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DNA 污染的洗脱后去除实验
下述方案是 Dilworth 和 Huang 方案的修改(DilworthandMcCarey1992;Huangetal.2000)。它可以用于从大多数商用试剂盒和试剂制备的 RNA 中去除 DNA 污染。本实验来源于 PCR 实验指南(第二版),作者:种康,瞿礼嘉。
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利用 Ambion 的 MicroPoly(A)Pure 试剂盒分离 mRNA 实验
本实验利用 Ambion 的 MicroPoly(A)Pure 试剂盒分离 mRNA 。本实验来源于 PCR 实验指南(第二版),作者:种康,瞿礼嘉。
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利用 Marligen 总 RNA 快速纯化系统纯化总 RNA 实验
由 Marligen Biosciences 提供的 Rapid Total RNA System 可从各种样品中提取 RNA,且产量和质量非常稳定。本实验来源于 PCR 实验指南(第二版),作者:种康,瞿礼嘉。
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利用 ConcertPlant 试剂从植物组织中纯化 RNA 实验
以下概述的是 ConcertPlant 试剂(Invitrogen) 所附带的方案。该方案不是以酚为基础的,但需要加氯仿。该试剂用于多种植物的组织中分离 RNA, 包括蓝叶云杉针、马铃薯块茎、玉米种子和棉花叶。本实验来源于 PCR 实验指南(第二版),作者:种康,瞿礼嘉。
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利用 Trizol 从植物组织中制备 RNA 实验
下述方案是经修改过的 Trizol 方案,用于从植物组织中分离 RNA,其中增加了一个高盐异丙酵沉淀步骤,以选择性地沉淀 RNA,而将多聚糖和蛋白多糖留在溶液里。本实验来源于 PCR 实验指南(第二版),作者:种康,瞿礼嘉。
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使用 Trizol 纯化 RNA 实验
RNA 分离的酚基试剂的生产以 Chomczynski 方案为基础。这些方案在从富含 RNA 酶的组织如胰腺中获取 RNA 时最有用。这里介绍的是随 Invitrogen 的 Trizol 试剂出售的方案的摘要,经 Invitrogen 允许做了修改。本实验来源于 PCR 实验指南(第二版),作者:种康,瞿礼嘉。
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从石蜡包埋固定的组织中制备 RNA 实验
该方案是由 Godfrey 等改进 Fisher 的方案发表的。此前已有从固定组织中纯化 RNA 的方案发表。Ambion 和 Roche 发明了从石蜡包埋的组织中纯化 RNA 的商品化试剂盒。本实验来源于 PCR 实验指南(第二版),作者:种康,瞿礼嘉。
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异硫氰酸胍/氯化铯超速离心法制备 RNA 实验
这种方法源自于对 Chirgwin 等(1979) 所拟方案的修改。对 Chirgwin 等所规定的试剂,许多试剂盒中常用,且用于分离和纯化 RNA 的试剂也是常见的。本实验来源于 PCR 实验指南(第二版),作者:种康,瞿礼嘉。
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染色末端的清洁纯化实验
利用 ABIPRISMRigDye 末端化学法进行自动荧光测序是高效率 DN 八序列测定的方法之一。序列梯度是由标准的 Sanger 方法利用荧光标记链末端的核苷而产生的。本实验来源于 PCR 实验指南(第二版),作者:种康,瞿礼嘉。
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以磁性顆粒为基础纯化 PCR 产物实验
MagneSil 是一种顺磁性硅质顆粒,能够充当可移动的固相物质而用于捕获双链 DNA 片段。通过洗涤黏附于硅质顆粒上的靶复合物来去除残留污染,从而纯化的目的 DNA。本实验来源于 PCR 实验指南(第二版),作者:种康,瞿礼嘉。
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以硅膜为基础纯化 PCR 产物实验方法
Wizard SV96 PCR 纯化系统提供了一个以膜为基础,用于从 96 孔板中进行高产率 PCR纯化的方法。本实验来源于 PCR 实验指南(第二版),作者:种康,瞿礼嘉。
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从琼脂糖凝胶中纯化 PCR 片段实验
Wizard SV 胶和 PCR 纯化系统是利用硅基法从琼脂糖凝胶中或从 PCR 扩增反应混合物中直接纯化 PCR 片段的方法。本实验来源于 PCR 实验指南(第二版),作者:种康,瞿礼嘉。
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以磁珠为基础分离基因组 DNA 的实验方法
Wizard Magne Sil 基因组 DNA 纯化系统是使用一种固相顺磁性硅质顆粒来纯化基因组 DNA。该技术取代了以真空过滤和离心为基础的 DNA 纯化形式,而且还使样本处理更加经济、高效。本实验来源于 PCR 实验指南(第二版),作者:种康,瞿礼嘉。
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以硅膜为基础分离基因组 DNA 实验
硅化学法已成为从小鼠尾剪取物、动物组织和组织培养细胞等样品中纯化高质量基因组 DNA 的方法之一。Wizard SV 基因组 DNA 纯化体系是利用一个充有固相硅的滤膜来纯化 基因组 DNA 的。本实验来源于 PCR 实验指南(第二版),作者:种康,瞿礼嘉。
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从全血中纯化基因组 DNA 实验方法
用于从全血(10 ml) 中分离基因组 DNA 的 Wizard 基因组 DNA 纯化试剂盒建立在一个四步程序基础上的。纯化程序的第一步包括血红细胞的裂解、可溶部分的弃除,随后是白细胞及其细胞核的裂解。本实验来源于 PCR 实验指南(第二版),作者:种康,瞿礼嘉。
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纯化测序反应产物实验
电泳之前纯化测序反应产物以去除多余的、尚未结合的染料终止子是非常必要的。离心柱可以是快速、有效地去除未结合的染料终止子。本实验来源于 PCR 实验指南(第二版),作者:种康,瞿礼嘉。
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测序反应实验
要得到合适的信号强度,可根据 DNA 片段的大小调节 DNA 的用量。适用于 ABI PRISM Big Dye Terminator Ready Reaction mix(Applied Biosystems) 和 GeneAmp PCR System9700(Applied Biosystems) 热循环仪。本实验来源于 PCR 实验指南(第二版),作者:种康,瞿礼嘉。
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PCR 产物定量实验
测序之前对模板精确定量至关重要。根据 DNA 用量的多少,有几种不同的方法可供选择。下面介绍另外两种方法:荧光测定法和比较溴化物染色法。本实验来源于 PCR 实验指南(第二版),作者:种康,瞿礼嘉。
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PCR 产物纯化实验
介绍一个采用 AmiconMicrocon-PCR 滤件(Millipore) 的方法,有效地去除冗余dNTP 和引物的方法纯化 PCR 产物。本实验来源于 PCR 实验指南(第二版),作者:种康,瞿礼嘉。
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大片段的精确扩增实验
用 10 对不同的引物扩增约 5kb 的片段,模板 DNA 是一样的,反应体系是 50ul, 对照中未加模板,含有单一引物。对于循环数较多(25〜40) 的反应,一般应设置一个没有模板或单引物对照。本实验来源于 PCR 实验指南(第二版),作者:种康,瞿礼嘉。
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