物(核仁、叶绿体和线粒体)中,也参与核糖体RNA的加工。 ...

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核剪接(nuclear splicing)

核剪接是指发生在细胞核中,主要是对hnRNA中内含子的剪接。这种剪接有三个主要特点∶一是在pre-mRNA中内含子与外显子间有特征性序列,即GT-AG规则;第二是剪接过程中需要snRNA参与,并要形成剪接体;第三要形成套索结构。

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GT-AG 规则(GT-AG rule)

前体RNA中参与内含子剪接的两个特殊位点,即在内含子和外显子交界处有两个相当短的保守序列:5'端为GT 3'端为 AG称为GT-AG规律。GT-AG规则主要适用于(或是全部)真核生物基因的剪接位点。说明内含子的切除有一共同的机理。应指出的是,这种保守性不适用于线粒体、叶绿体和酵母tRNA基因转录后的加工。 ...

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I型内含子(group I intron)

一类具有酶催化功能的内含子转录成RNA后可以自我剪接。此类内含子转录后可以形成9个由碱基配对形成的特定二级结构分别命名为P1至P9P1和P7是保守的。I型内含子具有自我剪接的功能在剪接反应中要有一种鸟嘌呤核苷(含有游离的3'-OH)G-OH。G首先结合到内含子的5'端当线性的内含子成为环状时其3'端可以距离5'端15个核苷酸以外从而将原来的5'端和15个碱基(或以上)的节段(包括G)切除出去。这种 ...

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剪接体(spliceosome)

在剪接过程中形成的剪接复合物称为剪接体剪接体的主要组成是蛋白质和小分子的核RNA(snRNA)。复合物的沉降系数约为50~60S它是在剪接过程的各个阶段随着snRNA的加入而形成的。也就是说在完整的pre-mRNA 上形成的一个剪接中间体。剪接体的装配同核糖体的装配相似。依靠RNA-RNA、RNA-蛋白质、蛋白质-蛋白质等三方面的相互作用。可能比核糖体更复杂,要涉及snRNA的碱基配对, 相互识别 ...

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II型内含子(group II introns)

主要存在于线粒体中的一类内含子,它的剪接位点类似于核编码结构基因的内含子并同样遵从GT--AG规律。剪接机理同核内含子的剪接相似也要形成一个套索的中间体通过形成5'-2'磷酸二酯键将要剪接的位点靠近到一起。但是II型内含子的剪接又不完全与核内含子的剪接相同它具有自我剪接的功能不需要剪接体和snRNA的参与也不需要ATP供能。从结构上看II型内含子的6个结构域可形成发夹环 结构域5与6之间只间隔3个 ...

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RNA编辑(RNA editing)

RNA编辑是指在mRNA水平上改变遗传信息的过程。RNA编辑是通过比较成熟的mRNA与相应基因的编码信息时发现的,成熟的mRNA序列中有几种意想不到的变化,包括U→C,C→U;U的插入或缺失、多个G或C的插入等。最典型的例子是锥虫(trypanosome)动质体(kinetoplastid)的线粒体基因mRNA的编辑涉及上百个U的缺失和添加。由于RNA编辑是基因转录后在mRNA中插入、缺失或核苷酸 ...

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向导RNA(guide RNA, gRNAs)

引导RNA编辑的RNA分子长度大约是60~80个核苷酸是由单独的基因转录的具有3'寡聚U的尾巴中间有一段与被编辑mRNA精确互补的序列5'端是一个锚定序列它同非编辑的mRNA序列互补。在编辑时形成一个编辑体(editosome)以gRNAs内部的序列作为模板进行转录物的校正 同时产生编辑的mRNA。gRNA3'端的oligo(U)尾可作为被添加的U的供体。 ...

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载脂蛋白(apolipoprotein B)

人的载脂蛋白有两种表达形式: apoB-48和apoB-100。该基因的序列在肝、肠组织细胞中是相同的但产物不同。在肝细胞中产物为4563个氨基酸残基的肽:apoB-100; 但在肠细胞中产物为只含2152个氨基酸残基的apoB-48 缺失了apoB-100的N端同LDL受体结合的结构域。原因是在mRNA水平上将2153位的谷氨酰胺的密码子CAA中的C编辑成为U形成一个终止密码子UAA结果 ...

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线粒体(mitochondrion)

线粒体是1850年发现的1898年命名。线粒体由两层膜包被外膜平滑内膜向内折叠形成嵴两层膜之间有腔线粒体中央是基质。基质内含有与三羧酸循环所需的全部酶类内膜上具有呼吸链酶系及ATP酶复合体。线粒体是细胞内氧化磷酸化和形成ATP的主要场所有细胞"动力工厂"(power plant)之称。另外线粒体有自身的DNA和遗传体系 但线粒体基因组的基因数量有限因此线粒体只是一种半自主性的细胞器。线粒体的形状多 ...

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外膜(outer membrane)

包围在线粒体外面的一层单位膜结构。厚6nm 平整光滑 上面有较大的孔蛋白 可允许相对分子质量在5kDa左右的分子通过。外膜上还有一些合成脂的酶以及将脂转变成可进一步在基质中代谢的酶。外膜的标志酶是单胺氧化酶。 ...

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内膜(inner membrane)

位于外膜内层的一层单位膜结构 厚约6nm。内膜对物质的通透性很低 只有不带电的小分子物质才能通过。内膜向内折褶形成许多嵴 大大增加了内膜的表面积。内膜含有三类功能性蛋白:①呼吸链中进行氧化反应的酶; ②ATP合成酶复合物; ③一些特殊的运输蛋白 调节基质中代谢代谢物的输出和输入。内膜的标志酶是细胞色素氧化酶。 ...

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