蛋白组学

本文由丁香园站友 riset 转载，点此查看详情 人体皮肤受伤后，骨髓干细胞会赶到伤口处并变身成皮肤细胞，修复损伤。但骨髓干细胞是受到谁的指挥呢？英国和日本科学家最近发现了这个“指挥员”——HMGB1蛋白质。 英国伦敦国王学院的约翰·麦格拉思在最新一期美国《国家科学院院刊》（PNAS）上报告说，皮肤受损时，人体就会释放出HMGB1蛋白 ...

本文由丁香园站友 Docofsoul 转载并编译，点此查看详情 《每日科学》2011年3月15日报道——研究者终于成功解决了一个长期以来困扰医学界的关键生物受体三维结构难题。这一发现有望在众多领域（包括关节炎、呼吸系统疾病、伤口愈合等等）加速新药开发：因为化学家由此能够更好更方便地检测与设计用于实验性药物的相关分子。 上图显示科学家最近确定的腺苷A2A受体结构（围绕着其合 ...

阐明蛋白质如何调控配体门控离子通道，以及这些蛋白质的信号协调方式，是非常有必要的。最近有研究表明，几乎绝大多数通道本身就是蛋白信号复合物的一部分。在本视频中我们将解释如何识别结合P2X2受体胞浆域C端末端的蛋白质。

将数字微流体（DMF）与一些样品处理过程组合在一起以应用于自动化临床蛋白质组学，包括蛋白质提取、再增溶作用、还原作用、烷化以及酶处理。

镰刀菌能够产生不同的毒素，本视频示范如何从镰刀菌种中诱导毒素的生成以及萃取蛋白质用于蛋白质组学研究。

蛋白质与蛋白质组分析生物信息学 生物信息学的主要目的之一是理解蛋白质的氨基酸序列和三维结构之间的关系。一旦关系的规律被确定，就能根据氨基酸序列预测蛋白质的空间结构。但是，序列与结构之间的关系并不简单。以序列和结构为基础对蛋白质进行分类已取得一些进展，这些信息对蛋白质结构模型的构建很重要。 预测二级结构的算法中使用了多种计算方法，其中包括神经网络、离散态模型、隐马尔可夫模型、最近邻分 ...

蛋白质组分析中的初步分离 在分析质谱产生的二维图谱上的蛋白质斑点时，看起来似乎只有通常含量比较高的蛋白质(编码偏倚指数大于0．2)才能彻底被鉴定出来。因而，二维胶上的斑点数量不能代表可以分析的全部表达的基因的数量或种类。Gygi等(2000)曾经计算过，在二维作图的早期阶段，如果只装入40ug酵母溶出产物，那么只有丰度超过至少51 000拷贝(每个细胞)的多肽才能被检测到。如果起始的蛋白质 ...

蛋白质组学同位素标记的亲和标签方法 Aebersold和其合作者开发了一种同时对蛋白质组进行鉴定和相对定量的方法，即一种包含在无胶蛋白质组流程中的同位素标记技术(Gygi等，1999)。他们提出使用一种试剂，这种试剂能够使两种同位素在形式上具有明显的区别，即同位素标记的亲和标签(isotopicallycodedaffinitytag，ICAT)试剂。ICAT试剂的结构包含一个生物素头部、 ...

蛋白质组学表面增强激光解吸电离方法 表面增强激光解吸电离(surface-enhanced laser desorption／ionization，SELDl)技术基于MALDI技术，利用了其测量部分。SELDI涉及一个在特殊化学表面的亲和俘获过程，随后利用激光解吸电离探测进行质量分析(Merchant和Weinberger，2000)。 SELDI过程可以描述为4个部分。 ...

勃起功能障碍是男性最常见的糖尿病引起的并发症之一，目前评估表明，多达75％的男性糖尿病患者会有一定程度的勃起功能障碍，而且在许多病例中糖尿病患者会有更严重的勃起功能障碍，对常用勃起药物反应较差。细胞分析蛋白组学三月份有篇研究报道，来自凯斯西储大学和阿尔伯特爱因斯坦医学院的研究人员证实随着糖尿病诱发ED的发生，出现了分子的改变，这可以作为帮助确认ED风险的标记以及作为潜在的药物靶点。

美国研究人员日前报告说，他们发现小鼠体重与一种名为FIH的蛋白质有关，这一发现为研制减肥药物提供了新思路。美国加州大学圣迭戈分校的研究人员在新一期美国《细胞—代谢》（Cell Metabolism）杂志上报告说，FIH是一种负责调节缺氧反应的蛋白质，缺乏这种蛋白质的小鼠会保持苗条和健康，哪怕它们进食的是高脂肪食物。

本研究运用定量蛋白质组学的技术手段，首次发现了一系列与NAFLD发生发展密切相关的肝脏蛋白质群，包括参与脂肪酸氧化的酶，线粒体呼吸链蛋白和细胞骨架蛋白，从蛋白水平揭示了NAFLD发生发展的可能分子机制。

瑞士联邦技术学院的研究人员开发出一种在问号钩端螺旋体（Leptospira interrogans）这种病原体中定位蛋白复合物的新方法，称为“可视蛋白质组学”。文章发表在本期的《自然-方法学》上。

当您在研究用药物、细胞因子、抑制剂、病毒等作用细胞后细胞因子、信号通路（磷酸化）分子、免疫受体分子、细胞凋亡分子、干细胞标记分子、血管生成标记分子、肥胖症标记分子相关等蛋白分子表达变化的高通量初步筛选与定量检测时，面对大规模的WB实验，您是否烦躁了呢？面对表达量很低的蛋白，转膜造成的蛋白的丢失，您是否困惑啦？有一种方法可以解决上面的问题。它不需要特殊仪器，6小时最多能检测59种蛋白分子。它比WB的灵敏度高100倍左右；是WB方法和Elisa方法的融合，更有创新，比这两种方法更简单。它就是R&D Systems公司生产的蛋白芯片。

1.氨基酸（amino acid）：是含有一个碱性氨基和一个酸性羧基的有机化合物，氨基一般连在α-碳上。是蛋白质的构件分子。 2.必需氨基酸（essential amino acid）：指人（或其它脊椎动物）（赖氨酸，苏氨酸等）自己不能合成，需要从食物中获得的氨基酸。（一家写两三本书来） 3.非必需氨基酸（nonessential amino acid）：指人（或其它脊椎动物）自己能由 ...

摘要：根据多肽固相合成的基本原理， 设计了2 套手工合成装置， 介绍了每套装置的操作方法， 并阐明了各种装置的优缺点和应用范围。

摘要　目的:研究小鼠子宫内膜胚泡着床点和着床旁蛋白质表达图谱及其差异。方法:用固相pH 梯度双向凝胶电泳分离5d. p. c. (days postcoitum) 小鼠子宫内膜胚泡着床点和着床旁总蛋白同时分离同龄未交配小鼠子宫内膜总蛋白银染显色PDQuest 2DE 软件分析。结果:图像分析测得三块胶的匹配率达7415 %以上在等电点pI 3～10 、分子量1414～7514kDa 范围内分离得未 ...

表达分析、分子生物学研究以及新的分析软件工具将会推进生物系统水平的研究。 文/EricChan西雅图RosettaBiosoftware数据分析师译/李亚萍 在基因表达研究中，广泛的基因分析可以对生理状态或者是一个细胞表型有关的基因进行系统监测。可以利用高通量分析在数据输出和获取数据快捷两方面的优势，对药物发现过程中的药靶候选基因进行鉴定，在假设驱动的研究中，该技术也提供了必须的系统背景知识。一旦 ...

原理和应用： Ettan DIGE荧光差异蛋白表达分析系统在传统双向电泳技术的基础上，结合了多重荧光分析的方法，在同一块胶上共同分离多个分别由不同荧光标记的样品，并第一次引入了内标的概念，极 大地提高了结果的准确性，可靠性和重复性。在DIGE技术中，每个蛋白点都有它自己的内标，并且软件全自动根据每个蛋白点的内标对其表达量进行校准，保证所检测到的蛋白丰度变化是真实的。DIGE技术可检测到样品间小于1 ...

基因组(genome)包含的遗传信息经转录产生mRNA，一个细胞在特定生理或病理状态下表达的所有种类的mRNA称为转录子组(transcriptome)。很显然，不同细胞在不同生理或病理状态下转录子组包含的mRNA的种类不尽相同。mRNA经翻译产生蛋白质，一个细胞在特定生理或病理状态下表达的所有种类的蛋白质称为蛋白质组(proteome)。同理，不同细胞在不同生理或病理状态下所表达的蛋白质的种类也 ...