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【专题讨论】MicroRNAs的发现、起源和研究概述

MicroRNAs(miRNAs)是一种小的内源性RNA分子,大约由21-25个核苷酸组成。这些小的miRNA通常靶向一个或者多个mRNA,通过翻译水平的抑制或者断裂靶标mRNAs而调节基因的表达。Discovery(发现):1993年,Lee,Feinbaum和Ambros等人发现在线虫体内存在一种RNA(lin-4),是一种不编码蛋白但却可以生成一对小的RNA转录本,每一个转录本能在翻译水平通过抑制一种核蛋白 ...

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【共享】microRNA命名细则

本人新手,刚接触到microRNA这一领域时,不知道如何下手。通过查阅相关文献,虽然对其有所了解,但也存在诸多困惑!且不说对各种miRNA的功能及作用机制知之甚少,单从最基本的miRNA的命名上看就很是费解,比如:hsa-miR-4720-3p 等应该如何理解呢?我想大多数刚接触到这方面的朋友们估计也跟我有一样的困惑吧?!通过收集各方面的资源,总算有了些收获,为以后在该领域的进一步研究打下了基础。在此分享给大家,希望对 ...

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【原创】肺组织RNA提取心得

小硕,刚进实验室不久,自己想的课题,外加老婆的建议和帮助下,RT-PCR外加琼脂糖电泳顺利跑了下来,前两天标本的目的基因及内参都P出来了,内心小高兴一把。图未上,等拷回来补传上来。虽然还有小毛病,但是起码还是有点结果了。说说肺组织提RNA,是癌旁5CM以及肿瘤组织切下来放液氮中冷冻,后转-80度冷藏。标本是守在手术室里面,一切下来就取的,不存在RNA降解问题。前期的标本是直接放进2ml离心管里面的,后来在从2ml离心 ...

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【公告】相约8月 microRNAs完整解决方案暨生物美学技术培训班——姚开泰院士亲自讲解表观遗传学与肿瘤学前沿

相约8月 microRNAs完整解决方案暨生物美学技术培训班——姚开泰院士亲自讲解表观遗传学与肿瘤学前沿不容错过的理由:专业的品质,丰富的经验,莱德尔带您步入小分子的殿堂,与您分享microRNAs研究最完整的解决方案群雄逐鹿的战场上一块仅存的处女地,microRNAs研究最后一次不容错过的良机:microRNAs启动子的表观遗传学研究与分子生物学明星技术培训最抽象的分子机制可以绘制出最华丽的插图,投稿Nat ...

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【共享】RNA silencing

RNA沉默机制研究进展RNA沉默机制的研究主要集中在遗传和生化方面。遗传方面,各研究小组选择遗传突变子的筛选策略,即筛选RNA干涉功能丧失的突变基因。目前在拟南芥中已发现了SGS1、SGS2、SGS3以及SDE1、SDE2、SDE3和SDE4等多个参与RNA干涉作用的基因,(Elmayan,1998;Dalmay,2000)而在链孢霉中发现产生基因消除所必需的基因QDE1、QDE2和QDE3(Tijsterman ...

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【旧帖整理】RNA提取与纯化:技术与经验---2004-2012年资源整合

近日学习RNA提取与纯化技术,在园子里看了很多帖子,很有收获,遂将RNA提取与纯化方面在2004-2012年资源进行总结,整合为一贴,建立一个资源索引,与各位站友一起分享!快速知晓入门篇核酸纯化技术及基础(主要集中在核酸纯化:genome, DNA, plasmid, RNA):http://www.dxy.cn/bbs/thread/10489541#10489541RNA提取系列---RNA提取流程、实验举例及注意事项幻灯片:http ...

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【原创】miRNA Northern Blot实验步骤

miRNA Northern Blot实验步骤1975年,英国科学家埃德温·迈勒·萨瑟恩(Edwin Mellor Southern)创建了Southern Blot技术用于检测DNA。基于同样的原理,1977年由斯坦福大学的James Alwine、David Kemp和George Stark开发出了用于检测RNA的Northern Blot技术,至今仍然是一种经典的RNA检测技术。miRNA在不同组织中丰度变化大,例如,miR-133在骨 ...

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siRNA的转染方法和影响基因阻断水平的因素!

1. 影响基因阻断水平(Gene Knockdown Level)的因素在RNAi实验中,有许多因素影响目的基因表达的降低程度(例如:基因阻断),包括:• 转染效率• 目的基因转录效率• 蛋白稳定性• 选择特殊Stealth™RNA或者siRNA序列的效率 • 选择哺乳动物细胞系的生长特征当设计转染和RNAi实验时,需要考虑这些因素。如果需要更多的信息帮助您成功的进行RNAi实验,查阅标题为“Seven Steps Toward RNAi Success”的文献。随同 ...

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【交流】RNAi技术策略(哺乳动物细胞篇)

目前RNAi技术已经进入了生物科学研究的许多领域,成为了一种主要的生物学研究工具,发展得相当迅速,并受到了此次诺贝尔奖评审委员会 的青睐,获得2006年诺贝尔奖医学/生理奖。然而这一才历经十个年头的技术依然对于许多研究人员来说还是很陌生的,以下是有关RNAi技术在哺乳动物细胞中应用的具体设计策略,主要来自于《遗传》杂志2005年“RNA干涉(RNAi)技术应用于哺乳动物细胞的研究策略”,希望能给从事或者准备从事RN ...

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【共享】贡献自己收藏的英文原版电子图书《MicroRNA Interference Technologies》

MicroRNA Interference TechnologiesBy Zhiguo WangPublisher: SpringerNumber Of Pages: 193Publication Date: 2009-08-01ISBN-10 / ASIN: 3642004881ISBN-13 / EAN: 9783642004889Description:MicroRNAs (miRNAs), endogenous noncoding regulatory mRNAs of around 22-nu ...

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【资源】siRNA构建

siRNA构建siRNA 质粒载体的构建RNA 小片段可以通过化学合成或质粒载体转录获得。质粒载体的构建是将长约70bp的含有特定茎环以及终止信号的DNA分子插入到特定载体中,该DNA分子可以 在细胞中转录为含有特定发夹结构的RNA双链分子。这些发夹RNA分子在细胞中被切割为19-23nt的双链RNA小片段,从而起到抑制特定基因表达的作用。siRNA 质粒载体的优点与化学合成siRNA相比,siRNA 质粒载体有以下优点:1. ...

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【公告】采用Arraystar lncRNA芯片发现病毒型肝癌的新靶点

采用Arraystar lncRNA芯片发现病毒型肝癌的新靶点【字体:大 中 小】  www.ebiotrade.com  时间:2011年8月4日    来源:康成生物------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------摘要: 第二军医大学孙树汉教授课题组长期致力于肝癌研究,许多实验成果已经发表在国际顶级期刊上。此次研究利用Arraystar lncRNA芯片(长链非 ...

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【共享】Micro RNA,从一窍不通到略知一二

  原来上学的时候,我们知道mRNA,tRNA和rRNA,当时只知道除了mRNA估计都不会考的,于是也就这么过来了。但做了科研才知道,原来还有MiRNA、SiRNA、LncRNA、PiwiRNA、CeRNA……当我看到看到这些的时候,我感觉整个人都不好了,感受到了科研所带来的深深的恶意……脑海里只有两个念头:“这TM是啥?”&“这TM又是啥?”  MicroRNA这几年挺火的,所以必须要知道一些相关的知识。  MicroRNA (miRNA) 是 ...

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RNA干扰技术及其应用

RNA干扰(RNA interference,RNAi)是正常生物体内抑制特定基因表达的一种现象,它是指当细胞中导入与内源性mRNA编码区同源的双链RNA(double stranded RNA,dsRNA)时,该mRNA发生降解而导致基因表达沉默的现象,这种现象发生在转录后水平,又称为转录后基因沉默(post-transcriptional gene silencing,PTGS)。外源dsRNA 进入细胞后产生的小分子干扰RNA(s ...

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【交流】请大家讨论一下piRNA!

请大家讨论一下piRNA!奉献最新的一篇摘要:An epigenetic activation role of Piwi and a Piwi-associated piRNA in Drosophila melanogasterHang Yin1,2 & Haifan Lin1,2Department of Cell Biology, Duke University Medical School, Durham, North Carolina 27710, USAYale Stem Cell Center and Department ...

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【共享】RNAi实验4个要素和基本实验路线

RNA 干扰是一种自然发生的基因沉默机制,应用于基因功能研究和临床疾病治疗,就成为一种功能非常强大的工具。不过,开展RNAi实验并不难,不需要特殊的仪器,RNAi实验所需的4大要素一点不复杂:1对应目标基因的dsRNA(siRNA,长dsRNA,shRNA载体,看实验需要);2适合的转染或者其他将dsRNA递送进入细胞的方法;3适当的对照;4检测目标基因表达情况的方法1. 对应目标基因的dsRNA在非哺乳动物细胞中,直接 ...

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【共享】待发表的综述:RNAi在药物最佳靶点筛选和鉴定中的应用

RNAi在药物最佳靶点筛选和鉴定中的应用摘要最佳药物靶点的筛选和鉴定是新药研发的核心,是药物开发的第一步,也是药物筛选及药物定向合成的关键因素之一。在过去十年里,科学界已经在此领域做出了巨大的提高,如:基因组学和蛋白质组学以及人类基因序列的测定,而且在制药工业的投资不断加大。然而新药研发受到多因素调节、单因素之间相互作用等复杂药物调节机制的制约,临床上药物疗效还涉及到药物代谢以及药物的毒副作用。因此急需能够 ...

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【共享】RNA分离与鉴定实验指南:RNA研究方法【美】R.E

RNA分离与鉴定实验指南:RNA研究方法内容简介   《RNA分离与鉴定实验指南:RNA研究方法(原著第3版)》包括RNA与细胞生物学,真核基因的转录与组织,信使RNA,核糖核酸酶,RNA分离策略,从组织中提取RNA,多聚腺苷酸RNA的分离,RNA制备的质量控制,斑点印迹分析,电泳等共26章内容。目录 第1章 RNA与细胞生物学第2章 真核基因的转录与组织第3章 信使RNA第4章 核糖核酸酶第5章 RNA分离策略第6章 从组织中提取RNA第7章 多聚 ...

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【共享】如何确认RNA的质量

如何确认RNA的质量提取到质量良好的RNA(包括总RNA和mRNA,以下同)是非常困难,关于RNA的提取技术,我就不说了,为什么呢?或许各位非常关心呢,我是这样想的,我可以看到的资料或者是厂家的说明书,各位也同样可以看到的,内容当然都是一样的了,所以实验做的好不好,主要是心的投入多少的问题,所以希望大家自己多多思考啊!以下两种方法,相信大家都知道的:1)检测RNA溶液的吸光度280、320、230、260nm下的吸光 ...

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NORTHERN BLOT PROTOCOL1

NORTHERN BLOT OF RNA GELBuffers:20XSSPE (500 ml):3.6M NaCl : 105.2 g0.2M phosphate buffer pH 7.0: 100mL of 1M20mM EDTA: 20mL of 0.5MPhosphate buffer pH7.0 (500ml):NaH2PO4 (monobasic) 140 mL of 1MNa2H2PO4 (Dibasic) 360 mL of 1MpH to 7.0 after both are addedHybridization buffer =HB (100mls):5X SSPE: ...

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