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相关专题 原核表达系统是常被用来研究基因功能的成熟系统,由于原核表达系统具有包涵体蛋白不易纯化、蛋白修饰不完整等缺陷,人们也开始利用真核细胞表达系统来研究基因。 自上世纪70年代基因工程技术诞生以来,基因表达技术已渗透到生命科学研究的各个领域。并随着人类基因组计划实施的进行,在技术方法上得到了很大发展,时至今日已取得令人瞩目的成就 。随着人 ...
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相关专题 DNA微阵列基因表达数据分析 用于检测基因表达水平的 DNA 微阵列实验,应用之一是比较实验,目的是比较两个条件下的基因表达差异,从中识别出与条件相关的特异性基因,例如,识别可用于肿瘤分型的特异基因等。为了提高实验的可靠性,对于同一样本,往往有两次或更多次的重复实验,但是,由于 DNA 微阵列的费用仍然很昂贵,不可能重复足够多的次数 ...
相关专题 DNA微阵列基因表达数据分析 对于基因表达谱数据的分析是生物信息学的研究热点和难点。转化为数学问题,分析任务是从数据矩阵 M 中找出显著性结构,结构类型包括全局模型 (model) 和局部模式 (pattern) 。对基因表达谱数据的分析是数据挖掘问题,所采用的方法包括通过可视化进行探索性数据分析( Exploratory Data ...
相关专题 DNA微阵列基因表达数据分析 在生物医学中,基于表达数据的肿瘤分型诊断是重要的应用领域。 1999 年, Golub 等人的研究证明了肿瘤亚型之间在基因表达上的差异,通过对一组特异基因的表达检测,可以进行临床诊断,并指导治疗方案的制定。随后,很多研究组开展了用 DNA 微阵列检测基因表达用于肿瘤诊断的研究,所涉及的肿瘤包括白血病、乳 ...
相关专题 DNA微阵列基因表达数据分析 主成分分析 ( Principal Component Analysis , PCA ) 是一种掌握事物主要矛盾的统计分析方法,它可以从多元事物中解析出主要影响因素,揭示事物的本质,简化复杂的问题。计算主成分的目的是将高维数据投影到较低维空间。给定 n 个变量的 m 个观察值,形成一个 n ′ ...
相关专题 DNA微阵列基因表达数据分析 基因表达存在组织特异性、细胞周期特异性和外界信号的响应特异性等特性,这些特异性都是由细胞内复杂而有序的调控机制实现的。对基因表达调控机制的研究具有非常重要的理论和应用价值,研究的目的是要回答以下问题:在特定的细胞转态下,有哪些基因发生了表达?它们是通过何种方式被调控的?它们的表达量是多少?这些基因的产物 ...
相关专题 DNA微阵列基因表达数据分析 本文利用Matlab及其生物信息学工具箱提供的函数识别差异表达基因并利用基因本体论确定差异表达基因的生物学功能。 引言 包含寡核苷酸或cDNA探针的微阵列可用来比较基因组尺度的基因表达谱,微阵列试验的重要目的在于确定不同条件下,如两种不同的肿瘤类型,是否存在统计显著的基因表达量的变化进而确定差异表达基因 ...
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相关专题 DNA微阵列基因表达数据分析 随着人类基因组测序逐渐接近完成,科学家发现即使获得了完整基因图谱,对了解生命活动还有很大距离。我们从基因图谱不知道基因表达的产物是否出现与何时出现;基因表达产物的浓度是多少;是否存在翻译后的修饰过程,若存在是如何修饰的,等一系列问题。这些问题的实质是不了解按照特定的时间、空间进行的基因表达谱。获得基因表 ...
相关专题 DNA微阵列基因表达数据分析 一次微阵列实验能获得细胞在某一条件下的全基因组表达数据,包含成千上万个基因在细胞中的相对或绝对丰度,不同条件(细胞周期的不同阶段、药物作用时间、肿瘤类型、不同病人等)下的全基因组表达数据就构成了一个G×N的数据矩阵M,通常情况下GN,其中每一个元素 表示第 i 个基因在第 j 个条件下的表达水平值(在 ...
相关专题 基因表达谱的发展有助于科研工作人员进一步的理论知识充实及应用到研发等领域中。基因芯片是最近几年发展起来的基因表达重要工具,本文主要对这种技术的数据分析和管理方法作具体介绍。 一、引言 DNA微阵列(DNA microarray)也叫基因芯片,是近几年发展起来的一种能快速、高效检测DNA片段序列、基因型及其多态性或基因表达水平的新技 ...
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相关专题 Gateway技术提供以下可能: 通过去除冗长的亚克隆步骤节省您的时间 同时将您的基因转移到多个表达系统 在任何您选择的系统――体外,细菌,酵母,昆虫,或哺乳动物――分析表达 一、一种更好的克隆方法 Gateway技术能够克隆一个或多个基因进入到任何蛋白表达系统(图1)。这项强大的体外技术大大地简化了基因克隆和亚克隆的步骤,而同时 ...
相关专题 分子生物学技术已经成为生命科学领域研究有力工具,但是很多实验的重复性和复杂性常会耗费很多时间,严重影响了实验的进度。所以现在很多课题组将实验中某些费事的实验环节外包给生物学技术服务商。 1.哈尔滨海基生物科技有限公司 现代分子生物学技术已经成为科学研究领域有力的工具。但是,繁杂和重复性的工作花费了科研人员太多不必要的宝贵时间。将 ...
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