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PCR引物设计

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RT-PCR实验方法总结

寡聚(dT)纤维素柱纯化mRNA一、试剂准备1.3M醋酸钠(pH 5.2)2.0.1M NaOH3.1×上样缓冲液:20mM Tris-HCl(pH 7.6);0.5M NaCl;1M EDTA(pH 8.0);0.1%SLS(十二烷基氨酸钠。配制时可先配制Tris-HCl(pH 7.6)、NaCl、EDTA(pH 8.0)的母液,经高压消毒后按各成分确切含量,经混合后再高压消毒,冷却至65℃时, ...

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RT-PCR实验方法总结

RT-PCR实验有三步:抽提RNA,RT,PCR。 要求: 1.做RT前必需测RNA浓度,逆转录体系对RNA量还是有一些要求,常用500ng或1ug。2. RT按要求做,一般不会出太大问题。 3. PCR,按常规。但如需扩长片段,则对前两步要求较高,需要有完整的cDNA存在,不是单改变Mg2+浓度、退火温度能解决的。1)RT和PCR时的引物设计是不是一定要先知道目的基因的序列?必须 在RT时,引物 ...

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RT-PCR实验方法总结

寡聚(dT)纤维素柱纯化mRNA一、试剂准备1.3M醋酸钠(pH 5.2)2.0.1M NaOH3.1×上样缓冲液:20mM Tris-HCl(pH 7.6);0.5M NaCl;1M EDTA(pH 8.0);0.1%SLS(十二烷基氨酸钠。配制时可先配制Tris-HCl(pH 7.6)、NaCl、EDTA(pH 8.0)的母液,经高压消毒后按各成分确切含量,经混合后再高压消毒,冷却至65℃时, ...

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荧光定量PCR技术简介

国内最先进的荧光定量PCR检测系统,是国际上最新研制的一种核酸定量技术,该技术在PCR反应系统中引入了荧光标记探针,具有高灵敏性、高特异性、和高精确性的特点。目前已被应用于病原体测定、肿瘤基因检测、免疫分析、基因表达、突变和多态性研究等多个领域。荧光定量PCR(简称FQ-PCR)由美国PE公司1995年研制成功,该技术是在常规 PCR基础上加入荧光标记探针来实现其定量功能的,与普通PCR相比,FQ ...

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PCR技术综述

前言 一滴残留在裙子上的精液使得美国总统BillClinton不得不坦承他与白宫实习生有不正当的关系。因为他知道现在的生物科技就连一个精子也能被用来做为证据。这种将极微量的生物标本化为可供鉴定的现代技术正是PCR(Polymerasechainreaction)--聚合酶链式反应具有的特色之一。这也是分子生物医学令人震撼的一例。 何谓PCR 简单的说,PCR就是利用DN ...

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DNA Marker产品选择指南

1.Marker选择标准 (1)应选择在目标片段大小附近ladder较密的marker,这样对目标片段大小的估计较准确。 (2)所选marker应能清楚反映目标片段的大小,且次要片段大小也能反映出来。如作酶切鉴定时,目的片段和切后载体片段最好能在同一个marker中反映出来,若二者不能兼顾,将前者作为主要考虑要素。 2.常见问题分析Q:为什么marker条带非常模糊,无法辨别具体条带? A:出现上 ...

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耐热DNA聚合酶的选择指南

耐热DNA聚合酶特点:合理选择耐热DNA聚合酶是PCR成败与否的一个关键因素,如何选择最合适的耐热聚合酶,是进行PCR实验首先要考虑的问题。目前市面上有许多耐热DNA聚合酶,虽然名称各不相同,但主要区别在于特异性、保真性、耐热性、扩增速率、扩增片段长度等几个指标。TIANGEN公司生产的耐热DNA聚合酶全部采用标准化生产工艺和质量检测标准,是经过多次分子筛、离子交换层析柱纯化的超纯型产品,去除了宿 ...

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PCR常见问题总

PCR产物的电泳检测时间  一般为48h以内,有些最好于当日电泳检测,大于48h后带型不规则甚致消失。 假阴性,不出现扩增条带  PCR反应的关键环节有①模板核酸的制备,②引物的质量与特异性,③酶的质量及, ④PCR循环条件。寻找原因亦应针对上述环节进行分析研究。  模板:①模板中含有杂蛋白质,②模板中含有Taq酶抑制剂,③模板中蛋白质没有消 化除净,特别是染色体中的组蛋白,④在提取制备模板时丢失 ...

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实时荧光定量 PCR技术原理与应用

聚合酶链式反应 ( PCR) 可对特定核苷酸片断进行指数级的扩增 。在扩增反应结束之后,我们可以通过凝胶电泳的方法对扩增产物进行定性的分析,也可以通过 放射性核素掺入标记后的光密度扫描来进行定量的分析 。无论定性还是定量分析,分析的都是 PCR 终产物。但是在许多情况下,我们所感兴趣的是未经 PCR 信号放大之前的起始模板量。例如我们想知道某一转基因动植物转基因的拷贝数或者某一特定基因在特定组织中 ...

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PCR常见问题总

PCR产物的电泳检测时间  一般为48h以内,有些最好于当日电泳检测,大于48h后带型不规则甚致消失。 假阴性,不出现扩增条带  PCR反应的关键环节有①模板核酸的制备,②引物的质量与特异性,③酶的质量及, ④PCR循环条件。寻找原因亦应针对上述环节进行分析研究。  模板:①模板中含有杂蛋白质,②模板中含有Taq酶抑制剂,③模板中蛋白质没有消 化除净,特别是染色体中的组蛋白,④在提取制备模板时丢失 ...

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PCR常见问题总

克隆PCR产物1)克隆PCR产物的最优条件是什么?最佳插入片段:载体比需实验确定。1:1(插入片段:载体)常为最佳比,摩尔数比1:8或8:1也行。应测定比值范围。连接用5ul 2X连接液 50ng质粒DNA1Weiss单位的T4连接酶,插入片段共10ul。室温保温1小时,或4℃过夜。在这2种温度下,缺T-凸出端的载体会自连,产生蓝斑。室温保温1小时能满足大多数克隆要求,为提高连接效率,需4℃过夜。 ...

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PCR常见问题总

PCR反应体系与反应条件标准的PCR反应体系:       10×扩增缓冲液   10ul       4种dNTP混合物   各200umol/L       引物        各10~100pmol        模板DNA      0.1~2ug        Taq DNA聚合酶   2.5u        Mg2+       1.5mmol/L       加双或三蒸水至  100 ...

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PCR常见问题总

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3’RACE 实验心得

引子:从06年12月份开始,断断续续做了一个多月的3’RACE,有了一些心得和体会。期间看了很多前辈们分享的经验,受益匪浅。在这里,我就自己的经历略作总结,希望能给像我一样的新人们有点启示,少走些弯路,不当之处欢迎指正。一、试剂盒的选择:3’RACE从原理上就能明白,它比5’RACE 要容易得多,所以并不一定需要用进口试剂盒。原来准备用Takara 3’RACE的试剂盒,可是看了一下它的原理和内容 ...

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SMARTTM 5-RACE PCR的原理

SMARTTM 5‘-RACE的原理是先是利用mRNA的3‘末端的poly(A)尾巴作为一个引物结合位点,以Oligo(dT)30MN作为锁定引物在反转录酶MMLV作用下,反转录合成标准第一链cDNA。利用该反转录酶具有的末端转移酶活性,在反转录达到第一链的5‘末端时自动加上3一5个(dC)残基,退火后(dC)残基与含有SMART寡核苷酸序列Oliogo(dG)通用接头引物配对后,转换为以SMAR ...

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RACE PCR简介

近年来随着生物技术的不断发展,出现了许多克隆新基因的方法和手段,如图谱克隆技术、转座子标签技术、mRNA差异显示技术二基因组减法技术以及cDNA文库筛选技术等。但上述方法人多具有实验周期长、技术步骤烦琐且工作量大等特点。cDNA末端快速扩增技术(rapid amplification of cDNA ends RACE)是一种基于PCR从低丰度的转录本中快速扩增cDNA的5'和3’末端的有效方法, ...

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mRNA差别显示技术

mRNA差别显示技术也称为差示反转录PCR(Differential Display of reverse Transcriptional PCR)简称为ddRT-PCR。它是将mRNA反转录技术与PCR技术二者相互结合发展起来的一种RNA指纹图谱技术。目前已广泛应用于分离鉴定组织特异性表达的基因。差别基因表达(differential gene express)是细胞分化的基础。mRNA差别显示 ...

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聚合酶链式反应(PCR)扩增和扩增产物克隆

概 述   PCR(Polymerase Chain Reaction聚合酶链反应)是一种选择性体外扩增DNA或RNA的方法.它包括三个基本步骤: (1) 变性(Denature):目的双链DNA片段在94℃下解链; (2) 退火(Anneal):两种寡核苷酸引物在适当温度(50℃左右)下与模板上的目的序列通过氢键配对;(3) 延伸(Extension):在Taq DNA聚合酶合成DNA的最适温度 ...

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Rt-PCR经验总结

Rt-PCR实验步骤一、实验器具与材料:1、移液枪:1ml、200μl、20μl、10μl、2μl2、吸头:1ml、200μl、20μl3、匀浆管:5ml4、吸头台:放置1ml吸头的一个,放置20μl吸头的一个5、EP管:1.5ml、0.2ml、100μl6、试剂瓶:2个60ml的棕色试剂瓶(广口,带盖)1个125ml的白色试剂瓶(放无水乙醇)7、量筒:50ml、250ml、500ml8、容量瓶: ...

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