遗传学实验技术

The shotgun merge section of the MicroGenie program is used to combine a number of overlapping DNA sequences into a single, larger, contiguous sequence (contig). This is particularly useful for constructing the continuous sequence of a cDNA clone from its respective restriction fragmen ...

The MicroGenie program was originally developed as a result of a collaboration between Cary Queen of N.C.I. Bethesda and Laurence Korn of Stanford University, Their first program was written for a Mainframe computer (1). This program was later adapted to run on the, then new, IBM PC (2). A company called S ...

With the advent of personal computers and graphical user interfaces, the justification for publishing programs on terminal- or textdriven devices is to be questioned. However, biological sequence data frequently are not just “text” that can be tailored with a word processor program. This ...

The prediction of RNA secondary structure differs significantly from that of protein secondary structure. The latter is based on crystallographic data, and by using a variety of empiric or semiempiric parameters, a prediction is achieved. RNA secondary structure prediction, on the ot ...

Most of the programs presented in the earlier chapters, including those in Chapter 14, work on both peptide and nucleotide sequences. There are a few GCG programs, however, that require protein sequences. Method 1, pattern matching, describes how to identify features of unknown sequences bas ...

Translation of DNA sequences can be simply trivial reformatting, e.g., transcribe one file format into another, or use Us instead of Ts. and so forth. These utilities for “translation” are by no means unimportant and are, therefore, presented in Method 1.

Pattern recognition in biological data is difficult to achieve. On the one hand, it is simple trying to find information based on identity of patterns described in a search string. Method 1 and 2 describe such a pattern search for text strings. More sophisticated searches use a pattern definition la ...

Searches in databases require efficiency and speed. This cannot be achieved by using the same methods as described in the previous chapters on sequence-comparison. It would take much too long to calculate alignment path matrices between the database sequence and the query sequence. Howev ...

DNA sequencing methodology was developed in the late 1970s (1,2) and has become one of the most widely used techniques in molecular biology. The amount of DNA sequencing performed worldwide has increased exponentially each year and this trend will almost certainly continue for the next few ye ...

相关专题 英国威康信托基金会桑格研究所的研究人员利用CRISPR技术设计出多种新的导向RNAs，由此构建出一个可靶向小鼠基因组中每个基因的导向RNAs文库。这一研究有助于研究不同细胞类型中每个基因的作用。相关文章发表于2013年12月23日的《Nature Biotechnology》杂志上。 Nature子刊：英国科学家利用CRISPR技术构建出一个小鼠全基因组gRNAs文库 CRISPR技术介绍 CRISPR技术是指利 ...

相关专题 著名遗传学家George Church等人综述二代测序(NGS)实验中错误的来源，以及怎样利用重复去避免或减少这些错误发生。相关文章发表于2013年12月10日的《Nature Reviews genetics》杂志上。 尽管测序技术在不断发展，但不论是哪种测序平台，测序过程中都不可避免地存在一些错误。 2011年7月发表在《Na ...

相关专题 RNA提取从RNA合成到RNA干扰实验技术 近日，加州大学伯克利分校的科学家新研发出一种RNA提取实验方案，这种方法适用于所有陆生植物(包括30万物种)。这一实验方案将大大推动非模式植物物种以RNA为基础的研究。相关文章发表于2013年12月9日的《Applications in Plant sciences》杂志上。 加州大学推 ...

2013年11月08日-10日，由中华医学会、中华医学会病理学分会主办，广东省医学会、广东省医学会病理学分承办的中华医学会病理学分会第十九次学术会议暨第三届中国病理年会在广州白云国际会议中心成功举行。分子病理在个性化治疗领域的应用成为此次会议的看点之一。 分子病理，即在分子水平上研究疾病发生发展机制和疾病规律的科学。成都军区昆明总医院病理科的杨举伦教授在《分子病理检测技术及应用》的 ...

不同于其他类型的癌症，经过早期筛查确诊的肺癌患者依然要面对严重的死亡率。即便是手术成功，大约35-45%的Ⅰ期肺癌患者，也会在5年内由于复发而死亡。 当前，对于早期肺癌的评估，医生结合肿瘤的大小、位置以及显微表型等信息，进一步指导术后治疗。对于有局部淋巴结扩散的肺癌患者，标准治疗方法是手术加术后化疗。对于没有局部淋巴结扩散的患者，治疗方法通常是手术后进行临床观察。在“观 ...

相关专题 中国科学院遗传与发育生物学研究所王秀杰课题组新开发了一套在线的小分子rna高通量测序数据整合分析软件ISRNA。解决广大研究人员的需求。相关文章发表于2013年12月3日的《BioInformatics》杂志上。王秀杰研究组的骆观正博士为论文第一作者。 王秀杰课题组开发出一套小分子RNA高通量测序数据整合在线分析软件 高通量测序 ...

相关专题 中科院利用CRISPR-Cas9技术开发新应用领域，这是由上海生物化学与细胞生物学研究所李劲松研究组完成的一项以小鼠白内障遗传疾病为模型研究。他们利用CRISPR-Cas9技术原理，有可能根治白内障遗传疾病。相关文章发表于2013年12月05日的《Cell Stem Cell》杂志上。 Cell子刊：小鼠研究证实CRISPR-C ...

相关专题 美国伊利诺伊大学香槟分校的一个研究组采用一种创新基因工程技术DNA assembler，破解细菌隐藏的基因簇所编码的化合物，找出它们潜在的价值。这一项研究是由该校化学和生物分子工程系的赵惠民教授带领的一个研究团队完成的。这一发现将有助于我们更深入了解细菌。相关文章发表于2013年12月05日的《Nature Communicati ...

实验十 植物细胞的微核检测技术一、原理： 微核(micronuclei)简称MCN是真核类生物细胞中的一种异常结构，往往是细胞经辐射或化学药物的作用而产生的。在细胞间期，微核呈圆形或椭圆形，游离于主核之外，大小应有主核1/3以下。微核的折光率及细胞化学反应性质和主核一样，也具合成DNA的能力。一般认为微核是由有丝分裂后期丧失着丝粒的断片产生的，整条染色体或几条染色体也能形成微核。这些断片或染色体在 ...

实验三 果蝇的单因子杂交一、实验目的：通过实验深刻理解孟德尔分离定律；学习遗传学实验结果记录及统计处理方法。二、实验材料：野生型：长翅（+ / +） 突变型：残翅（vg / vg）三、实验原理：果蝇长翅座位是Ⅱ67.0，长翅对残翅完全显性。残翅果蝇的双翅几乎没有，只有少量残痕，不能飞翔。正交： P： 长翅（♀）×残翅（♂） 反交：残翅（♀）×长翅（♂） （+/+） （vg / vg） （vg / ...

实验二 野生型果蝇形态、生活史观察一、实验目的：掌握果蝇的基本特征及鉴别雌、雄果蝇的方法，熟悉常见突变型；了解果蝇生活周期特征及各阶段的形态变化。二、实验材料：野生型果蝇和常见的突变型果蝇（残翅、白眼、白眼小翅焦刚毛）三、实验内容：果蝇属于昆虫纲，双翅目。双翅目：成虫具有一对发达、膜质的前翅，后翅特化为一对平衡棒。（一） 生活周期的观察：果蝇是完全变态昆虫，生活周期可分为4个时期：卵、幼虫、蛹和成 ...