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Digoxigenin-UTP RNA labeling

1. Add the following to a sterile microfuge tube on ice: -1 ug linearized plasmid DNA. -2 ul Dig RNA Labeling Mix 10X concentrate -2 ul 10X transcription buffer -1-2 ul RNase inhibitor (DNase free) -a ...

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RNAi基础知识介绍

Rnai 最近由于RNA 干扰(RNA interference,RNA i)的发现使反义领域的研究增多。这种自然发生的现象最早是在秀丽线虫中发现的(1),是序列特异性地使转录后的基因沉默的有力机制。由于最近两年在RNA i领域取得的进步,已经有许多这方面的综述发表(2-4)。RNA 干扰是由长的双链RNA 分子发动的,该分子可以被Dicer enzyme加工成长度为21-23个核苷酸的RNA ( ...

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RNAi在细胞培养中的应用

The protocols listed here are for Drosophila cells in 6 well plates and our pre-aliquoted 384 well plates. RNAi experiments may be done in other size plates just scale up or down. Adopted from Clemens ...

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RNA干扰在人类T细胞的应用

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DIETHYL PYROCARBONATE (DEPC) TREATMENT OF AQUEOUS SOLUTIONS

Diethyl pyrocarbonate derivitizes histidine residues and is therefore an effective method to inactivate nucleases including RNAse. CAUTION: DEPC is irritating to the eyes skin and mucous membranes. It ...

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Preparation of total RNA from whole blood collected in PAXgene tubes

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RNA干扰技术获得新突破

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Northern Blot--northern杂交

Northern Blot Preparation of Formaldehyde Agarose Gel The gel conditions (1% agarose 1X MOPS 6.3% formaldehyde) are designed for ~4 hours of electrophoresis. If longer times are necessary the formald ...

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RNA的提取和cDNA合成原理和实验方法

第二节 动植物组织mRNA 提取 一、材料 水稻叶片或小鼠肝组织。 二、设备 研钵,冷冻台式高速离心机,低温冰箱,冷冻真空干燥器,紫外检测仪,电泳仪,电泳槽。 三、试剂 1、无RNA 酶灭菌水:用将高温烘烤的玻璃瓶(180℃ 2小时)装蒸馏水,然后加入0.01%的DEPC(体积/体积),处理过夜后高压灭菌。 2、75%乙醇:用DEPC处理水配制75%乙醇,(用高温灭菌器皿配制),然后装 ...

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The TRC shRNA Design Methods and Rules

Overview We design shRNA molecules with an algorithm. Our algorithm uses several criteria to rank potential 21mer targets within each human and mouse Refseq transcript. The algorithm applies a set of ...

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RANi术语表

RNA干扰是最近发现的一种功能工具。当RNA导入一个细胞时,最终会引起细胞内互补mRNA的降解,从而导致基因功能活性的阻断。 PTGS转录后基因沉默(posttranscriptionalgenesilencing);一种首先在植物中确定,然后发现在动物中也存在的现象。尽管PTGS最初被描述作一种病毒防御和转位子沉默的内源方法,现在它已经成为一种新的令人激动的研究工具��RNAi干扰。 协同抑制( ...

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病毒RNA提取实验方法(protocol)

一、用异硫氰酸胍提取 提禽流感病毒的详细步骤,可参考(我提过N次做定量PCR都没问题): 1.取200ul样品数+阴性对照+阳性对照个1.5ml灭菌eppendorf管。 2.加600ul异硫氰酸胍,然后加入对照和样品,再加200ul氯仿,颠倒混匀。 3.13000rpm离心15min。 4.在第3步离心快结束时,另取同样多eppendorf管,加入400ul -20度预冷的异丙醇。 5.取第3 ...

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RNAi: Background Information

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什么是RNA interference(RNAi)

RNA interference (RNAi ) by double stranded RNA (dsRNAs) molecules of approximately 20-25 nucleotides termed short interfering (siRNAs) is a powerful method for preventing the expression of a particul ...

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cDNA Synthesis from MOLT-4 Cells

First strand of cDNA synthsis 1.Add 2 μl of Not I primer-adapter to a sterile 1.5 ml RNAase free tube add 4.5 μl mRNA of molt4 cells (~5.2 ug) add 0.5 μl DEPC-H2O. 2. Heat the mixture at 70℃ ...

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肝脏细胞RNA的提取

一.原理 RNA提取技术不仅是分子生物学技术的重要组成部分,也是功能基因组 学科研技术的重要基础。从RNA水平研究生物体内基因的调控机制,已成为分子生物学研究的一个重要手段。对某一生物或组织进行性状研究,首先要获得该性状基因,从组织细胞中分离完整的RNA对于分子克隆 和基因表达分析等实验是至关重要的,如Northern印迹及杂交分析、cDNA合成等实验的成效在很大程度上取决于RNA的质量。利用提取 ...

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RNase Protection Assay--RNA酶保护试验

RNA酶保护试验(RNase Protection AssayRPA)是通过液相杂交的方式用反义RNA探针与样品杂交,以检测RNA表达的技术。与Northern杂交和RT-PCR比较,RPA有以下几个优点: 1. 检测灵敏度比Northern杂交高。由于Northern杂交步骤中转膜和洗膜都将造成样品和探针的损失,使灵敏度下降,而RPA将所有杂交体系进行电泳,故损失小,提高了灵敏度。 ...

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TRIzol method for RNA isolation

TRIzol method for RNA isolation -To tissue or cells add 200- 1 ml TRIzol (GIBCO BRL) 1.homogenize for 60 sec (vortex or polytron) 2.add 40ul-200 ml chloroform (1/5 volume of Trizol) 3.mix by vortexing ...

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Generate siRNA Populations with Dice

The use of small interfering RNAs (siRNAs) to induce targeted gene silencing in mammalian cells offers researchers a powerful tool for analyzing gene function. Ideally one would like to work with indi ...

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siRNA个人小结

在活体RNAi关键点:类似药物属性的引入,如稳定性、细胞内的传送、组织的生物可溶性进入合成的siRNA。

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