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RNAi

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赶超RNAi的基因沉默技术? [zt from dnathink]

The Scientist-September 23,2003-Fingering single genes-Cathy HoldingThe ability to control in vivo gene expression may be a powerful tool in cancer therapy, gene therapy of inherited genetic diseases, and for the study of gene function. Small interfering RNAs are increasingly used in ...

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《Nature》:用RNAi攻击胆固醇

近几年来,RNAi技术已经成为分子生物学研究领域的一把利剑。最近,一项新的研究表明用RNA干扰技术靶向单个基因的RNA能够成功地降低小鼠的胆固醇水平。这些结果公布在2004年11月11日的Nature上。仅仅在数年前,研究人员发现除了细菌以外的所有生物体控制基因表达,部分依赖于一种叫做RNA干扰的机制。研究人员一直试图将这个机制用于人类疾病的治疗。这种方法的原理很简单,即创造出一个所谓的短干扰RNA(siR ...

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新型促凝血RNAi疗法为血友病治疗带来曙光

RNAi(RNA interference)技术自诞生之日,就表现出巨大的疾病治疗应用潜力,每年全球多家巨型药企都会投入巨额资金进行RNAi治疗药物研发,Alnylam就是其中之一。最新一期Nature Medicine中报道了该公司与费城儿童医院关于血友病的RNAi疗法最新研究进展。在血液中,抗凝血因子和促凝血因子会组成一个凝血系统,通过控制血浆中凝血酶的水平,平衡失血控制与血栓形成之间的关系。凝血酶是凝血级联反 ...

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siRNA,shRNA,dsRNA,miRNA间的区别

RNA干扰(RNAi),即用20多个核苷酸组成的短的双链RNA(siRNA)代替传统反义核酸进行转录后基因沉默,已经迅速而广泛地应用到基因功能,基因表达调控机制研究等热门领域,并为基因治疗开辟了新的途径。近两年来,这方面的科学论文及报道爆炸性增长,几乎每天都有新的结果涌现。这些论文中,出现了很多与RNA干扰相关的概念,意思很相近但并不完全相同,这里列举了几个常见的RNA干扰相关的名词及其简单的解释:1、 miRNA:在 ...

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双荧光素酶检测的原理和应用

一、荧光素酶报告基因的检测原理荧光素酶(Luciferase)是生物体内催化荧光素(luciferin)或脂肪醛(firefly aldehyde)氧化发光的一类酶的总称,来自于自然界能够发光的生物。自然界存在的荧光素酶来自萤火虫、发光细菌、发光海星、发光节虫、发光鱼、发光甲虫等。细菌荧光素酶对热敏感,因此在哺乳细胞的应用中受到限制。目前,以北美萤火虫虫(Photinus pyralis)来源的荧光素酶基因应用的最为广泛,该 ...

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RNAi及siRNA转染相关实验攻略

RNAi 是一种高效的特异性强的基因表达抑制,应用RNAi生物学机制进行基因功能研究已经成为一种创新性的新方法,人们第一次可以如此快速和方便地抑制细胞中特定基因的表达水平,从而用于分析特定基因在细胞中的功能。RNAi 技术还为新药开发、疾病治疗提供了创新性的方法和途径,有着极其广阔的应用前景。转染是RNAi技术应用的瓶颈。siRNA的转染是RNAi技术最常用和最重要的转染。由于siRNA转染技术应 ...

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RNAi表达载体构建

近年来的研究表明一些短片断的双链RNA可以通过促使特定基因的mRNA降解来高效、特异的阻断体内特定基因表达诱使细胞表现出特定基因缺失的表型 称为RNA干扰(RNA interferenceRNAi).siRNA(small interfering RNAs)就是这种短片断双链RNA分子能够以序列同源互补的mRNA为靶目标降解特定的mRNA.RNAi的发现具有划时代的意义它不仅深入揭示 了细胞内基 ...

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RNAi实验原理与方法选择

一、RNAi的分子机制 通过生化和遗传学研究表明,RNA干扰包括起始阶段和效应阶段(inititation and effector steps)。在起始阶段,加入的小分子RNA被切割为21-23核苷酸长的小分子干扰RNA片段(small interfering RNAs siRNAs)。证据表明;一个称为Dicer的酶,是RNase III家族中特异识别双链RNA的一员,它能以一种ATP依赖的 ...

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MIRNA(microRNA)检测实验流程(加polyA法)

一:概述 microRNA(miRNA)是一类有大约22个核苷酸组成的非编码小分子RNA,其广泛存在于真核生物中。miRNA在个体发育的不同时期及不同组织中有不同的表达模式,都表明了其在发育和分化中起有重大的调控作用。迄今为此,对miRNA的检测方法主要有Northern Blot 等基于分子杂交的方法,这些方法敏感度低、耗时长、RNA的用量较大。miRNA qPCR Detection Kit ...

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RNAi动物实验的简单方法——体内转染

摘要:由于RNAi实验技术的推广和应用,人们在体外培养细胞中进行RNAi实验已经比较容易。随着研究的深入,人们需要将研究扩展至更自然的细胞和体内环境。一种像做体外转染一样的简单易用的方法已经出现,这就是动物体内转染试剂。 由于RNAi实验技术的推广和应用,人们对特定基因"敲除"或"沉默"变得越来越简单,研究也越来越多。在体外培养细胞中进行RNAi实验已经比 ...

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科学家发明RNA干扰实验新方法

在最新的《自然—方法学》(Nature Methods)杂志上,谢晓亮研究组再次发表文章,提出了利用其研究组自身研发的技术——受激拉曼散射(stimulated Raman scattering,SRS)显微技术进行RNA干扰实验的新方法。

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RNA干扰(RNA interference, RNAi)的作用机理

RNA干扰(RNA interference, RNAi)作为一种重要的基因转录后沉默机制, 广泛应用于基因功能研究、肿瘤及病毒感染性疾病治疗的实验研究 ,其核心作用是双链的小干扰RNA ( small interfering RNA, siRNA ) 能够抑制同源基因的表达。

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科学家发明大尺度鉴定miRNA靶点新方法

《自然—方法学》网络版近日介绍了瑞士苏黎世大学分子生命科学研究所迈克尔· 恩加特纳(Michael O Hengartner)研究组发明的一种大尺度鉴定miRNA靶点新方法。

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microRNA 研究实验导航—定量分析

近两年microRNA的研究受到越来越多科学家的关注,大量的实验结果揭示了microRNA在胚胎发育、癌症等方面起到非常重要的调控作用,据推测microRNA可能调控至少30%的基因的表达情况。

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In vitro transcription reaction

1 ml linearized DNA template pBS-SK- ERD (X-E) (0.1-0.5 mg)7.8 ml DDW5 ml 5X transcription buffer ( stratagene )1 ml 750 mM DTT1 ml Rnasin (RNase inhibitor; 15U/ml)1 ml 10 mM ATP (pH 7)1 ml 10 mM CTP ...

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PolymeraseIII invitro Transcription

Polymerase III in vitro Transcription Steve HahnFor the following reactions use appropriate shielding and dispose of radioactive waste properly!A 20 microliter transcription reaction contains:4.0 μ ...

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Run-On Transcription

Run-on transcription monitors the regulation of transcription in isolated nuclei.A. Preparation of Nuclei - (do everything at 0℃ to 4℃ in 50 ml tubes)1. Pellet between 30 and 300 million cells at 1500 ...

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Transcription of cRNA probe

Transcription of cRNA probeReagents/SolutionsDNA (PCR or plasmid) with bacteriophage RNA polymerase promoter in suitable orientation (see note 1 ) ~1µg/µl in TE buffer 10mM MgCl2 5x Transcription Buff ...

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Invitro transcription

The following protocol is for MEGAscript II Kit (Ambion). 1. PCR amplify the DNA template. The 5'-end of the template should contain the minimum promoter sequenences of T7 or Sp6 or T3.A 5-primer with ...

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Total RNA extraction from Arabidopsis and tobacco--拟南芥和

RNA extraction buffer:0.1M NaCl2% SDS50mM Tris/HCl (pH9)10mM EDTA20mM ß-mercaptoethanol1. Grind leaf tissue on liquid N in mortar and pestle.2. Transfer the ground tissue to a 10ml conical bottom cent ...

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