DNA基础知识

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相关专题 解读miRNA （MicroRNA） ecords：一个整合的microRNA靶标数据库。整合多个靶标预测软件的调控关系。网址：http://mirecords.biolead.org/ ...

相关专题 解读miRNA （MicroRNA） targetScan: 基于靶mRNA序列的进化保守等特征搜寻动物的microRNA靶基因。是预测microRNA靶标假阳性率较低的软件。而且是microRNA领域大牛Bartel实验室开发的。网址：http://www.targetscan.org/ ...

相关专题 解读miRNA （MicroRNA） PicTar：基于microRNA或microRNA靶标联合作用等特征开发的搜寻动物的microRNA靶基因的软件，假阳性率也较低。是microRNA领域大牛Rajewsky实验室开发的。该文章位列miRNA相关文章引用Top5。网址：http://pictar.mdc-berlin.de/ ...

相关专题 解读miRNA （MicroRNA） PITA：基于靶位点的可接性(target-site accessibility)和自由能预测MicroRNA的靶标。是著名的生物信息学家Segal实验室开发的。网址：http://genie.weizmann.ac.il/pubs/mir07/mir07_data.html ...

相关专题 解读miRNA （MicroRNA） miRDB: 动物MicroRNA靶标预测和功能注释数据库。网址：http://mirdb.org/miRDB/ MiRNAMap:动物的MicroRNA基因及其靶标的数据库。网址：http://mirnamap.mbc.nctu.edu.tw/ ...

相关专题 解读miRNA （MicroRNA） 1 Targetfinder: 使用基于植物的靶标罚分策略预测小RNA的靶标软件。网址：http://jcclab.science.oregonstate.edu/node/view/56334 2 miRU psRNATarget: 一个网页版的植物MicroRNA靶标预测工具。网址：ht ...

相关专题 解读miRNA （MicroRNA） 1 CleaveLand:一个基于mRNA降解组数据预测MicroRNA靶标的工具。网址：https://homes.bio.psu.edu/people/faculty/Axtell/AxtellLab/Software.html 2 miRGen：MicroRNA基因和microRNA靶标数 ...

相关专题 解读miRNA （MicroRNA） 尽管早在1993年，科学家就发现了第一个microRNA，但直到2003年以后，这种小RNA分子的大作用才不断被发现。研究显示：miRNA通过与转录本的相互作用，关闭或抑制基因的表达，影响了30%的基因。miRNA在多个组织中，例如正常和肿瘤组织中差异表达。因此，通过表达谱分析寻找疾病相关miR ...

相关专题 解读miRNA （MicroRNA） Using a miRNA microarray can be broken down into 5 steps: 1. Post-Processing (Can be done ahead of time) 2. Isolation of Small RNAs from sample (Can ...

相关专题 解读miRNA （MicroRNA） 1 实验方法识别MicroRNA 1.1 建立富集microRNA 的cDNA 文库法 目前主要有两种构建富集microRNA 的cDNA 文库的方法。 第一种方法是将一个组织中的全部RNA经变性聚丙烯酰胺凝胶电泳分离 回收19~25 nt RNA小片段 随后在这些小片段RNA的3'和5 ...

相关专题 解读miRNA （MicroRNA） 概观miRNA MicroRNAs(miRNAs)是一类非编码的小RNA分子，通过与靶RNA的3 UTR互补或部分互补结合，使其降解或介导其翻译抑制，参与细胞增殖、凋亡、分化、代谢、发育、肿瘤转移等多种生物学过程.miRNAs基因通常位于基因间或编码蛋白基因的内含子中，在核内由RNA聚合酶II或 ...

相关专题 解读miRNA （MicroRNA） 来自加拿大多伦多大学分子及医学遗传学、加拿大Health Network大学(University Health Network)、美国耶鲁大学的研究人员公布了一张包含104种人类miRNAs的1597个高可信度的靶标网络，并证明miRNAs与mRNA的配对表达谱(paired expressi ...

相关专题 解读miRNA （MicroRNA） MicroRNA(miRNA)是一种机体内源性表达的单链小分子RNA，位于基因组非编码区，本身不具有开放阅读框(open reading frame，ORF)，具有高度保守性，时序性和组织特异性。miRNA广泛存在于各种真核细胞中，不编码任何蛋白质，长度仅为20～24nt。成熟的miRNA 5& ...

相关专题 解读miRNA （MicroRNA） 来自中国药科大学生命科学与技术学院，中国药科大学药物分析教研室，华东医学生物技术研究所的研究人员在一篇综述文章中介绍了最新发展的microRNA定量检测方法 详细阐述了基于探针杂交技术的Northern blotting法、微阵列芯片法、纳米金标记法、桥连同位素标记法 以及基于扩增技术的定量PC ...

相关专题 解读miRNA （MicroRNA） 《自然—方法学》网络版近日介绍了瑞士苏黎世大学分子生命科学研究所迈克尔•恩加特纳(Michael O Hengartner)研究组发明的一种大尺度鉴定miRNA靶点新方法。 在过去几年中，随着实验和计算方法的发展和完善，miRNA靶点的鉴定和预测研究取得很大进展。然而，全面正确地鉴定m ...

相关专题 解读miRNA （MicroRNA） 探针-miRNA复合体通过纳米孔 miRNA能够调控基因表达，因此被作为抑制癌症等疾病相关基因的潜在疗法。然而，细胞中miRNA的拷贝数非常少以至于很难被检测到。11月4日出版的《自然—纳米技术》杂志以封面文章形式报道了美国宾夕法尼亚大学玛丽亚·德恩迪奇(Marija Drndic)小组发明的 ...

相关专题 解读miRNA （MicroRNA） 1 Northern杂交 Northern杂交是检测mirna表达的一种简便而可靠方法，不仅用于检测mirna在组织细胞中的表达水平，而且结合rna marker，可经凝胶电泳检测mirna的分子大小。 1993年始，Northern杂交应用于mirna表达谱研究，也是首个用于半定量检测mirn ...

相关专题 解读miRNA （MicroRNA） 多个研究小组采用生物化学结合生物信息学的方法开展对miRNAs的研究工作。由于据推测都是由Dicer酶降解RNA得到的，21—25个碱基大小、有5’端磷酸基和3’羟基的RNA片断，有的实验室采用改良的定向克隆方法来筛选具有相同特征的小分子——筛选一定大小的RNA分子，连接到3’和5’的适配子(a ...

相关专题 解读miRNA （MicroRNA） miRNA靶基因预测 与miRNA基因预测相比靶基因的预测具有更大的难度. 因为目前已知的miRNA靶基因数量非常有限不能为预测提供充足的依据而且对预测的候选基因的鉴定步骤相对繁琐很难实现高通量和规模化. 从已知的miRNA与靶基因的相互作用中人们得出miRNA5′端的2～8 个核苷 ...