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Performing RNAi Experiments in Animals

Gene silencing by RNA interference is being used routinely to study gene function in cultured mammalian cells. While this approach has been extremely powerful it does not allow a critical evaluation o ...

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in vivo RNAi Protocols

In vivo Purity Stealth RNAi™ siRNA and BLOCK-iT™ siRNA duplexes are specifically formulated for use in animals. Resuspend the RNA duplex in UltraPure DNase/RNase-free distilled water or appropriate DN ...

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The TRC shRNA Design Process

OverviewWe design shRNA molecules with an algorithm. Our algorithm uses several criteria to rank potential 21mer targets within each human and mouse Refseq transcript. The algorithm applies a set of r ...

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siRNA transfection protocol (6 well plate)

Day 1: Seed cells - should reach approximately 20% confluency the next day (e.g. use 150 μ l (from confluent p10 taken up into 10 ml) per well. 2 ml DMEM per well). It is important that the cells are ...

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siRNA (RNA Oligo) Annealing Protocol

Reagents: Annealing buffer (5X)Formula 1:50 mM Tris pH 8.0100 mM NaClFormula 2:100 mM Potassium Acetate30 mM HEPES at pH 7.42 mM Magnesium AcetateFormula 3:100 mM Potassium Acetate30 mM HEPES-KOH a ...

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The siRNA user guide

Selection of siRNA duplexes from the target mRNA sequenceUsing Drosophila melanogaster lysates (Tuschl et al. 1999) we have systematically analyzed the silencing efficiency of siRNA duplexes as a func ...

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Lentiviral RNAi Protocols

SummaryLong DNA oligos containing the target sequence are cloned into LentiLox 3.7 (see protocol). Once clones have been isolated virus is produced by transfecting 293 cells and collecting supernatant ...

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Sauer:RNA Purification from E. coli

My Experience Purifying RNA from E. coliRegarding RNA extraction there is a horrible tendency of people to use kits for RNA extraction with bacteria. With Qiagen (anion exchange) or other silica-bindi ...

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cDNA AMPLIFICATION FROM LAMBDA-PHAGE LIBRARY

PREPARE SOLUTIONS1. SM buffer (1 L):Mix 5.8 g of NaCl 2 g of MgSO4-7H2O 50 mL of 1M Tris-HCl pH 7.5 0.5 mL of 2% gelatin and dH2O to 1 L (Autoclave) 2. TENS buffer (100 mL): Mix 5 mL of 1M Tris-HCl pH ...

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cDNA LIBRARY SCREENING

PREPARE SOLUTIONS 1. 10mM MgSO4 0.2% Maltose LB (100 mL): Mix 1.0 g of Bacto-Tryptone 1.0 g of NaCl 0.5 g of Yeast Extract and 1.0 mL of 1M MgSO4. Adjust pH to 7.5 with NaOH (Autoclave). Add 2 mL of 1 ...

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Analysis of RNA-Protein Complexes by RNA Coimmunoprecipitation and RT-PCR Analysis from Caenorhabditis elegans

INTRODUCTION RNA coimmunoprecipitation (co-IP) experiments are an extension of protein co-IP experiments in which in vivo RNA-protein complexes are investigated. This protocol describes how to perform ...

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RACE服务

特定基因我们通常可以通过RT-PCR的方法得到其cDNA全场序列,但是在序列两端未知的情况下,这种方法就无法奏效了,这时我们可以根据基因的一段已知序列(或一段同源序列),利用3'-Race方法获得该基因的3'端序列,或者利用5'-Race方法得到该基因的5'端序列。服务流程:1、先由您提供背景资料,其中包括已知的DNA序列部分,RNA的情况,所扩增基因的估计长度,是否具有同源序列等。2、根据您提 ...

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实时荧光定量PCR系统新应用:基于定量PCR的mic roRNA整体分析

中文版:LightCycler®480 实时荧光定量PCR系统新应用:基于定量PCR的mic roRNA整体分析.pdf英文版:New Application for qPCR-based microRNA Profiling.pdf ...

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通过实时荧光定量PCR技术实现对miRNA靶向物mRNAs的相对定量分析

1 导言小RNA(miRNAs)是一种内源性非编码蛋白的小分子RNA,它们是许多基础的细胞过程中基因表达的主要调节因子,这些过程包括细胞增殖、细胞分化以及细胞凋亡等。miRNA在肿瘤生长过程中也发挥着重要作用。一般来说,miRNA通过控制翻译过程来实现对目标蛋白表达的调控。然而,在靶向mRNA降解水平上的基因表达的调控已有报道。因此,有证据显示miRNA能够通过RNA降解来实现对细胞内mRNA浓度 ...

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锐博生物2011最新产品目录

包含siRNA、miRNA、寡核酸合成、LncRNA、细胞组识分析、全基因合成、载体构建、高内涵筛选、小RNA深度测序、表观遗传学等相关的系列产品和服务!提供全面、专业的技术服务和支持!完整的一站式解决方案系统,方便您的研究!让您的研究畅通无阻!Ribobio 2011 总览.pdfRibobio 2011 part siRNA.pdfRibobio 2011 part miRNA.pdf ...

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RNA isolation for Microarray

DescriptionRNA extraction using TRI REAGENT. This method gives ample amout of RNA. ProcedureIt is 3 days procedure.Day 1:1. Harvest the cells and centrifuge at 2000 rpm for 5-10 minutes and pour off ...

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填补Qiagen空白的植物RNA提取试剂盒(包括多糖多酚困难样品)

填补Qiagen空白、不用DNA酶消化的植物RNA提取试剂盒 一般公司多糖多酚植物RNA提取试剂盒失败原因和解决方案 很多植物RNA的样品由于含有大量的多糖、多酚、代谢产物、色素等成分,造成RNA提取过程中氧化、褐化、降解、由于植物品种的多样性造成情况更加复杂。手工的CTAB类的方法提取因为时间太长,太繁琐,手工方法不在讨论之列。一直以来没有一款好的试剂盒包括qiagen、promega等进口试剂 ...

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shRNA干扰载体构建

产品技术背景pRI系列载体是基于III类RNA聚合酶启动子:人类H1启动子的专用于哺乳动物细胞RNA干扰的载体。H1启动子在哺乳动物细胞内合成类似siRNA分子的小分子RNA。由于H1启动子有精确的转录起始位点和终止信号,H1启动子转录产物精确生成人工设计的shRNA,shRNA经过RISC剪切后形成有2个U突出末端的成熟siRNA。由于H1启动子对转录产物长度的严格限制,基本上杜绝了非特异性干 ...

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RNAi及siRNA转染相关实验攻略

RNAi 是一种高效的特异性强的基因表达抑制,应用RNAi生物学机制进行基因功能研究已经成为一种创新性的新方法,人们第一次可以如此快速和方便地抑制细胞中特定基因的表达水平,从而用于分析特定基因在细胞中的功能。RNAi 技术还为新药开发、疾病治疗提供了创新性的方法和途径,有着极其广阔的应用前景。转染是RNAi技术应用的瓶颈。siRNA的转染是RNAi技术最常用和最重要的转染。由于siRNA转染技术应 ...

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miRNA mimics miRNA inhibitor

miRNA mimics是模拟生物体内源的miRNAs,运用化学合成的方法合成,能增强内源性miRNA的功能。 miRNA inhibitor是化学修饰的专门针对细胞中特异的靶miRNA的抑制剂。 近年来人工合成的miRNA(artificial miRNA,amiRNA)已经成功应用于沉默预期靶基因的表达及其功能研究, 人工合成的miRNAs既能够特异性地沉默单一基因,也可以同时沉默多个相关 ...

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