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DNA抽提指南(TRIZOL)

按照RNA 分离操作方案在完全移去水样层后,匀浆中的DNA 存在于中间层和苯酚层中也可以被分离出来。在沉淀和多次洗脱后,DNA 溶解在8 mM NaOH中。用TRIZOL试剂从组织和培养细胞中完全回收的DNA 可以用来做样品中DNA 含量的测定。同时抽提的基因组DNA 可以用于对Northern analysis的结果进行标准化,因为DNA 变异程度比总RNA 或组织重量要小。 实验所需但试剂未提 ...

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质粒大量提取-SDS裂解法

本法的产量要低得多,但却比本章所述的其他方法更温和,是提取大质粒(大于15kb)的首选方法。 试验步骤: 1、将500ml细菌沉淀物洗过后重悬于10ml用冰预冷的10%蔗糖、50mmol/L Tris.Cl(pH8.0)溶液中,将悬液移至30ml的带盖螺口塑料试管中。 2、加入2ml新配制的溶菌酶溶液。当溶液的pH值小于8.0时,溶菌酶不能有效地发挥作用。 3、加8ml 0.25mol/L EDT ...

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amplifiable dna from bones-Molecular Biology

does anyone have a reasonably successful protocol for isolating dna from bones---bones that are highly compromised in integrity---i.e.really bad shape? I've tried and am well seasoned in the tra ...

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Preparation of Salmon Sperm DNA

Denatured Salmon Sperm DNA is used in prehybridization and hybridization solutions to reduce background signal.The Salmon Sperm DNA (Sigma No.D-1626)is first "denatured" in large volumes and ...

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Electrophoretic Mobility Shift Assay (EMSA)

Sugden labMcArdle Laboratory for Cancer ResearchUniversity of Wisconsin-Madison Medical School DNA /EMSA.pdf">http://mcardle.oncology.wisc.edu/sugden/Protocols/PDF files/Association of protein ...

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Standard hybridization technique

The standard solution typically used for both pre-hybridisation and hybridisation is based on that given in Maniatis et al.(1982)with both Denhart's solution and heterologous DNA being replaced by hep ...

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微量DNA的纯化

1.对于微量DNA样品溶液(如100ml以下),应预先将DNA溶液以TE或无菌水稀释至一定体积。以减少第5步中的DNA损失。 2.加入等体积的酚:氯仿:异戊醇(25:24:1)。 3.剧烈振荡管中内容物,将水相和有机相充分混匀,使之成为乳浊液。 4.室温下静置以初步分层。再用离心机于室温以10000rpm离心至少5分钟以上,使无机相与有机相充分分开。 5.用剪去尖头的微量移液器枪头小心移出 ...

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重组质粒的抽提、鉴定与凝胶成像技术

一、目的 鉴定载体与目的基因是否已经成功连接成新的重组质粒。 二、原理 载体pUC18具有一个EcoRI 和HindIII的单酶切位点,含氨苄青霉素抗性基因。目的基因设计时分别在上、下游引物中加入了EcoRI 和HindIII单酶切位点,两者双酶切后,经连接酶连接,连接成功就形成了新的重组质粒。 在含50μg/ml Amp、40ml X-gal 储液和4μlIPTG 储液LB 固体平皿 ...

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分子杂交

对于大的基因组,DNA 酶切图谱凭肉眼是分辨不开的(EB 染色),因为大小不等的分子呈现弥散分布,只有借助灵敏的放射性同位素(或其他化学发光物质),将靶 DNA 在凝胶上(膜上)的带型通过特定的探针与之杂交,转换成 X 光片上直观的带型,才能进行相关分析。另外如果需要鉴定或寻找与已知 DNA 同源的 DNA 片段如:染色体步查、基因组文库的评价和利用、阳性克隆的分析鉴定、转基因拷贝数分析等也都需进 ...

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DNA methylation

DNA methylation is an epigenetic event that affects cell function by altering gene expression and refers to the covalent addition of a methyl groupcatalyzed by DNA methyltransferase (DNMT)to the 5-car ...

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细胞/组织中的DNA定量(Quantification of DNA in cell / tissue samples)

1.Safety precautions Hoechst 33258 is carcinogen and toxic.Use with adequate ventilation.Avoid contact with eyesskinclothing.Wash after handling.Keep container closed. 2.Rationale For biochemical qu ...

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分子克隆常用技术

一、核酸的纯化 在分子克隆的所有操作中,最基本的操作是核酸的纯化。其关键步骤是去蛋白质,通常只要用酚/氯仿。氯仿抽提核酸的溶液即可。每当需要把克隆有某一些所用的酶灭活或去除以便进行下一步时,可进行这种抽提。然而,如要从细胞裂解液等复杂的分子混合物中纯化核酸,则要先用某些蛋白水解酶消化大部分蛋白质后,再用有机溶剂抽提。这些广谱的蛋白酶包括链霉蛋白酶及蛋白酶K等,它们对多种天然蛋白均有活性,(1)用酚 ...

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质粒DNA纯化

试验原理: 大量提取的质粒DNA一般需进一步纯化常用柱层析法和氯化铯梯度离心法。常使用的所有纯化方法都利用了质粒DNA 相对较小及共价闭合环状这样两个性质。例如用氯化铯-溴化乙锭梯度平衡离心分离质粒和染色体DNA 就取决于溴化乙锭与线状以及与闭环DNA分子的结合量有所不同。 溴化乙锭通过嵌入碱基之间而与DNA结合进而使双螺旋解旋。由此导致线状DNA的长度有所增加作为补偿将在闭环质粒DNA中引入超螺 ...

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从新鲜或冷冻组织中提取DNA

Section of Cancer GenomicsGenetics BranchNCI National Institutes of Health Reagents Chloroform EDTA0.5 M Ethanolabsolute Isoamyl alcohol SigmaCat.I-3643 Phenol Phosphate Buffered Saline (PBS)1X Protei ...

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Simple Miniprep DNA Preparation

SNGENIMHNIH http://intramural.nimh.nih.gov/lcmr/snge/Protocols/Miniprep.html SOLUTIONS: •Resuspension buffer: 25mM Tris-HCl (ph8) 50mM Na2 EDTA 1% glucose Autoclave and store at 4℃. •NaOH/ ...

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RNA/Zeta Probe Dot Blotting protocol

RNA/Zeta Probe Dot Blotting protocol 1)Make up RNA (up to 20μg)dissolved in sterile H2 OTE or 0.5% SDS to 500μl with ice-cold sterile 10mM NaOH1mM EDTA and apply it to Zeta Probe membraneheld in ...

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内切酶在反应中的存活性

长时间反应时内切酶的活性保持情况因酶而异。本表中列出了在16小时内完全酶解底物DNA所需的最小酶量。 实验方法:在50µl的反应体系中,分别加入1µg的单位定义底物DNA和1.00、0.50、0.25和0.13个单位的内切酶,37℃(或要求的最适温度)反应16小时。用琼脂糖凝胶电泳法来确定在16小时内酶解1µg底物DNA所需的最小酶量。 16小时酶 ...

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Genomic Southern Blot

Solutions Protocol: Digest 5-10 μg genomic DNA overnight with restriction enzyme of choice. Run digested gDNA on 0.8% TAE gel with marker (with no ethidium bromide). Transfer Setup: 1. Remove gel ...

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细菌总DNA的提取和鉴定

【目的和要求】 1.学会CTAB法提取细菌总DNA。 2.掌握DNA的琼脂糖凝胶电泳法。 【实验原理】 DNA在生物体内是与蛋白质形成复合物的形式存在的,因此提取出脱氧核糖核蛋白复合物后,必须将其中蛋白质去除。CTAB(溴代十六烷基三甲胺)是一种去污剂,它能与核酸形成复合物,在高盐溶液中可溶并且稳定存在,若降低盐浓度,CTAB与核酸的复合物会沉淀出来,而大部分蛋白和多糖仍溶于溶液中。 DNA的电泳 ...

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