蛋白组学

这是一个值得骄傲的中国人的工作，第一块真核生物全蛋白组芯片就出自他手，下面是他近来发表的文章：1. *H Zhu（Heng Zhu）, JF Klemic, S Chang, P Bertone, A Casamayor, KG Klemic, D Smith, M Gerstein, MA Reed, M Snyder. Analysis of yeast protein kinases using protein chips. Nat. Genet. 26: 283 -9 (2000).2. *H Zhu , M Bilgin, M Snyder. Proteomics Ave. Rev. Bioc ...

1994年澳大利亚Macquarie大学的Wilkins和Williams首先提出了蛋白质组（Proteome）的概念，它源于蛋白质（Protein）与基因组（Genome）两个词的组合，其定义为在一种细胞内存在的全部蛋白质。蛋白质组学（proteomics）近年来已经迅速发展成为了热门学科。蛋白质组学以基因组编码的所有蛋白为研究对象，从细胞水平及整体水平上研究蛋白质的组成及其变化规律，从而深入认识有机体的各种 ...

蛋白质组学（Proteomics）90年代初期开始实施的人类基因组计划，在经过各国科学家近10年的努力下，已经取得了巨大的成就。不仅完成了十余种模式生物（从大肠杆菌、酿酒酵母到线虫）基因组全序列的测定工作，还有望在2003年提前完成人类所有基因的全序列测定。那么，知道了人类的全部遗传密码即基因组序列，就可以任意控制人的生老病死吗？其实并不是这么简单。基因组学（genomics）虽然在基因活性和疾病的相关性方面为人 ...

　基因组(genome)包含的遗传信息经转录产生mRNA，一个细胞在特定生理或病理状态下表达的所有种类的mRNA称为转录子组(transcriptome)。很显然，不同细胞在不同生理或病理状态下转录子组包含的mRNA的种类不尽相同。mRNA经翻译产生蛋白质，一个细胞在特定生理或病理状态下表达的所有种类的蛋白质称为蛋白质组(proteome)。同理，不同细胞在不同生理或病理状态下所表达的蛋白质的种类也不尽相同。蛋白 ...

自从人类基因组计划启动以来，公共媒体不断向大众勾画着一幅幅美丽的图景，使人们认为，一旦科学家把各种生物基因组的全部碱基排列顺序测定清楚，生命的遗传奥秘就会显露无余。但是，真实的图景远不像普通人想象的那样简单。遗传信息并不直接参与生命活动，而是通过控制蛋白质的形成间接地指导有机体的新陈代谢。也就是说，一个基因所含的遗传信息，通过一系列复杂的反应，最终导致了相应的蛋白质形成，蛋白质再参与到生命的各种活动中去。所以， ...

译自：Valerio, et al. Maldi-TOF analysis of portal sera of pancreatic cancer patients: identification of diabetogenic and antidiabetogenic peptides. Clinica Chimica Acta, 2004, 343:119-127约80％患者在诊断胰腺癌时合并糖尿病，其原因及病理生理机制目前仍未明确。胰腺癌合并糖尿病的患者胰岛素分泌改变和外周胰岛素抵抗两者至 ...

2007年临床蛋白质组学专题会21世纪的医学科技是生物学与医学相互促进、突飞猛进的黄金时代。随着人类后基因组学研究的不断深入，临床蛋白质组学研究方面难解的迷团已清晰地展示在人们面前。同时，中外科学家在临床蛋白质组学方面的跨领域前沿合作也取得了令人振奋的进展。这些成绩和成果的取得，一方面证明全世界在临床蛋白质组学方面已取得了长足的进步，同时又给各医疗和科研机构实验室的检测技术和检测项目提出了一些新的课题。因此 ...

内容提要：1994年，澳大利亚Macquarie大学的Wilkins和Williams首先提出了蛋白质组（Proteome）的概念，它源于蛋白质（protein）与基因组（genome）两个词的杂合，定义为一个基因组所表达的蛋白质。通过研究这些蛋白的全部形式和活性，以及它们如何在生物体发育或对疾病应答反应中的变化，可以促进我们对系统水平的细胞行为的认识。同时，通过鉴定新的药物的靶分子和发展新的诊断标记，临床研究也 ...

附件1“中国人类肝脏蛋白质组计划”重大专项课题申请指南项目1、人类健康肝脏蛋白质组表达谱确定健康肝供者、规范化采样和样品制备的标准；建立中国人健康肝脏组织和细胞系样本库；建立蛋白质组表达谱共性技术平台，实现高通量和高灵敏度。以健康成人的肝脏样品和人肝细胞系为重点研究对象，规模化分离鉴定人类肝脏表达蛋白质组、亚细胞器表达蛋白质组以及低丰度表达蛋白质组，构建人肝组织蛋白质组表达谱数据库。项目2、人类肝脏ORF组和 ...

90年代初期开始实施的人类基因组计划，在经过各国科学家近10年的努力下，已经取得了巨大的成就。不仅完成了十余种模式生物（从大肠杆菌、酿酒酵母到线虫）基因组全序列的测定工作，还有望在2003年提前完成人类所有基因的全序列测定。那么，知道了人类的全部遗传MM即基因组序列，就可以任意控制人的生老病死吗？其实并不是这么简单。基因组学（genomics）虽然在基因活性和疾病的相关性方面为人类提供了有力根据,但实际上大部分 ...

1 背景和意义从生命活动的直接执行者——蛋白质的角度研究生命现象和规律（特别是疾病防治和病理研究）已成为研究生命科学的主要手段。而这些研究往往离不开对细胞、组织或器官中含有蛋白质种类和表达量的研究。对处不同时期、不同条件下蛋白质表达水平变化的研究，识别功能模块和路径，监控疾病的生物标志物，这些研究都需要对蛋白质进行鉴定和定量。生物质谱技术的出现和不断成熟为蛋白质差异表达分析提供了更可靠、动态范围更广的研究手段。基于 ...

Pevzner教授 Do-It-Yourself 蛋白质组学课程Budding bioinformaticists in Pavel Pevzner's undergraduate research experiences class looked at the proteins found in a bacterium and worked backward to identify the genes that created them.The course was not for the faint of heart. Undergradua ...

蛋白质组研究的技术策略与应用Development and Application of the Strategies on Proteome Research钱小红基因组(genome=gen+ome):生物体所拥有的全套染色体上的全部基因转录组(transcriptome=transcript+ome):一种细胞，组织，或生物体完整基因组所对应的全套mRNA蛋白质组(proteome=prote+ome):一种细胞、组织或生物体完整基因组所对 ...

当然啦,不只是蛋白组学会议,还有一些RNA干扰等方面的东东.Meetings DiaryRNAi3–4 November 2003, Boston, MA, USAWebsite: http://www.lifesciencesinfo.com/email/3003/Future Challenges for Target Validation3–4 November 2003, London, UKWebsite: http://www.marcusevans.com/EVENTS/ ...

2011年上海药物所与芝加哥大学Ben May癌症研究所赵英明教授合作，组建化学蛋白质组学研究中心，开展高效、灵敏、可靠的蛋白修饰调控酶靶标发现及生物标记物鉴定新技术的研究工作，探索更为快速和有效的新药研究途径。中心成立后，赵英明教授、谭敏佳博士等研究人员即开展相关研究工作，并取得重要进展，他们与上海药物所叶阳研究员及相关国际团队通力合作，发表在国际顶尖杂志《细胞》上关于组蛋白翻译后修饰系统研究的论文，近日被《细胞》 ...

1 背景和意义从生命活动的直接执行者——蛋白质的角度研究生命现象和规律（特别是疾病防治和病理研究）已成为研究生命科学的主要手段。而这些研究往往离不开对细胞、组织或器官中含有蛋白质种类和表达量的研究。对处不同时期、不同条件下蛋白质表达水平变化的研究，识别功能模块和路径，监控疾病的生物标志物，这些研究都需要对蛋白质进行鉴定和定量。生物质谱技术的出现和不断成熟为蛋白质差异表达分析提供了更可靠、动态范围更广的研究手段。基于 ...

Q：SWATH技术的原理是什么？我为什么要做SWATH？A：SWATH采集模式是一种新型的MS/MS扫描技术，将扫描范围划分为以25Dalton为间隔的一系列区间，通过超高速扫描来获得扫描范围内全部离子的所有碎片信息，是MS/MSALL技术的扩展。SWATH技术可以用于蛋白质定量或蛋白复合体的鉴定。SWATH定量方法基于提取Transition峰面积计算出肽段含量，通过肽段含量推理出蛋白质含量。SWATH定量 ...

一、SWATH技术简介SWATH（Sequential WindowAcquisition of all Theoretical fragment ions）是瑞士苏黎世联邦理工学院的RuediAebersold 博士及其团队与AB-SCIEX于2012年联合推出的一项全新的质谱采集模式技术，是MS/MSALL技术的一种扩展。以蛋白质组学样品分析中常见的扫描范围400 ～1200 为例，每25 Dalton 作为一个扫描间隔SWATH），每个SWATH ...

蛋白质组（proteome）一词是澳大利亚科学家Williams和Wilkins于1994年首先提出的，它是指一个细胞或一个组织基因组所表达的全部蛋白质总和，是对应于一个基因组的所有蛋白质构成的整体。短短20年间，蛋白质组的研究取得了惊人的进展，这相当程度上要归功于质谱技术在蛋白质组中的应用和不断发展。同时，蛋白质组和基因组的发展是相辅相成的，凡是经过基因组测序的物种，都可以用质谱技术大规模鉴定其蛋白质组成。 ...

一、概述 随着人类基因组计划的实施和推进，生命科学研究已进入了后基因组时代。在这个时代，生命科学的主要研究对象是功能基因组学，包括结构基因组研究和蛋白质组研究等。基因组学虽然在基因活性和疾病相关方面提供了有力根据，但基因的表达方式错综复杂，同样的一个基因在不同条件下、不同时期可能起到完全不同的作用。因此，研究生命现象，阐释生命活动的规律，只了解基因组的结构是不够的，还需对生命活动的直接执行者——蛋白质进行更深入的研究 ...