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Combined 3C-ChIP-Cloning (6C) Assay: A Tool to Unravel Protein-Mediated Genome Architecture

interest in chromatin long-range interactions. RELATED INFORMATION The 6C assay combines three different methodologies: chromosome conformation capture (3C) (Dekker et al. 2002), chromatin immunoprecipitation (ChIP), and cloning (Fig. 1 ). The first step

做好 ChIP 的四个注意事项

基因 [例如 Ezh2] 的结合）就可能会低于检测阈值。 相比之下，酶消化方法使用微球菌核酸酶切入染色质核小体之间的连接区域，柔和地把染色质剪切成均一片段。酶消化无需高热或去污剂，且如果使用与细胞数量成比例的酶用量，还可得到一致的结果。因此，酶消化方法更易于控制，可避免抗原表位和 DNA 被剪切或变性，且得到的一致、高品质的染色质样品还有利于免疫沉淀。 下方显示的实验分别使用 SimpleChIP® Plus Enzymatic Chromatin IP Kit (Magnetic

ChIP‐chip for Genome‐Wide Analysis of Protein Binding in Mammalian Cells

Abstract Table of Contents Materials Figures Literature Cited Abstract   ChIP?chip combines