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生物芯片

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激光共聚焦生物芯片扫描仪的研究

摘要: 介绍一种采用双波长(532nm和635nm)激光器作为激发光源,基于激光共聚焦原理设计的生物芯片扫描仪。它采用一个光电倍增管分时实现cy3与cy5两种荧光信号的检测。生物芯片的横向扫描由远心f-θ扫描物镜与振镜实现,纵向扫描由步进电机驱动精密导轨实现。分析了激光扫描光路及光电倍增管对生物芯片扫描仪的分辨率、信噪比及灵敏度的影响.实验结果表明,本扫描仪的分辨率可达到5μm, ...

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光机二维扫描技术在激光共聚焦生物芯片扫描仪中的应用

摘要: 介绍了应用于激光共聚焦生物芯片扫描仪中的光机二维扫描技术,即用振镜和f-θ扫描物镜构成其中一维的光扫描系统,用步进电机驱动扫描工作台移动构成另一维机械扫描系统,并在此基础上分析研究了光机二维扫描控制系统的设计。为快速、高精度激光共聚焦生物芯片扫描仪的研制作了新的有益尝试,并取得了初步的实验结果。 引言 生物芯片技术是近年来生命科学、微电子学、微机械、计算机、物理及化学等多领域、 ...

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激光共聚焦生物芯片扫描仪设计

一、前言 生物芯片是指在微小的基片如玻璃、硅片、有机材料薄膜上通过光引导化学合成或湿法刻蚀等方法制造的生物分子探针阵列。生物芯片可广泛应用于基因组测序,临床诊断,药物筛选,环境监测等许多方面。 激光共聚焦生物芯片扫描仪是指通过光电信号转换将生物芯片上的反应结果转变成可供分析处理的数字图像的扫读装置,分辨率高、性价比好。这种仪器是扫读荧光染料标记的生物芯片的两大主要类型仪器之一。 扫描台就是承载生物 ...

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生物芯片扫描仪光学系统构型研究

摘要: 本文首先讨论了CCD型生物芯片扫描仪的基本原理,并在此基础上详尽分析了几种典型扫描仪的光学系统构型的优缺点。最终提出了CCD型生物芯片扫描仪光学系统的设计准则,并依据这一准则设计构建了一种新颖的CCD型生物芯片扫描仪。 引言 生物芯片是指通过微缩技术将生物学研究中诸多不连续的分析过程集成于玻璃片、硅片等固相载体上,使这些分析过程连续化、集约化、微型化和高度信息化。生物芯片按构建方式可以分为 ...

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CCD微阵列生物芯片扫描仪的研制

摘要: 报导了CCD微阵列生物芯片扫描仪的光学系统,给出了光学系统的参考标准构型,并依据此构型研制出多分辨率CCD生物芯片扫描仪。实验采用不同浓度系列Cy3 NHS ester的DMS0溶液样点与微池溶液测定CCD生物芯片扫描仪的检测性能。初步实验数据表明,此扫描仪光路合理,精度满足生物芯片检测要求。 引言 生物芯片技术(Biochip Technology)是指通过微加工技术、微流量控制技术、微 ...

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类神经的微芯片(图)

使用以人脑的神经系统为基础研制出的高能效集成电子元件,能制成可植入眼内的硅视网膜以恢复视力,也可用作机器人眼和其他智能传感器。 在这张美术图里显示的可植入眼内的硅视网膜,能模仿眼睛的天然功能,从而帮助某些类型的眼盲病人恢复视力。1997年,IBM超级电脑“深蓝”在那场举世闻名的比赛中险胜国际象棋世界冠军Garry Kasparov(卡斯帕罗夫)。它依靠纯粹的& ...

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基因芯片——生物信息精灵

基因芯片,也叫DNA芯片,是在90年代中期发展出来的高科技产物。基因芯片大小如指甲盖一般,其基质一般是经过处理后的玻璃片。每个芯片的基面上都可划分出数万至数百万个小区。在指定的小区内,可固定大量具有特定功能、长约20个碱基序列的核酸分子(也叫分子探针)。 由于被固定的分子探针在基质上形成不同的探针阵列,利用分子杂交及平行处理原理,基因芯片可对遗传物质进行分子检测,因此可用于进行基因研究 ...

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半导体芯片的兄弟——生物芯片(图)

可能大家都知道“因特网”和“计算机”是当今最流行的名词。计算机已经成为我们日常生活中的必备工具,那请问一句“你的计算机CPU用的是什么芯片呢?”是“Intel”,还是“AMD”呢?其实无论是“Intel”还是“AMD”,它们在本质上 ...

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基因芯片简介

基因芯片是通过特殊方法将大量特定序列的基因探针有序地固化在1平方厘米的玻璃或硅衬底上,而构成有大量生命信息储存的芯片,与计算机的电子芯片十分相似。科学家让芯片上这些成千上万的探针分子,与想要检测的带有标记的基因样品进行杂交,通过杂交信号的强弱判断样品上某些生物分子的数量、活性(表达力)。因为它一次可对大量核酸分子进行检测分析,所以它能在同一时间内分析大量的基因,使人们准确高效的破译遗传密码。它是继 ...

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Blast基本介绍

什么是BLAST? BLAST(Basic Local Alignment Search Tool)是一套在蛋白质数据库或DNA数据库中进行相似性比较的分析工具。BLAST程序能迅速与公开数据库进行相似性序列比较。BLAST结果中的得分是对一种对相似性的统计说明。 BLAST 采用一种局部的算法获得两个序列中具有相似性的序列。如果您想进一步了解BLAST算法,您可以参考NCBI的BLAST Cou ...

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生物芯片入门(五):应用

基因芯片技术及其研究现状和应用前景 生物芯片技术是随着“人类基因组计划”(human genome project,HGP)的进展而发展起来的,它是90年代中期以来影响最深远的重大科技进展之一,它融微电子学、生物学、物理学、化学、计算机科学为一体的高度交叉的新技术,具有重大的基础研究价值,又具有明显的产业化前景。生物芯片技术包括基因芯片、蛋白质芯片、细胞芯片、组织芯片、以及 ...

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生物芯片入门(四):基因表达谱芯片实验操作2

杂交 互补杂交要根据探针的类型、长度以及研究目的来选择优化杂交条件。如用于基因表达检测,杂交时需要高盐浓度、样品浓度高、低温和长时间(往往要求过夜),但严谨性要求则比较低,这有利于增加检测的特异性和低拷贝基因检测的灵敏度;若用于突变检测,要鉴别出单碱基错配,需要故需要在短时间内(几小时)、低盐、高温条件下高严谨性杂交。多态性分析或者基因测序时,每个核苷酸或突变位都必须检测出来,通常设计出一套四种寡 ...

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生物芯片入门(三):基因表达谱芯片实验操作1

待检测样品制备 生物样品往往是非常复杂的生物分子混合体,除少数特殊样品外,一般不能直接与芯片反应,必须将样品进行生物处理。从血液或活组织中获取的DNA/mRNA样品在标记成为探针以前必须扩增以提高阅读灵敏度,但这一过程操作起来却有一定的难度。比如在一个癌细胞中有成千上万个正常基因的干扰,杂合癌基因的检测和对它的高效、特异地扩增就不是一件容易的事。因为在一般溶液中PCR扩增时,靶片段太少且不易被凝胶 ...

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生物芯片入门(二):制作和结果分析

芯片的构建和阅读 摘要 制作芯片和获得芯片的数据有许多不同的方法。这里我们介绍了在学术领域中两种芯片的构建和使用。除了详细说明了技术细节外,我们还对组成和方法的优缺点进行了评论,同时还介绍了杂交的方法。用我们所建立和使用芯片的方法来回答生物领域问题的事实证明了这种技术在大学的环境下是可行的。 一种获得基因功能信息的高通量的方法是cDNA芯片。在一块显微镜载玻片上包含了几百至几千个固定的DNA样本, ...

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生物芯片入门(一):生物芯片及应用简介

一、简介 生物芯片(biochip)是指采用光导原位合成或微量点样等方法,将大量生物大分子比如核酸片段、多肽分子甚至组织切片、细胞等等生物样品有序地固化于支持物(如玻片、硅片、聚丙烯酰胺凝胶、尼龙膜等载体)的表面,组成密集二维分子排列,然后与已标记的待测生物样品中靶分子杂交,通过特定的仪器比如激光共聚焦扫描或电荷偶联摄影像机(CCD)对杂交信号的强度进行快速、并行、高效地检测分析,从而 ...

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蛋白质芯片的研究意义、分类和芯片的制备

研究蛋白质芯片的意义: 1、蛋白质是基因表达的最终产物,接近生命活动的物质层面; 2、探针蛋白特异性高、亲和力强 可简化样品前处理,甚至可直接利用生物材料(血样、尿样、细胞及组织等)进行检测; 3、适合高通量筛选与靶蛋白作用的化合物; 4、有助于了解药物或毒物与其效应相关蛋白质的相互作用。 蛋白质芯片的分类: 1、蛋白质检测芯片; 2、蛋白质功能芯片。 蛋白质芯片的制备: 1、固相载体及其处理 载 ...

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液态芯片的原理

编码微球:分别用不同配比的两种荧光染料将直径5.6μm的聚苯乙烯微球(Beads)染成不同的荧光色,从而获得多达100种经荧光编码的微球。 交联探针、抗体或抗原:把针对不同检测物的核酸探针、抗体或抗原以共价方式结合到特定荧光编码的微球上。 检测反应:先把针对不同检测物的、用不同荧光色编码的微球混合,再加入被检测物(可以是血清中的抗原、抗体或酶等,也可以是PCR产物)。 悬液中的微球与被检测 ...

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SELDI系统的简介和操作流程(图)

产品详细描述 ProteinChip SELDI系统用于从大量复杂生物学样品中快速获得蛋白质分子量图谱,发现Biomarker。它使用表面增强的激光解吸离子(Surface Enhanced Laser Desorption/Ionization)技术来捕获、检测和测量复杂生物样品中的肽段和蛋白质的分子量。 蛋白质芯片所独特拥有的化学修饰表面使得该技术能够与其他基于分子量的分析系统相区别。SEL ...

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表达谱基因芯片实验操作流程

一、试剂 1. TRIzol  2. 异丙醇  3. 氯仿  4. 75%乙醇(RNase-free)  5. Milli-Q水(RNase-free)  6. 无水乙醇  7. dNTPs  8. Cy5-dCTP和Cy3-dCTP  9. 杂交试剂1  10. 标记试剂I  11. 杂交试剂2  12. 标记试剂II  13. 反转录酶  14. 标记试剂III  15. 反转录引物  16. ...

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管盖基因芯片检测仪

管盖基因芯片是将基因探针固定在特制的管盖内表面,与内置杂交贮液池的Eppendorf管一起构建的基因检测器件。在一个全封闭的管内,完成基因扩增,荧光标记,芯片杂交及检测等一系列生物化学操作,实现多基因高通量并行检测。本文报道了一种用于管盖基因芯片的检测分析系统,它包括光学检测平台、图像采集系统、图像分析系统及结果报告系统。光学检测平台利用尼康显微镜光学系统,通过电荷耦合器件(CCD)的进行图像采集 ...

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