• 我要登录|
  • 免费注册
    |
  • 我的丁香通
    • 企业机构:
    • 成为企业机构
    • 个人用户:
    • 个人中心
  • 移动端
    移动端
丁香通 logo丁香实验_LOGO
搜实验

    大家都在搜

      大家都在搜

        0 人通过求购买到了急需的产品
        免费发布求购
        发布求购
        点赞
        收藏
        wx-share
        分享

        按大小分离RNA:在含有甲醛的琼脂糖凝胶上进行的RNA的电泳

        相关实验:依据大小分离RNA

        最新修订时间:

        原理

        RNA 样品经甲酰胺处理以及经含有甲醛的凝胶电泳分离可能会发生变性,这一方法是从 Lehrachetal. (1977), Goldberg (1980),Seed (1982a)和 Rosen et al, (1990) 修改而来。RNA 在含有 2.2 mol/L 甲醛的凝胶上电泳分离。

        材料与仪器

        步骤

        一、材料

        1. 缓冲液与溶液

        溴化乙锭(200 μg/ml)

        甲醛

        甲酰胺

        10X 甲醛凝胶电泳加样缓冲液

        10X MOPS 电泳缓冲液

        2. 凝胶

        含有 2.2 mol/L 甲醛的琼脂搪凝胶

        3. 核酸和寡核苷酸

        RNA 样品

        RNA 大小参照物

        4. 专用设备

        水平电泳仪

        透明直尺

        55℃ 水浴

        二、方法

        1. 在一灭菌的微量离心管建立变性反应

        RNA(多达 20 μg)          2.0 μl

        10X MOPS 电泳缓冲液     2.0 μl

        甲醛                                4.0 μl

        甲酰胺                            10.0 μl

        溴化乙锭(200 μg/ml)    1.0 μl

        2. 盖紧微量离心管的盖子,于 55℃ 温育 RNA 液体 60 min,在冰水中冷却样品 10 min,然后离心 5s 并将所有的液体在微量离心管的底部沉淀。

        3. 加 2 μl 10X 甲醛凝胶加样缓冲液并将试管重新置于冰上。

        4. 将琼脂糖/甲醛凝胶装入水平电泳槽中,加入足够 1X MOPS 电泳缓冲液覆盖凝胶约 1 mm。电泳 5 min ( 5 V/cm)。加 RNA 样品到凝胶加样孔中,将空胶两侧的两条最外侧的泳道留下,加样 RNA 标准大小参照物。

        5. 凝胶浸入 1X MOPS 电泳缓冲液中,4~5 V/cm 电压下进行电泳,直到溴酚蓝移出约 8 cm ( 4~5 h)。电泳时用较高电压会导致条带模糊不清。因为电泳缓冲液的 pH 值在电泳过程中会发生变化,装好电泳槽,缓冲液通过蠕动泵不断从一个室到另一个室。每隔一个小时更换一次缓冲液。

        6. 将凝胶放置于一片 Saran 膜上在紫外线透射仪上观察 RNA 将染色凝胶和紫外线透射的照片用透明的直尺对比。

        7. 照像并测量照片上每个 RNA 条带至加样孔的距离,以 RNA 片段大小的对数值对 RNA 条带的适移距离作图,用所得曲线计算从凝胶转移到固相支持体后通过杂交计算出 RNA 分子的大小。

        8. 通过上或下毛细管转移固相化的 RNA 到固相支持物上。

        来源:丁香实验

        ad image
        提问
        扫一扫
        丁香实验小程序二维码
        实验小助手
        丁香实验公众号二维码
        扫码领资料
        反馈
        TOP
        打开小程序