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        从石蜡包埋固定的组织中制备 RNA 实验

        相关实验:从石蜡包埋固定的组织中制备 RNA 实验

        最新修订时间:

        材料与仪器

        步骤

        一、材料

        1. 缓冲液、溶液和试剂

        去离子化的甲酰胺

        焦碳酸二乙酯(DEPC) 处理过的水

        消化缓冲液(lmol/L 异硫氰酸胍,25 mmol/Lβ-巯基乙醇,0.5%N-月桂酰肌氨酸,20 mmol/LTris-HCl,pH7.5)

        乙醇,100% 和 70%

        肝糖

        异丙醇

        苯酚 (pH4.3): 氯仿(70%:30%)

        蛋白酶 K(60 mg/ml,20U/mg)

        Trizol(Invitrogen)

        二甲苯

        2. 特殊设备

        微量离心管,2 ml, 无 RNA 酶

        恒温箱,预调至 37°C

        水浴或恒温箱,预调至 55°C

        3. 细胞和组织

        石蜡包埋的组织样品,切割为 5~50 张 5um 厚的切片

        二、方法

        1. 将组织块置于 2.0 ml 微量离心管中,向样品中加 1.8 ml 二甲苯。37°C 温育 20 min。

        2. 稍微地离心样品,移弃上清液再加入二甲苯,重复温育和离心步骤。

        3. 用 0.5 ml 乙酵洗涤组织。移弃乙醇,风干。

        4. 加 80ul 蛋白酶 K(60 mg/ml,20U/mg) 和 72ul 消化缓冲液。55°C 下振荡温育过夜。

        5. 再次加 80ul 蛋白酶 K,55°C 下振荡温育过夜。次日再次加 80ul 蛋白酶 K, 再次 55°C下振荡温育过夜。

        6. 加等体积酚:氯仿,混合,在微量离心机中以最大转速离心 5 min。将液相转移到RNA 酶的新管中。

        7. 加等体积异丙醇和 2ug 肝糖,-20°C 放置 30 min。

        8. 在微董离心机中以最大转速离心 30 min。移弃上清液,用 70% 乙酵洗涤沉降物。

        9. 在微量离心机中以最大转速离心 30 min 并移弃上清液。风干沉降物,将之再溶解20ulDEPC 处理过的水中。加 500ulTrizol。遵循 Trizol 方案(见本章方案 3),对一处做修改:在第一次 Trizol 处理后,将液相转移到无 RNA 酶的新管中,用 500ulTrizol 第二次处理样品。

        10. 向第二次 Trizol 处理过的液相加 500ul 异丙醇以沉淀 RNA。

        11. 将 RNA 沉降物再溶解于 20ul 去离子甲酰胺中。-20°C 储存 RNA。

        来源:丁香实验

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