以有代表性的古代穴居人尸骨为例,演示如何利用引物延伸捕获法从严重退化且被微生物DNA污染的DNA资源中重获目标序列。
基因位点及信息获取的方法 NCBI的Map Viewer(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/mapview/)是常用的软件。NCBI的MapViewer支持以染色体位置来对基因组信息进行搜寻和展示,感兴趣的区域可以通过以基因或分子标记物的名称等文本查询或通过序列比对(BLAST)来获得,可在全基因组水平对结果进行展示或选择性地展示更详细的结果。多种选项可以用来设定展示 ...
10月4日,由深圳华大基因与加州大学伯克利分校、哥本哈根大学等单位合作的研究成果 “对200个人类外显子的测序揭示大量低频率非同义突变的存在”在国际著名学术杂志《自然—遗传学》(Nature Genetics)上发表。这是中外科学家在人类基因组研究领域取得的又一项重要成果。
据物理学家组织网报道,美国宾夕法尼亚大学的研究人员近日开发出一个纳米级的碳基平台,可用于电子探测单个DNA(脱氧核糖核酸)分子。该技术最终有望在快速DNA电子测序方面发挥“用武之地”。相关研究论文发表于最新一期的《纳米快报》。
(一) 鼠肝DNA的制备
Identify appropriate celltype over-expressing corresponding gene.Find out if transcription can be stimulated further eg by induction (note: the higher the mRNA level of the gene in question the easier ...
Gel Shift or Band Shift Assay or Electrophoretic Mobility Shift Assay (EMSA) is a technique for studying gene regulation and determining protein:DNA interactions. The assay is based on the observation ...
DNA聚合酶催化的DNA链延伸是在3’-OH末端上进行的。由于2’,3’-双脱氧三磷酸核苷酸(ddNTP)的3’-位脱氧而失去游离-OH,当它参入到DNA链后,3’-OH末端消失,使DNA链的延伸终止。 本实验根据此原理,将待测DNA片段插入单链噬菌体M13载体,并用合成的寡聚核苷酸引物与该载体上插入待测片段的上游顺序退火,随后在T7DNA聚合酶催化下进行延伸反应。实际操作中同时进行, ...
物种的遗传多样性在本质上是DNA 一级序列的多样性。近年来,随着DNA 测序技术的迅速发展和日益普及,DNA 测序在遗传多样性的研究中正在起着越来越大的作用。本章将介绍目前在遗传多样性研究中常用的一种手动和一种全自动双链DNA 测序方法。1 DNA 模板的制备在遗传多样性的研究中,由于样本量一般都较庞大,因而DNA 测序的速度就成了很关键的因素。因此,这类研究中常常直接测定纯化的PCR 双链产物而 ...
Introduction This manual is a compilation of many of the everyday methods used in the average molecular biology laboratory with emphasis on the techniques for large scale DNA sequencing protocols and ...
一、概述: Promega公司的SILVER SEQUENCETM DNA测序系统是一种无放射性的序列分析系统,它通过灵敏的银染方法检测凝胶中的条带。 银染提供了一种对于放射性或荧光法来说更加快速,廉价的替代方法。测序结果可以在同一天内得到;电泳完成后经90分钟就可读序,这是常规的放射性测序法做不到的。 此外 SILVER SEQUENCETM系统用未修饰的5'OH寡聚核苷酸作为引物, 减 ...
一.实验目的 1.掌握DNA指纹图谱技术的概念、原理和基本操作过程2.学习DNA的限制性酶切的基本技术3.掌握琼脂糖凝胶电泳的基本操作技术,学习利用琼脂糖凝胶电泳测定DNA片段的长度,并能对实验结果进行分析。二.实验原理1984 年英国莱斯特大学的遗传学家Jefferys及其合作者首次将分离的人源小卫星DNA 用作基因探针,同人体核DNA 的酶切片段杂交,获得了由多个位点上的等位基因组 成的长度不 ...
1. For double-stranded DNA templates:a. Denature template: 10ml DNA (5-10g or alkaline lysis mini prepDNA)8ml ddH2O 2ml 2N NaOH -incubate 30' at 37℃.b. Dry-ice precipitate: 10ml 4M NH4OAc100ml EtOH ...
Buffers and gel solutions Long Ranger: we started using this in early 1995. Great stuff; the best thing is that the gels are not sticky after drying even without removal of the urea. Long Ranger Gel S ...
DNA的双螺旋结构中碱基对在整个大分子链形成一个大的pai键这个结构在导电高分子中很常见,这个键就是导电高分子导电的核心关键,而DNA中的这个大pai键的作用可以使电子在高分子链上进行移动.其结果对DNA控制蛋白质的的合成有什么影响,或者说是对病变的DNA(癌细胞的DNA)有什么抑制作用.目前科学家们还在研究中,仅关于其电子运输的机理就已经众说纷纭,我看到的就两个:多步骤跃迁和快速短距离的电子传递 ...
(1)揭示基因结构;(2)染色体上的基因及其基因位点;(3)分离与鉴定基因。 DNA测序方法:化学法:Maxam-Gilbert化学修饰法。1) 基本原理:用化学试剂处理具有末端放射性标记的DNA片段,造成碱基的特异性切割并产生一组具有不同长度的DNA链降解产物,经凝胶电泳分离和放射自显影后,可直接读出待测DNA片段的核苷酸序列。2) 基本步骤:(1)同位素标记DNA片段的5’ ...
DNA序列分析的内容主要包括确定开放读码框内含子与外显子DNA序列拼接
DNA序列分析的内容主要包括确定开放读码框/ 内含子与外显子/ DNA序列拼接
DNA序列分析的内容主要包括确定开放读码框 内含子与外显子DNA序列拼接
本文介绍了甲基化检测之亚硫酸氢盐修饰后测序的方法。