RNA 实验

同时检测包含成百上千种基因的 RNA 水平，从而构建一个详细的基因表达谱是分子生物学新的一项激动人心的本领。这是通过将 mRNA 定量扩增并用生物素标记再与 DNA 芯片杂交实现的，芯片上预先固定有与目的 mRNA 互补的寡核苷酸序列。来源：《精编分子生物学实验指南 第五版 第二十一章》

尽管从其他细胞也可以制备染色体，但人类外周血白细胞是最容易同步化的，从而可以对其染色体进行高分辨分析。

前接体是真核细胞核内剪接 mRNA 前体的大分子核糖核蛋白复合体，它由 5 种 snRNP 和大量的非 snRNP 蛋白组成，每一种 snRNP 由一个 snRNA 和几种蛋白质构成。本实验来源「RNA 实验指导手册」主编：郑晓飞。

剪接体是由 RNA 和蛋白质构成的核糖核蛋白体（RNP)，它在前体 mRNA 的剪接过程中可去除前体 mRNA 的内含子。snRNP 是由 snRNA 及其结合蛋白组成，在前体 mRNA 的剪接过程起着重要作用。本实验来源「RNA 实验指导手册」主编：郑晓飞。

剪接反应的典型做法是使用核提取物，即 S100 提取物补充 SR 蛋白或粗提取物的部分纯化组分，最常使用的是 HeLa 细胞的提取物。前体 mRNA 底物通常采用噬菌体聚合酶体外转录的方法来制备。本实验来源「RNA 实验指导手册」主编：郑晓飞。

在核内，RNA 聚合酶 Ⅱ 的转录产物同大量不同类型的核前体 mRNA/mRNA 结合蛋白，不均一核糖核蛋白（heterogeneous nuclear ribonucUoprotein，hnRNP) 结合形成 hnRNP 复合物。本实验来源「RNA 实验指导手册」主编：郑晓飞。

本实验来源「RNA 实验指导手册」主编：郑晓飞。

RNA 免疫沉淀-随机聚合链反应方法可用来鉴定细胞内 RNP 复合物中的 RNA 组分。本实验来源「RNA 实验指导手册」主编：郑晓飞。

随着体外分子实验技术的发展，近年来相继发现了许多具有不同催化功能的 DNA 分子，这些被称为脱氧核酶的催化型 DNA 分子可以催化切割反应、连接反应、卟啉环金属化等许多化学反应，而且还具有 DNA 激酶活性。本实验来源「RNA 实验指导手册」主编：郑晓飞。

核酶（ribozyme ) 是一类具有酶特性的 RNA 分子，通过催化靶位点 RNA 链中磷酸二酯键的断裂，特异性地剪切底物 RNA 分子，从而阻断基因的表达。核酶广泛存在于从低等到高等的多种生物中，参细胞内 RNA 及其前体的加工和成熟过程。本实验来源「RNA 实验指导手册」主编：郑晓飞。

亚甲基蓝介导的光交联反应是对紫外交联反应的一个补充。亚甲基蓝属于酚噻嗪类染料。由于其环结构，亚甲基蓝可以在较低的浓度同核酸结合，插入碱基。浓度较高时，亚甲基蓝带阳离子，可以与磷酸二酯骨架通过静电力结合。本实验来源「RNA 实验指导手册」主编：郑晓飞。

将 RNA 保存于甲酰胺中比储存于水中或乙醇中有更多好处：（1）甲酰胺将保护 RNA 不受 RNA 酶的降解，以这种方式保存的 RNA 是相当稳定的，可以在 4℃ 保存过夜，或在一 20°C 保存相当长的一段时间。样品甚至可以置于室温过夜而不用担心其降解；（2）样品可被高度浓缩，其终浓度甚至可以达到 4 mg/ml；（3）由于有了高度浓缩的 RNA 样品，在进行反转录实验时效率提高。

用磁性微球代转纤维索作为介质，这种方法比较常用且已商品化。

大多数哺乳动物的信使 RNA( mRNA) 都带冇 poly( A)+ 尾 ，使用本方案可以将带Poly ( A) +的 RNA 从总 RNA 中分离出來。

动物组织和细胞是分子生物学研究中最常用的实验材料，一个典型的哺乳动物细胞约含 105 ug RNA, 其中主要是 rRNA、tRNA 等核内小分子 RNA，以及少董的 mRNA。一般的实验只需要提取组织或细胞的总 RNA，但是对一些有特殊要求的实验就需要从总 RNA 中分离出特定的 RNA 组分。本节主要介绍了从动物组织，细胞和标本中提取总 RNA、rRNA 和 mRNA 的常用方法。

甲苯胺蓝是常用的人工合成染料的一种，属于醌亚胺染料类，这类染料一般含有两个发色团，一个是胺基，一个是醌型苯环，来构成色原显色。染料除有发色团外，还要有能使色原对组织及其他被染物产生亲和力的原子团即助色。

这种染色方法的基础是组织结构对不同染料的结合程度不同。染料苏木精可以将嗜碱性结构染成蓝紫色，而伊红可以将嗜酸性结构染成粉红色。嗜碱性结构通常包括含有核酸的部分，如核糖体、细胞核及细胞质中富含核糖核酸（RNA）的区域等。

对细胞的染色可以（1）让细胞着色便于观察；（2）对凋亡细胞的检测。

细胞RNA的原位杂交实验用于在混杂的细胞群体和组织中、定位特异的mRNA在细胞中的存在位置。冰冻切片（frozen section）是一种在低温条件下使组织快速冷却到一定硬度，然后进行切片的方法。因其制作过程较石蜡切片快捷、简便，而多应用于手术中的快速病理诊断。