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        rep-PCR

        实验分类:

        PCR 技术

        最新修订时间:

        简介

        rep-PCR,是基于在原核与真核生物基因组中分布着特异保守的重复序列,这些序列一般包括重复性基因外回文序列 (repetitive extragenic palindromic, REP),肠杆菌重复性基因间共有序列 (enterobacterial repetitive intergenic consensus,ERIC)和 BOX 元件,但是如今这个概念也扩大了,它涵盖了所有用重复性 DNA 序列作引物进行 PCR 基因组指纹图谱的技术。


        目前,用于 rep-PCR 的方法主要有 1 种:rep-PCR。

        原理

        rep-PCR 的基本原理:

        rep-PCR 指的是一种方法体系,它包括用基因组中广泛存在的重复序列作引物以基因组 DNA 为模板进行 PCR 扩增的方法。这些重复序列在所有原核生物染色体中随机存在。原核细菌中的三个保守序列,一为 38 bp 重复的基因外回文结构元件 REP,另一为 126 bp 的肠杆菌重复性的基因间共有序列 ERIC,再有就是 56 bp 的 BOX 元件,它们在肠杆菌属菌株中尤其表现出序列保守性。这三个序列主要存在于革兰阴性菌中,但在真菌及古细菌中也发现了类似的重复序列的存在。

        应用

        rep-PCR 的常用应用领域如下:

        (一)临床致病株

        (二)遗传突变的细菌致病种群的分析和分类

        (三)细菌分型

        (四)微生物间亲缘关系的确定

        (五)扩增未知 DNA 序列

        来源:丁香实验团队

        操作方法

        rep-PCR

        rep-PCR 的应用范围限于含有 REP、BOX 和 ERIC 序列(或相似序列)的细菌,但有些缺乏这些序列的菌种中会包含类似的重复性序列,就像不同的 DNA 序列信息存在于不同的微生物系统一样,新的重复性序列将会被发现,而且从整个生物界的角度来看在自然选择压力下,必然导致在几乎所有生物中都存在保守和重复序列,因此 rep-PCR 作为一种技术思路对微观和宏观的生物研究都有启发。rep-PCR

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