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相关专题 转膜是把DNA 从琼脂糖凝胶中转移到固相支持物(一般是尼龙膜)上固定,是进行各种后续研究(如 RFLP 分析,阳性克隆的筛选验证等所有涉及分子杂交的研究)的前提。 实验目的: 掌握 Southern blotting 的原理及操作步骤 实验原理: 1.转膜的方式: 向上的毛细管转移 向下的毛细管转移 同时向两张膜转移 电转移 真空 ...
相关专题 geneSpring是一款广受好评的基因组学工作人员必知软件,使用者可在短时间内分析运算出目的基因的序列,称得上系统生物学分析软件中的佼佼者,受到相关科研工作者的欢迎和肯定。本文对GeneSpring GX的优势做详细分析。GENESpring生物数据分析软件 GeneSpring GX是一套特别针对生物学家需求所精心设计的生物芯 ...
相关专题 1998年以前,研究者们都认为正义rna和反义RNA 都可以阻断基因的表达,直到Andrew Fire发现双链RNA才是阻断基因表达的因素,这种阻断作用称之为RNA,它被评为2001十大科学成就之一。 随后的研究中发现,RNAi现象广泛存在于线虫,果蝇,斑马鱼,真菌以及植物等生物体内,这些生物体利用RNAi 来抵御病毒的感染,阻断 ...
相关专题 PCR实验室产品选择指南 荧光基团是吸收一定波长的光子后发射特定波长的光波,可以作为抗体等分子的标记物,实时荧光定量PCR中的Taqman探针常用荧光基团FAM标记荧光基团和TAMRA标记。 荧光基团 吸收特定波长的光子后荧光染料(通常称为“荧光基团”或简称为“荧光素”)的化学键即被活化,其化学键活化的结果是发射波长更长的光子(能量 ...
相关专题 原核表达系统是常被用来研究基因功能的成熟系统,由于原核表达系统具有包涵体蛋白不易纯化、蛋白修饰不完整等缺陷,人们也开始利用真核细胞表达系统来研究基因。 自上世纪70年代基因工程技术诞生以来,基因表达技术已渗透到生命科学研究的各个领域。并随着人类基因组计划实施的进行,在技术方法上得到了很大发展,时至今日已取得令人瞩目的成就 。随着人 ...
相关专题 荧光微球分析技术属于化学材料发展结果,可用于细胞表面抗原的检测、退行性神经病变示踪物、吞噬功能的检测、血流分析、敏感性诊断试剂等,本文介绍了荧光微球分析技术以及荧光微球吞噬实验的操作步骤。 荧光微球分析技术简介 荧光微球分析技术是近年来化学材料科学活跃发展的产物,各种大小(0.2~10μm)可产生荧光和色彩的人工微球应运而生 ...
相关专题 DNA微阵列基因表达数据分析 基因表达数据反映的是直接或间接测量得到的基因转录产物 mRNA 在细胞中的丰度,这些数据可以用于分析哪些基因的表达发生了改变,基因之间有何相关性,在不同条件下基因的活动是如何受影响的。它们在医学临床诊断、药物疗效判断、揭示疾病发生机制等方面有重要的应用。检测细胞中 mRNA 丰度的方法有 cDNA 微阵 ...
相关专题 DNA微阵列基因表达数据分析 用于检测基因表达水平的 DNA 微阵列实验,应用之一是比较实验,目的是比较两个条件下的基因表达差异,从中识别出与条件相关的特异性基因,例如,识别可用于肿瘤分型的特异基因等。为了提高实验的可靠性,对于同一样本,往往有两次或更多次的重复实验,但是,由于 DNA 微阵列的费用仍然很昂贵,不可能重复足够多的次数 ...
相关专题 DNA微阵列基因表达数据分析 对于基因表达谱数据的分析是生物信息学的研究热点和难点。转化为数学问题,分析任务是从数据矩阵 M 中找出显著性结构,结构类型包括全局模型 (model) 和局部模式 (pattern) 。对基因表达谱数据的分析是数据挖掘问题,所采用的方法包括通过可视化进行探索性数据分析( Exploratory Data ...
相关专题 DNA微阵列基因表达数据分析 在生物医学中,基于表达数据的肿瘤分型诊断是重要的应用领域。 1999 年, Golub 等人的研究证明了肿瘤亚型之间在基因表达上的差异,通过对一组特异基因的表达检测,可以进行临床诊断,并指导治疗方案的制定。随后,很多研究组开展了用 DNA 微阵列检测基因表达用于肿瘤诊断的研究,所涉及的肿瘤包括白血病、乳 ...
相关专题 DNA微阵列基因表达数据分析 主成分分析 ( Principal Component Analysis , PCA ) 是一种掌握事物主要矛盾的统计分析方法,它可以从多元事物中解析出主要影响因素,揭示事物的本质,简化复杂的问题。计算主成分的目的是将高维数据投影到较低维空间。给定 n 个变量的 m 个观察值,形成一个 n ′ ...
相关专题 DNA微阵列基因表达数据分析 基因表达存在组织特异性、细胞周期特异性和外界信号的响应特异性等特性,这些特异性都是由细胞内复杂而有序的调控机制实现的。对基因表达调控机制的研究具有非常重要的理论和应用价值,研究的目的是要回答以下问题:在特定的细胞转态下,有哪些基因发生了表达?它们是通过何种方式被调控的?它们的表达量是多少?这些基因的产物 ...
相关专题 DNA微阵列基因表达数据分析 1. ASDB - Protein products and expression patterns of alternatively-spliced genes 2. Axeldb - gene expression in Xenopus 3. BodyMap - human and mouse ge ...
相关专题 DNA微阵列基因表达数据分析 本文利用Matlab及其生物信息学工具箱提供的函数识别差异表达基因并利用基因本体论确定差异表达基因的生物学功能。 引言 包含寡核苷酸或cDNA探针的微阵列可用来比较基因组尺度的基因表达谱,微阵列试验的重要目的在于确定不同条件下,如两种不同的肿瘤类型,是否存在统计显著的基因表达量的变化进而确定差异表达基因 ...
相关专题 DNA微阵列基因表达数据分析 随着人类基因组测序逐渐接近完成,科学家发现即使获得了完整基因图谱,对了解生命活动还有很大距离。我们从基因图谱不知道基因表达的产物是否出现与何时出现;基因表达产物的浓度是多少;是否存在翻译后的修饰过程,若存在是如何修饰的,等一系列问题。这些问题的实质是不了解按照特定的时间、空间进行的基因表达谱。获得基因表 ...
相关专题 DNA微阵列基因表达数据分析 一次微阵列实验能获得细胞在某一条件下的全基因组表达数据,包含成千上万个基因在细胞中的相对或绝对丰度,不同条件(细胞周期的不同阶段、药物作用时间、肿瘤类型、不同病人等)下的全基因组表达数据就构成了一个G×N的数据矩阵M,通常情况下GN,其中每一个元素 表示第 i 个基因在第 j 个条件下的表达水平值(在 ...
相关专题 基因表达谱的发展有助于科研工作人员进一步的理论知识充实及应用到研发等领域中。基因芯片是最近几年发展起来的基因表达重要工具,本文主要对这种技术的数据分析和管理方法作具体介绍。 一、引言 DNA微阵列(DNA microarray)也叫基因芯片,是近几年发展起来的一种能快速、高效检测DNA片段序列、基因型及其多态性或基因表达水平的新技 ...
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相关专题 DNA微阵列基因表达数据分析 芯片技术的发展为我们的基因序列分析工作提供了很大的便利,然而,当芯片所产生的数据如雪片般纷至沓来时,我们要怎样以最高效及时的方法将它们分门别类地统计处理好呢?这里总结了一些统计技术和数据库: 芯片分析能够检测不同条件下的基因转录变化,能够显示反映特征组织类型、发育阶段、环境条件应答、遗传改变的基因谱。当 ...