1、纤维组织:心脏/骨骼肌等纤维组织提取RNA的关键在于彻底破碎组织。这些组织细胞密度低,单位重量的组织RNA的含量就少,建议用尽可能多的起始量。使用TRNzol法可以提取纤维组织终RNA,由于纤维组织终RNA含量较少,可按照增加的起始量成比例增加TRNzol的用量,并在液氮中将组织彻底磨碎,同时适当减少溶解RNA的溶液体积。2、蛋白/脂肪含量高的组织:动物的脑和某些特殊的植物组织中,脂肪或者蛋白 ...
前不久一个网友问到我这个问题,自己了解的也少,因此这几天找了找,现在把自己找到的一些东西贴下来供大家参考。以下是师兄前辈们总结的几种EB替代品:sybr-green---- 不稳定,易降解goldview ----宣称无毒不灵敏回收连接不好荧光易猝灭gelred ---- 低毒效果很强!但价格昂贵~~genefinder ---- 效果一般,以前怀疑它是sybr green,不过有人辟谣了,所以毒 ...
问:trizol法提取血中的RNA,怎样做量会更多?提完RNA加DEPC水后放-80度也会容易讲解吗?答:1 血要新鲜。如果是冻存的,在解冻时要完全,之后再加Trizol。2 可以稍多加一些Trizol,少加些血。混匀之后放置10分钟左右,直接加三氯甲烷,混匀再去离心。可以不用先离心去沉淀之后再加三氯甲烷。3 每个步骤操作要快,用的时间药短些,防止降解4 异丙醇沉淀的时候,放-20°C的冰箱半个小 ...
1.何首乌 富含多糖多酚等次生代谢物①200mg新鲜叶组织置于预冷研钵中,+聚乙烯吡咯烷酮粉(PVP),液氮中研磨成粉②移入EP管中,+提取液(1ml Trizol +1%β-巯基乙醇+1% PVP),充分混匀,置于冰上③每管+150μL无水乙醇+100μL 5mol/L的KAc(pH 4.8),混匀后缓缓+200μL氯仿/异戊醇(24:1),冰上静置10mi ...
1.取新鲜植物叶片0.1g(研磨样品前可用水或酒精清洗样品)于2mL离心管中,在液氮或-80℃下贮存。2.研磨: 在样品研磨前,提取液于80℃浴预热,加入前,提取混合液上下颠倒混匀。3.提取: (1) 加入500µL80 提取液,30s涡流混匀; (2) 加入250µL氯仿︰异戊醇(24︰1),30s涡流混匀; (3) 置于冰上。4.沉淀: (1) 离心:12000rpm,4℃,5min。 (2) ...
土壤(污泥)RNA提取的难题和解决方法从土壤(污泥)中提取微生物的RNA是一件很困难的事情,因为土壤中的微生物不可能像培养的微生物那么丰富,二者土壤中的腐殖酸的残留会影响下游的实验,三者是提取RNA的共同难题,就是非常容易降解!目前国际上一般的试剂盒通常采用玻璃珠(钢珠)破碎的方法,然后用玻璃奶和吸附柱反复漂洗去除杂质和腐殖酸,操作过程及其复杂,一般需要2.5小时以上的操作时间,首次使用可能要超过 ...
(一)总RNA提取-Trizol法 Trizol法适用于人类、动物、植物、微生物的组织或培养细菌,样品量从几十毫克至几克。用Trizol法提取的总RNA绝无蛋白和DNA污染。RNA可直接用于Northern斑点分析,斑点杂交, Poly(A)+分离,体外翻译,RNase封阻分析和分子克隆。1、将组织在液N中磨成粉末后,再以50-100mg组织加入1ml Trizol液研磨,注意样品总体积不能超过所 ...
一、用Trizol 抽提的RNA,用琼脂糖凝胶电泳,出现许多条带(至少四条以上),是哪些原因导致的?参考见解:1、是从组织里抽的还是细胞抽的?组织的RNA电泳不理想,但目的条带仍能跑出来。细胞的电泳相当漂亮,但有时逆转录效果反而不好。组织经常出现这种情况,组织抽提的RNA不纯,而且多多少少有降解。不过下一步可以接着做逆转录,可能对后面的实验影响不会很大。2、是mRNA的话,这样的效果挺不错的。如果 ...
比如果蝇,线虫,拟南芥等低等生物和植物,由于不涉及抗病毒免疫应答反应,通过体外转录即可制备目标基因的dsRNA(通常200bp或以上),直接用长双链RNA进行RNAi实验,不需要另外设计siRNA,因而比较简单。长双链RNA的制备很容易,省掉了设计合成单个siRNA的麻烦,并且长双链RNA在生物体内会被Dicer酶降解为多个siRNAs混合物,因而往往比单个siRNA更有效。长链dsRNA的递送方 ...
对大部分实验人员来说,RNA 抽提比基因组 DNA 抽提要困难得多。事实上,现有的 RNA 抽提方法/试剂,如果用于从培养细胞中抽提 RNA,比抽提基因组 DNA 更方便,成功率也更高。那为什么同样的方法用于组织 RNA 的抽提,总会碰到问题呢? 组织 RNA 抽提失败的两大现象是: RNA 降解和组织内杂质的残留。关于降解问题,首先看一下为什么从培养细胞中抽提 RNA 不容易降解。现有的 RN ...
在分离RNA时,良好的实验室技术很关键。与DNA相比,RNA更加娇贵,也更不稳定。RNA含有高反应性的羟基(C-OH)基团,确保链不断合成、分解和再次利用。分离出的RNA迅速降解,并很容易受到核糖核酸酶(RNase)的污染。RNase似乎随处可见。加利福尼亚州科学院(California Academy of Sciences)的Jack Dumbacher博士目前正开展转录组和小RNA的分离,以 ...
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